ID

41400

Beschreibung

This version of the GECCO dataset is mainly based on https://art-decor.org/art-decor/decor-datasets--covid19f- on the "final" version published mid to end September 2020. A few items implicated by comments/descriptions of items on art-decor have been added: "Datum der letzten Impfung" (date of last vaccination for all listed vaccinations), "Schweregrad" (Severity of Kidney Diseases), "Ort" (Location of vacation in the last 14 days), "Befund bildgebender Verfahren im Rahmen von COVID-19" added separately for all types of imaging procedures listed, "Symptom Schweregrad" (Severity of Symptoms) for each symptom listed, and an "NCT-/EudraCT-Nummer" item for Study participation. Official German text from http://cocos.team/datasets.html: Zur Bewältigung der aktuellen Pandemie und der damit einhergehenden Behandlung von Patienten fördert das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) ein nationales Netzwerk der Universitätsmedizin im Kampf gegen COVID-19. Unter anderem soll das Netzwerk die Daten der behandelten COVID-19 Patienten systematisch erfassen und bündeln. Die Forschenden sollen die Behandlung der COVID-19-Patienten standardisiert erheben, verfolgen und analysieren. Die hohe Bedrohungslage hat zu intensiver wissenschaftlicher Aktivität zu COVID-19 geführt, wozu zahlreiche regionale, nationale und internationale epidemiologische Erhebungen und Registerstudien zählen. Der Konsensusdatensatz gibt der Wissenschaft um COVID-19 eine gemeinsame Sprache und Arbeitsgrundlage. Inofficial translation: In order to cope with the current pandemic and the associated treatment of patients, the Federal Ministry of Education and Research (BMBF) is funding a national network of university medicine in the fight against COVID-19. Among other things, the network will systematically collect and bundle the data of the treated COVID-19 patients. The researchers are to collect, track and analyze the treatment of COVID-19 patients in a standardized way. The high threat level has led to intensive scientific activity on COVID-19, including numerous regional, national and international epidemiological surveys and register studies. The consensus data set provides a common language and working basis for the science around COVID-19. Additional source: https://simplifier.net/ForschungsnetzCovid-19/ResearchDatasetGECCO/~overview Not yet integrated: Items for "Data Absent Reason", "Certainty of Presence", "Uncertainty of Presence", and "Certainty of absence"; "therapeutic intention", "Medication Statement Status", "EventStatus"; longer versions of the ValueSets published separately from the variables in art-decor. UMLS-Annotations.

Link

https://art-decor.org/art-decor/decor-datasets--covid19f-

Stichworte

Versionen (11)
  1. 29.09.20 29.09.20 - Sarah Riepenhausen
  2. 29.09.20 29.09.20 - Sarah Riepenhausen
  3. 09.10.20 09.10.20 -
  4. 28.10.20 28.10.20 -
  5. 13.01.21 13.01.21 - Sarah Riepenhausen
  6. 03.02.21 03.02.21 - Sarah Riepenhausen
  7. 03.02.21 03.02.21 - Sarah Riepenhausen
  8. 25.08.21 25.08.21 - Sarah Riepenhausen
  9. 02.09.21 02.09.21 - Sarah Riepenhausen
  10. 06.09.21 06.09.21 - Sarah Riepenhausen
  11. 05.01.23 05.01.23 - Sarah Riepenhausen
Rechteinhaber

Nationales Forschungsnetzwerk der Universitätsmedizin zu Covid-19

Hochgeladen am

29. September 2020

DOI

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Creative Commons BY 4.0
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GECCO - German Corona Consensus - Covid-19 Research-Dataset

Deutsch

Laborwerte

13 Formulare  
Laborwerte
Beschreibung

Laborwerte

SARS-CoV-2 (COVID-19) IgG IA Ql
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Versionsdatum: 2020-04-08 Hinweis: Deutscher Text der Antwortmöglichkeiten von den Erstellern der MDM-Version von GECCO übersetzt. Nicht offiziell.

