ID

45506

Descrizione

Principal Investigator: Matthew Meyerson, MD, PhD, Broad Institute, Cambridge MA, Dana Farber Cancer Institute, Boston MA, USA MeSH: Carcinoma, Non-Small-Cell Lung https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000488 Lung carcinoma is the leading cause of cancer death in the United States and world-wide; lung adenocarcinoma is the most common cause of lung cancer. Pilot studies of lung adenocarcinoma with hybrid-capture based whole exome sequencing will enable us to identify new targets for therapy and improve diagnosis. We will analyze a blend of whole exome and whole genome sequencing data as well as copy number and somatic mutation calls for 200 tumor and matched normal controls. When completed this study will represent the most comprehensive lung adenocarcinoma genome dataset to date.

collegamento

dbGap study = phs000488

Keywords

  1. 09/11/22 09/11/22 - Dr. med. Lucy Kessler
  2. 13/12/22 13/12/22 - Kristina Keller
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Matthew Meyerson, MD, PhD, Broad Institute, Cambridge MA, Dana Farber Cancer Institute, Boston MA, USA

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13 dicembre 2022

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dbGaP phs000488 Genomic Sequencing of Lung Adenocarcinoma

Sample ID, subject ID, and sample use variables obtained from participants with lung adenocarcinoma and involved in the "Genomic Sequencing of Lung Adenocarcinoma" project.

pht002910
Descrizione

pht002910

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0370003
UMLS CUI [1,2]
C0600091
UMLS CUI [2,1]
C0200345
UMLS CUI [2,2]
C0457083
Subject ID
Descrizione

SUBJECT_ID

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2348584
Sample ID
Descrizione

SAMPLE_ID

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1299222
Sample use. Array_SNP: SNP genotypes obtained using standard or custom microarrays; Seq_DNA_WholeExome: Whole exome sequencing; Seq_DNA_WholeGenome: Whole genome sequencing
Descrizione

SAMPLE_USE

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0370003
UMLS CUI [1,2]
C4027253
UMLS CUI [1,3]
C0022885

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Sample ID, subject ID, and sample use variables obtained from participants with lung adenocarcinoma and involved in the "Genomic Sequencing of Lung Adenocarcinoma" project.

Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
pht002910
C0370003 (UMLS CUI [1,1])
C0600091 (UMLS CUI [1,2])
C0200345 (UMLS CUI [2,1])
C0457083 (UMLS CUI [2,2])
SUBJECT_ID
Item
Subject ID
string
C2348584 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
Sample ID
string
C1299222 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_USE
Item
Sample use. Array_SNP: SNP genotypes obtained using standard or custom microarrays; Seq_DNA_WholeExome: Whole exome sequencing; Seq_DNA_WholeGenome: Whole genome sequencing
text
C0370003 (UMLS CUI [1,1])
C4027253 (UMLS CUI [1,2])
C0022885 (UMLS CUI [1,3])

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