ID

45543

Beskrivning

Disclaimer: Der „GECCO - German Corona Consensus - Covid-19 Research-Dataset“ Inhalt, der auf dem Portal für medizinische Datenmodelle (MDM Portal) zu finden ist, ersetzt nicht den GECCO Datensatz auf simplifier.net. Für die Nutzung von GECCO-FHIR-Profilen verwenden Sie bitte die auf https://simplifier.net/ForschungsnetzCovid-19/ verfügbaren Profile. Der FHIR-Download auf MDM erzeugt lediglich eine FHIR-Fragebogenresource. Ziel Überarbeitung August 2021: höhere Kompatibilität mit der NUM-COMPASS-App bzw. der Schnittstelle zur zentralen Datenbank; Zwischenstand, gewisse Module sind noch nicht kompatibel mit der Schnittstelle (u.a. Medikation und Laborwerte; Beatmungstherapie ist aktuell doppelt hinterlegt) This version of the GECCO logical model is based on https://art-decor.org/art-decor/decor-datasets--covid19f-, and the implementation for REDCap by the University of Tübingen (3.3.2021), partially updated with https://simplifier.net/guide/GermanCoronaConsensusDataSet-ImplementationGuide/Home information. For actual use of FHIR profiles, please use the actual profiles available on https://simplifier.net/ForschungsnetzCovid-19/ResearchDatasetGECCO/~overview (FHIR download on MDM is only a FHIR questionnaire resource). This version is not compatible with the REDCap to FHIR GECCO converter of the University of Tübingen. It aims at a higher compatibility with the app generated for the NUM-COMPASS project (conversion to COMPASS-compatible FHIR questionnaire necessary) and from there with the central platform of the NUM-CODEX project. A few modules are not yet compatible (e.g. Medication and lab values; ventilation is currently double). Official German text from http://cocos.team/datasets.html: Zur Bewältigung der aktuellen Pandemie und der damit einhergehenden Behandlung von Patienten fördert das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) ein nationales Netzwerk der Universitätsmedizin im Kampf gegen COVID-19. Unter anderem soll das Netzwerk die Daten der behandelten COVID-19 Patienten systematisch erfassen und bündeln. Die Forschenden sollen die Behandlung der COVID-19-Patienten standardisiert erheben, verfolgen und analysieren. Die hohe Bedrohungslage hat zu intensiver wissenschaftlicher Aktivität zu COVID-19 geführt, wozu zahlreiche regionale, nationale und internationale epidemiologische Erhebungen und Registerstudien zählen. Der Konsensusdatensatz gibt der Wissenschaft um COVID-19 eine gemeinsame Sprache und Arbeitsgrundlage. Inofficial translation: In order to cope with the current pandemic and the associated treatment of patients, the Federal Ministry of Education and Research (BMBF) is funding a national network of university medicine in the fight against COVID-19. Among other things, the network will systematically collect and bundle the data of the treated COVID-19 patients. The researchers are to collect, track and analyze the treatment of COVID-19 patients in a standardized way. The high threat level has led to intensive scientific activity on COVID-19, including numerous regional, national and international epidemiological surveys and register studies. The consensus data set provides a common language and working basis for the science around COVID-19.

Länk

https://simplifier.net/ForschungsnetzCovid-19/

Nyckelord

Versioner (11)
  1. 29/9/20 29/9/20 - Sarah Riepenhausen
  2. 29/9/20 29/9/20 - Sarah Riepenhausen
  3. 9/10/20 9/10/20 -
  4. 28/10/20 28/10/20 -
  5. 13/1/21 13/1/21 - Sarah Riepenhausen
  6. 3/2/21 3/2/21 - Sarah Riepenhausen
  7. 3/2/21 3/2/21 - Sarah Riepenhausen
  8. 25/8/21 25/8/21 - Sarah Riepenhausen
  9. 2/9/21 2/9/21 - Sarah Riepenhausen
  10. 6/9/21 6/9/21 - Sarah Riepenhausen
  11. 5/1/23 5/1/23 - Sarah Riepenhausen
Rättsinnehavare

Nationales Forschungsnetzwerk der Universitätsmedizin zu Covid-19

Uppladdad den

5 de enero de 2023

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Creative Commons BY 4.0
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    GECCO - German Corona Consensus - Covid-19 Research-Dataset