Datentyp

text

Alias
LOINC[1]
94563-4
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgG IA Qn
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: [arb’U]/mL Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
94505-5
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgM IA Ql
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Versionsdatum: 2020-04-08 Hinweis: Deutscher Text der Antwortmöglichkeiten von den Erstellern der MDM-Version von GECCO übersetzt. Nicht offiziell.

Datentyp

text

Alias
LOINC[1]
94564-2
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgM IA Qn
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: [arb’U]/mL Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
94506-3
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgA IA Ql
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Versionsdatum: 2020-04-08 Hinweis: Deutscher Text der Antwortmöglichkeiten von den Erstellern der MDM-Version von GECCO übersetzt. Nicht offiziell.

Datentyp

text

Alias
LOINC[1]
94562-6
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgA IA Qn
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: [IU]/mL Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
94720-0
SARS-CoV-2 (COVID-19) Ab IA Ql
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Versionsdatum: 2020-04-08 Hinweis: Deutscher Text der Antwortmöglichkeiten von den Erstellern der MDM-Version von GECCO übersetzt. Nicht offiziell.

Datentyp

text

Alias
LOINC[1]
94762-2
SARS-CoV-2 (COVID-19) Ab IA Qn
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: [IU]/mL Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
94769-7
C-reactive protein
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: mg/L nmol/L mg/dL Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
48421-2
LOINC[2]
71426-1
LOINC[3]
76486-0
LOINC[4]
30522-7
LOINC[5]
1988-5
LOINC[6]
76485-2
Ferritin
Beschreibung

Units: ng/mL pmol/L Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
20567-4
LOINC[2]
86914-9
LOINC[3]
14723-1
LOINC[4]
2276-4
LOINC[5]
24373-3
Bilirubine
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: mg/dL umol/L Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
59828-4
LOINC[2]
59827-6
LOINC[3]
42719-5
LOINC[4]
14631-6
LOINC[5]
1971-1
LOINC[6]
1975-2
D-dimer
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: ug/mL ug/L ng/mL ng/mL{FEU} ug/mL {FEU} ug/L{DDU} {titer} Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
48065-7
LOINC[2]
48066-5
LOINC[3]
48067-3
LOINC[4]
55398-2
LOINC[5]
71427-9
LOINC[6]
7799-0
LOINC[7]
91556-1
LOINC[8]
38898-3
LOINC[9]
3246-6
LOINC[10]
48058-2
Gamma-GT
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: U/L Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
2325-9
LOINC[2]
2324-2
GOT/AST
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: U/L Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
88112-8
LOINC[2]
30239-8
LOINC[3]
1920-8
LDH
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: U/L Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
2529-6
LOINC[2]
2532-0
LOINC[3]
60017-1
LOINC[4]
14803-1
LOINC[5]
14804-9
LOINC[6]
14805-6
Kardiale Troponine
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: ug/L ng/L ng/mL Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
49563-0
LOINC[2]
89579-7
LOINC[3]
67151-1
LOINC[4]
6598-7
LOINC[5]
6597-9
LOINC[6]
48425-3
LOINC[7]
42757-5
LOINC[8]
10839-9
Hämoglobin
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: mmol/L g/dL g/L Versionsdatum: 2020-04-08

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
76769-9
LOINC[2]
718-7
LOINC[3]
20509-6
LOINC[4]
55782-7
LOINC[5]
75928-2
LOINC[6]
14775-1
LOINC[7]
30313-1
LOINC[8]
30350-3
LOINC[9]
30351-1
LOINC[10]
30352-9
LOINC[11]
76768-1
LOINC[12]
59260-0
Kreatinin
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: umol/L mg/dL Versionsdatum: 2020-05-04 12:03:14

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
14682-9
LOINC[2]
2160-0
LOINC[3]
21232-4
LOINC[4]
25386-4
LOINC[5]
12190-5
LOINC[6]
59826-8
LOINC[7]
38483-4
Laktat
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: mmol/L mg/dL Versionsdatum: 2020-05-04 12:03:56

