ID

45652

Descrição

Principal Investigator: Richard A. Young, Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA and Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA MeSH: Precursor T-Cell Lymphoblastic Leukemia-Lymphoma https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001242 ChIP-Seq data from 102 cell lines were processed to identify insertions relative to the human reference genome. To confirm the ability of a computational pipeline to identify insertions that are actually present in these genomes, we PCR-amplified and deeply sequenced regions where insertions were predicted to exist in MOLT4 T-cell acute lymphoblastic leukemia cells. The current study release makes available sequences of amplicons from a tumor cell genome (MOLT4) where a computational pipeline predicted small insertions from orthogonal data.

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dbGaP study = phs001242

Palavras-chave

  1. 21/03/2023 21/03/2023 - Simon Heim
Titular dos direitos

Richard A. Young, Whitehead Institute for Biomedical Research, Cambridge, MA and Massachusetts Institute of Technology, Cambridge, MA, USA

Transferido a

21 de março de 2023

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dbGaP phs001242 Small genomic insertions form enhancers that misregulate oncogenes

Subject - Consent Information

pht006071
Descrição

pht006071

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
Sample ID
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SUBJECT_ID

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
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CONSENT

Tipo de dados

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Alias
UMLS CUI [1,1]
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Description | Question | Decode (Coded Value)
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C0021430 (UMLS CUI [1,1])
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CL Item
General Research Use (GRU) (1)
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