    Tysk

    Vitalparameter

    13 Formulär  
    Vitalparameter
    Beskrivning

    Vitalparameter

    Alias
    UMLS CUI-1
    C0518766
    Datum der Vitalparameter
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    datetime

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0518766
    UMLS CUI [1,2]
    C0011008
    Kohlendioxidpartialdruck
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    float

    Måttenheter
    • mm[Hg]
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C1822070
    LOINC[1]
    2019-8
    LOINC[2]
    11557-6
    LOINC[3]
    2020-6
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.pacCO2
    mm[Hg]
    Sauerstoffpartialdruck
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    float

    Måttenheter
    • mm[Hg]
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0391840
    LOINC[1]
    2703-7
    LOINC[2]
    11556-8
    LOINC[3]
    2704-5
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.paO2
    mm[Hg]
    FiO2
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation Synonyme: fraction of inspired oxygen; inspiratorische Sauerstofffraktion GECCO

    Datatyp

    float

    Måttenheter
    • %
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0428167
    SNOMED CT[1]
    250774007
    LOINC[1]
    3150-0
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.FiO2
    %
    pH-Wert
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    float

    Måttenheter
    • [pH]
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0202165
    LOINC[1]
    2753-2
    LOINC[2]
    2746-6
    LOINC[3]
    2745-8
    LOINC[4]
    2744-1
    LOINC[5]
    19213-8
    LOINC[6]
    11558-4
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.pH
    [pH]
    Atemfrequenz
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    integer

    Måttenheter
    • {breaths}/min
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0231832
    SNOMED CT[1]
    86290005
    LOINC[1]
    9279-1
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.respiratoryRate
    {breaths}/min
    Blutdruck diastolisch
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    integer

    Måttenheter
    • mm[Hg]
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0428883
    SNOMED CT[1]
    271650006
    LOINC[1]
    8462-4
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.diastolicBloodPressure
    mm[Hg]
    Blutdruck systolisch
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    integer

    Måttenheter
    • mm[Hg]
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0871470
    SNOMED CT[1]
    271649006
    LOINC[1]
    8480-6
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.systolicBloodPressure
    mm[Hg]
    Herzfrequenz
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    integer

    Måttenheter
    • {beats}/min
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0018810
    SNOMED CT[1]
    364075005
    LOINC[1]
    8867-4
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.heartRate
    {beats}/min
    Körpertemperatur
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    float

    Måttenheter
    • Cel
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0005903
    SNOMED CT[1]
    386725007
    LOINC[1]
    8310-5
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.bodyTemperature
    Cel
    Periphere Sauerstoffsättigung
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation GECCO

    Datatyp

    float

    Måttenheter
    • %
    Alias
    UMLS CUI [1]
    C0428179
    SNOMED CT[1]
    431314004
    LOINC[1]
    2708-6
    LOINC[2]
    59408-5
    LOINC[3]
    20564-1
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.peripheralOxygenSaturation
    %
    SOFA-Score
    Beskrivning

    SOFA-Score

    Sepsis-related organ failure assessment score
    Beskrivning

    FHIR-Mapping: Observation = Score über das Ausmaß der Organschädigung bei Intensivpatient*innen. Für die 6 Organsysteme des SOFA-Scores wird jeweils der schlechteste Parameterwert des Tages gewertet. Der Score berechnet sich dann aus der Summe. Für jeden Bestandteil können Punkte von 0-4 erreicht werden, der Gesamtscore kann somit nur zwischen 0 und 24 liegen. GECCO

    Datatyp

    integer

    Alias
    UMLS CUI [1]
    C3494459
    CompassGeccoItem
    vitalSigns.sofaScore
    Atmung: PaO2/FiO2-Ratio (Horovitz-Quotient): Niedrigster Wert.
    Beskrivning

    optional GECCO

    Datatyp

    integer

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3494459
    UMLS CUI [1,2]
    C0035203
    UMLS CUI [2]
    C3897988
    ZNS: Glasgow-Coma-Scale (GCS): Niedrigster Wert.
    Beskrivning

    optional GECCO

    Datatyp

    integer

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3494459
    UMLS CUI [1,2]
    C3714787
    UMLS CUI [2]
    C0017594
    Kardiovaskuläres System: Die höchstmögliche Punktzahl wird gewertet.
    Beskrivning

    MAP (Mittlerer arterieller Druck): Niedrigster Wert. MAP = (SBD + 2x DBD) / 3 . (SBD, systolischer Blutdruck; DBD, diastolischer Blutdruck). Katecholamingabe (Dopamin, Dobutamin, (Nor)adrenalin): Über mindestens 1 Stunde. optional GECCO