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
14118-4
LOINC[2]
30242-2
LOINC[3]
2524-7
LOINC[4]
2519-7
LOINC[5]
2518-9
LOINC[6]
19240-1
LOINC[7]
19239-3
LOINC[8]
2520-5
LOINC[9]
32693-4
LOINC[10]
59032-3
LOINC[11]
27941-4
Leukozyten absolut
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: 10*3/uL Versionsdatum: 2020-05-04 12:08:14

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
804-5
LOINC[2]
6690-2
LOINC[3]
49498-9
LOINC[4]
26464-8
Lymphozyten absolut
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: 10*3/uL Versionsdatum: 2020-05-04 12:09:02

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
732-8
LOINC[2]
731-0
LOINC[3]
30364-4
LOINC[4]
26474-7
Neutrophile absolut
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: 10*3/uL Versionsdatum: 2020-05-04 12:13:50

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
753-4
LOINC[2]
751-8
LOINC[3]
26499-4
PTT
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: s Versionsdatum: 2020-05-04 12:14:20

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
16631-4
LOINC[2]
43734-3
LOINC[3]
14979-9
LOINC[4]
3173-2
Thrombozyten absolut
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: 10*3/uL Versionsdatum: 2020-05-04 12:14:57

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
74775-8
LOINC[2]
13056-7
LOINC[3]
26516-5
LOINC[4]
74464-9
LOINC[5]
778-1
LOINC[6]
49497-1
LOINC[7]
777-3
LOINC[8]
26515-7
INR
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: {INR} Versionsdatum: 2020-05-04 12:15:21

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
6301-6
LOINC[2]
46418-0
LOINC[3]
34714-6
Serum-Albumin
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: g/L umol/L g/dL Versionsdatum: 2020-05-19 12:02:54

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
76631-1
LOINC[2]
62235-7
LOINC[3]
62234-0
LOINC[4]
61152-5
LOINC[5]
61151-7
LOINC[6]
2862-1
LOINC[7]
1751-7
LOINC[8]
54347-0
Antithrombin III
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Operationalisierung: Synonym: Antithrombin Units: % [IU]/mL Versionsdatum: 2020-05-19 12:03:12

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
3176-5
LOINC[2]
91120-6
LOINC[3]
3174-0
Procalcitonin
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: ng/mL Versionsdatum: 2020-05-22 18:09:45

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
75241-0
LOINC[2]
33959-8
Interleukin 6
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: pg/mL Versionsdatum: 2020-05-22 18:13:26

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
44322-6
LOINC[2]
26881-3
LOINC[3]
49919-4
LOINC[4]
49732-1
N-terminales B-Typ natriuretisches Peptid
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: pg/mL Versionsdatum: 2020-05-22 18:13:51

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
33762-6
Fibrinogen
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Units: g/L mg/dL Versionsdatum: 2020-05-22 18:14:47

Datentyp

float

Alias
LOINC[1]
30902-1
LOINC[2]
48664-7
LOINC[3]
3255-7
SARS-CoV-2-RT-PCR
Beschreibung

Kommentar: FHIR-Mapping: Observation Versionsdatum: 2020-05-22 18:15:50 Hinweis: Deutscher Text der Antwortmöglichkeiten von den Erstellern der MDM-Version von GECCO übersetzt. Nicht offiziell.

Datentyp

text

Alias
LOINC[1]
94500-6
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Ähnliche Modelle