    Datatyp

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3494459
    UMLS CUI [1,2]
    C0007226
    UMLS CUI [2]
    C0428886
    Leber: Gesamtbilirubin: Höchster Wert.
    Beskrivning

    optional GECCO

    Datatyp

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0023884
    UMLS CUI [1,2]
    C3494459
    UMLS CUI [2]
    C0201913
    Gerinnungssystem: Thrombozytenzahl: niedrigster Wert
    Beskrivning

    optional GECCO

    Datatyp

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3494459
    UMLS CUI [1,2]
    C0005778
    UMLS CUI [2]
    C0032181
    Niere: Serum-Kreatinin: Höchster Wert. Urinausscheidung: Niedrigster Wert.
    Beskrivning

    optional GECCO

    Datatyp

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3494459
    UMLS CUI [1,2]
    C0022646
    UMLS CUI [2]
    C0201976
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    Similar models

    Vitalparameter

    13 Formulär
    Name
    Typ
    Description | Question | Decode (Coded Value)
    Datatyp
    Alias
    Item Group
    Vitalparameter
    C0518766 (UMLS CUI-1)
    Vital Signs Date
    Item
    Datum der Vitalparameter
    datetime
    C0518766 (UMLS CUI [1,1])
    C0011008 (UMLS CUI [1,2])
    PaCO2
    Item
    Kohlendioxidpartialdruck
    float
    C1822070 (UMLS CUI [1])
    2019-8 (LOINC[1])
    11557-6 (LOINC[2])
    2020-6 (LOINC[3])
    vitalSigns.pacCO2 (CompassGeccoItem)
    PaO2
    Item
    Sauerstoffpartialdruck
    float
    C0391840 (UMLS CUI [1])
    2703-7 (LOINC[1])
    11556-8 (LOINC[2])
    2704-5 (LOINC[3])
    vitalSigns.paO2 (CompassGeccoItem)
    FiO2
    Item
    FiO2
    float
    C0428167 (UMLS CUI [1])
    250774007 (SNOMED CT[1])
    3150-0 (LOINC[1])
    vitalSigns.FiO2 (CompassGeccoItem)
    pH-Wert
    Item
    pH-Wert
    float
    C0202165 (UMLS CUI [1])
    2753-2 (LOINC[1])
    2746-6 (LOINC[2])
    2745-8 (LOINC[3])
    2744-1 (LOINC[4])
    19213-8 (LOINC[5])
    11558-4 (LOINC[6])
    vitalSigns.pH (CompassGeccoItem)
    Atemfrequenz
    Item
    Atemfrequenz
    integer
    C0231832 (UMLS CUI [1])
    86290005 (SNOMED CT[1])
    9279-1 (LOINC[1])
    vitalSigns.respiratoryRate (CompassGeccoItem)
    Blutdruck diastolisch
    Item
    Blutdruck diastolisch
    integer
    C0428883 (UMLS CUI [1])
    271650006 (SNOMED CT[1])
    8462-4 (LOINC[1])
    vitalSigns.diastolicBloodPressure (CompassGeccoItem)
    Blutdruck systolisch
    Item
    Blutdruck systolisch
    integer
    C0871470 (UMLS CUI [1])
    271649006 (SNOMED CT[1])
    8480-6 (LOINC[1])
    vitalSigns.systolicBloodPressure (CompassGeccoItem)
    Herzfrequenz
    Item
    Herzfrequenz
    integer
    C0018810 (UMLS CUI [1])
    364075005 (SNOMED CT[1])
    8867-4 (LOINC[1])
    vitalSigns.heartRate (CompassGeccoItem)
    Körpertemperatur
    Item
    Körpertemperatur
    float
    C0005903 (UMLS CUI [1])
    386725007 (SNOMED CT[1])
    8310-5 (LOINC[1])
    vitalSigns.bodyTemperature (CompassGeccoItem)
    Periphere Sauerstoffsättigung
    Item
    Periphere Sauerstoffsättigung
    float
    C0428179 (UMLS CUI [1])
    431314004 (SNOMED CT[1])
    2708-6 (LOINC[1])
    59408-5 (LOINC[2])
    20564-1 (LOINC[3])
    vitalSigns.peripheralOxygenSaturation (CompassGeccoItem)
    Item Group
    SOFA-Score
    SOFA-Score
    Item
    Sepsis-related organ failure assessment score
    integer
    C3494459 (UMLS CUI [1])
    vitalSigns.sofaScore (CompassGeccoItem)
    Item
    Atmung: PaO2/FiO2-Ratio (Horovitz-Quotient): Niedrigster Wert.
    integer
    C3494459 (UMLS CUI [1,1])
    C0035203 (UMLS CUI [1,2])
    C3897988 (UMLS CUI [2])
    SOFA Atmung
    Code List
    Atmung: PaO2/FiO2-Ratio (Horovitz-Quotient): Niedrigster Wert.
    CL Item
    0: PaO2/FiO2: > 400 mmHg (> 53,2 kPa) (0)
    C3897988 (UMLS CUI-1)
    C0205307 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    1: PaO2/FiO2: 301-400 mmHg (39,9-53,1 kPa) (1)
    C3897988 (UMLS CUI-1)
    C0205161 (UMLS CUI-2)
    C2945599 (UMLS CUI-3)
    CL Item
    2: PaO2/FiO2: 201-300 mmHg (26,6-39,8 kPa) (2)
    C3897988 (UMLS CUI-1)
    C0205161 (UMLS CUI-2)
    C0205081 (UMLS CUI-3)
    CL Item
    3: PaO2/FiO2: 101-200 mmHg (13,3-26,5 kPa) (3)
    C3897988 (UMLS CUI-1)
    C0205161 (UMLS CUI-2)
    C0205082 (UMLS CUI-3)
    CL Item
    4: PaO2/FiO2: ≤100 mmHg (< 13,3 kPa) (4)
    C3897988 (UMLS CUI-1)
    C0205161 (UMLS CUI-2)
    C3641272 (UMLS CUI-3)
    Item
    ZNS: Glasgow-Coma-Scale (GCS): Niedrigster Wert.
    integer
    C3494459 (UMLS CUI [1,1])
    C3714787 (UMLS CUI [1,2])
    C0017594 (UMLS CUI [2])
    SOFA: ZNS
    Code List
    ZNS: Glasgow-Coma-Scale (GCS): Niedrigster Wert.
    CL Item
    0: Glasgow Coma Scale (GCS): 15 (0)
    C0017594 (UMLS CUI-1)
    C0205307 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    1: Glasgow Coma Scale (GCS): 13-14 (1)
    C0017594 (UMLS CUI-1)
    C2945599 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    2: Glasgow Coma Scale (GCS): 10-12 (2)
    C0017594 (UMLS CUI-1)
    C0205081 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    3: Glasgow Coma Scale (GCS): 6-9 (3)
    C0017594 (UMLS CUI-1)
    C0205082 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    4: Glasgow Coma Scale (GCS): ≤ 5 (4)
    C0017594 (UMLS CUI-1)
    C3641272 (UMLS CUI-2)
    Item
    Kardiovaskuläres System: Die höchstmögliche Punktzahl wird gewertet.
    text
    C3494459 (UMLS CUI [1,1])
    C0007226 (UMLS CUI [1,2])
    C0428886 (UMLS CUI [2])
    SOFA: Kardiovaskulär
    Code List
    Kardiovaskuläres System: Die höchstmögliche Punktzahl wird gewertet.
    CL Item
    0: MAP > 70 und keine Vasopressoren (0)
    C0428886 (UMLS CUI-1)
    C0205307 (UMLS CUI-2)
    C0332288 (UMLS CUI-3)
    C0042397 (UMLS CUI-4)
    CL Item
    1: MAP < 70 und keine Vasopressoren (1)
    C0428886 (UMLS CUI-1)
    C0205161 (UMLS CUI-2)
    C0332288 (UMLS CUI-3)
    C0042397 (UMLS CUI-4)
    CL Item
    2: Dopamin ≤5 μg/kg/min oder Dobutamin (jede Dosis) (2)
    C0013030 (UMLS CUI-1)
    C1708745 (UMLS CUI-2)
    C0012963 (UMLS CUI-3)
    CL Item
    3: Dopamin >5 - ≤15 μg/kg/min ODER (Nor)adrenalin ≤0,1 μg/kg/min (3)
    C0013030 (UMLS CUI-1)
    C0205103 (UMLS CUI-2)
    C0028351 (UMLS CUI-3)
    C1708745 (UMLS CUI-4)
    CL Item
    4: Dopamin >15 μg/kg/min ODER (Nor)adrenalin >0,1 μg/kg/min (4)
    C0013030 (UMLS CUI-1)
    C0444956 (UMLS CUI-2)
    C0028351 (UMLS CUI-3)
    C0444956 (UMLS CUI-4)
    Item
    Leber: Gesamtbilirubin: Höchster Wert.
    text
    C0023884 (UMLS CUI [1,1])
    C3494459 (UMLS CUI [1,2])
    C0201913 (UMLS CUI [2])
    SOFA: Leber
    Code List
    Leber: Gesamtbilirubin: Höchster Wert.
    CL Item
    0: Gesamtbilirubin: <1,2 mg/dl (< 20 μmol/l) (0)
    C0201913 (UMLS CUI-1)
    C0205307 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    1: Gesamtbilirubin: 1,2-1,9 mg/dl (20-32 μmol/l) (1)
    C0201913 (UMLS CUI-1)
    C2945599 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    2: Gesamtbilirubin: 2,0-5,9 mg/dl (33-101 μmol/l) (2)
    C0201913 (UMLS CUI-1)
    C0205081 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    3: Gesamtbilirubin: 6,0-11,9 mg/dl (102-204 μmol/l) (3)
    C0201913 (UMLS CUI-1)
    C0205082 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    4: Gesamtbilirubin: ≥12 mg/dl (≥205 μmol/l) (4)
    C0201913 (UMLS CUI-1)
    C3641272 (UMLS CUI-2)
    Item
    Gerinnungssystem: Thrombozytenzahl: niedrigster Wert
    text
    C3494459 (UMLS CUI [1,1])
    C0005778 (UMLS CUI [1,2])
    C0032181 (UMLS CUI [2])
    SOFA: Gerinnung
    Code List
    Gerinnungssystem: Thrombozytenzahl: niedrigster Wert
    CL Item
    0: Thrombozytenzahl: >150 x 10^3/μl (0)
    C0032181 (UMLS CUI-1)
    C0205307 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    1: Thrombozytenzahl: 100-149 x10^3/μl (1)
    C0032181 (UMLS CUI-1)
    C2945599 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    2: Thrombozytenzahl: 50-99 x 10^3/μl (2)
    C0032181 (UMLS CUI-1)
    C0205081 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    3: Thrombozytenzahl: 20-49 x 10^3/μl (3)
    C0032181 (UMLS CUI-1)
    C0205082 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    4: Thrombozytenzahl: <20 x 10^3/μl (4)
    C0032181 (UMLS CUI-1)
    C3641272 (UMLS CUI-2)
    Item
    Niere: Serum-Kreatinin: Höchster Wert. Urinausscheidung: Niedrigster Wert.
    text
    C3494459 (UMLS CUI [1,1])
    C0022646 (UMLS CUI [1,2])
    C0201976 (UMLS CUI [2])
    SOFA: Niere
    Code List
    Niere: Serum-Kreatinin: Höchster Wert. Urinausscheidung: Niedrigster Wert.
    CL Item
    0: Serum-Kreatinin und Urinausscheidung: <1,2 mg/dl (<110 μmol/l) (0)
    C0201976 (UMLS CUI-1)
    C0205307 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    1: Serum-Kreatinin und Urinausscheidung: 1,2-1,9 mg/dl (110 -170 μmol/l) (1)
    C0201976 (UMLS CUI-1)
    C2945599 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    2: Serum-Kreatinin und Urinausscheidung: 2,0-3,4 mg/dl (171- 299 μmol/l) (2)
    C0201976 (UMLS CUI-1)
    C0205081 (UMLS CUI-2)
    CL Item
    3: Serum-Kreatinin und Urinausscheidung: 3,5-4,9 mg/dl (300-440 μmol/l) ODER Harnausscheidung <500 ml/24h (3)
    C0201976 (UMLS CUI-1)
    C0205082 (UMLS CUI-2)
    C1287298 (UMLS CUI-3)
    C0205216 (UMLS CUI-4)
    CL Item
    4: Serum-Kreatinin und Urinausscheidung: ≥5,0 mg/dl (≥ 441 μmol/l) ODER Harnausscheidung <200 ml/24h (4)
    C0201976 (UMLS CUI-1)
    C3641272 (UMLS CUI-2)
    C1287298 (UMLS CUI-3)
    C0205216 (UMLS CUI-4)
    C0205082 (UMLS CUI-5)
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