Laborwerte

13 Formulare
Name
Typ
Description | Question | Decode (Coded Value)
Datentyp
Alias
Item Group
Laborwerte
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgG IA Ql
text
94563-4 (LOINC[1])
SARS-CoV-2-RT-PCR
Code List
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgG IA Ql
CL Item
Nachgewiesen (Detected)
260373001 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht nachgewiesen (Not-Detected)
260415000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht eindeutig (Inconclusive)
419984006 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgG IA Qn
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgG IA Qn
float
94505-5 (LOINC[1])
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgM IA Ql
text
94564-2 (LOINC[1])
SARS-CoV-2-RT-PCR
Code List
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgM IA Ql
CL Item
Nachgewiesen (Detected)
260373001 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht nachgewiesen (Not-Detected)
260415000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht eindeutig (Inconclusive)
419984006 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgM IA Qn
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgM IA Qn
float
94506-3 (LOINC[1])
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgA IA Ql
text
94562-6 (LOINC[1])
SARS-CoV-2-RT-PCR
Code List
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgA IA Ql
CL Item
Nachgewiesen (Detected)
260373001 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht nachgewiesen (Not-Detected)
260415000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht eindeutig (Inconclusive)
419984006 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgA IA Qn
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) IgA IA Qn
float
94720-0 (LOINC[1])
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) Ab IA Ql
text
94762-2 (LOINC[1])
SARS-CoV-2-RT-PCR
Code List
SARS-CoV-2 (COVID-19) Ab IA Ql
CL Item
Nachgewiesen (Detected)
260373001 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht nachgewiesen (Not-Detected)
260415000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht eindeutig (Inconclusive)
419984006 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
SARS-CoV-2 (COVID-19) Ab IA Qn
Item
SARS-CoV-2 (COVID-19) Ab IA Qn
float
94769-7 (LOINC[1])
CRP
Item
C-reactive protein
float
48421-2 (LOINC[1])
71426-1 (LOINC[2])
76486-0 (LOINC[3])
30522-7 (LOINC[4])
1988-5 (LOINC[5])
76485-2 (LOINC[6])
Ferritin
Item
Ferritin
float
20567-4 (LOINC[1])
86914-9 (LOINC[2])
14723-1 (LOINC[3])
2276-4 (LOINC[4])
24373-3 (LOINC[5])
Bilirubin
Item
Bilirubine
float
59828-4 (LOINC[1])
59827-6 (LOINC[2])
42719-5 (LOINC[3])
14631-6 (LOINC[4])
1971-1 (LOINC[5])
1975-2 (LOINC[6])
D-dimer
Item
D-dimer
float
48065-7 (LOINC[1])
48066-5 (LOINC[2])
48067-3 (LOINC[3])
55398-2 (LOINC[4])
71427-9 (LOINC[5])
7799-0 (LOINC[6])
91556-1 (LOINC[7])
38898-3 (LOINC[8])
3246-6 (LOINC[9])
48058-2 (LOINC[10])
Gamma-GT
Item
Gamma-GT
float
2325-9 (LOINC[1])
2324-2 (LOINC[2])
GOT/AST
Item
GOT/AST
float
88112-8 (LOINC[1])
30239-8 (LOINC[2])
1920-8 (LOINC[3])
LDH
Item
LDH
float
2529-6 (LOINC[1])
2532-0 (LOINC[2])
60017-1 (LOINC[3])
14803-1 (LOINC[4])
14804-9 (LOINC[5])
14805-6 (LOINC[6])
Kardiale Troponine
Item
Kardiale Troponine
float
49563-0 (LOINC[1])
89579-7 (LOINC[2])
67151-1 (LOINC[3])
6598-7 (LOINC[4])
6597-9 (LOINC[5])
48425-3 (LOINC[6])
42757-5 (LOINC[7])
10839-9 (LOINC[8])
Hämoglobin
Item
Hämoglobin
float
76769-9 (LOINC[1])
718-7 (LOINC[2])
20509-6 (LOINC[3])
55782-7 (LOINC[4])
75928-2 (LOINC[5])
14775-1 (LOINC[6])
30313-1 (LOINC[7])
30350-3 (LOINC[8])
30351-1 (LOINC[9])
30352-9 (LOINC[10])
76768-1 (LOINC[11])
59260-0 (LOINC[12])
Kreatinin
Item
Kreatinin
float
14682-9 (LOINC[1])
2160-0 (LOINC[2])
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12190-5 (LOINC[5])
59826-8 (LOINC[6])
38483-4 (LOINC[7])
Laktat
Item
Laktat
float
14118-4 (LOINC[1])
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19239-3 (LOINC[7])
2520-5 (LOINC[8])
32693-4 (LOINC[9])
59032-3 (LOINC[10])
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Leukozyten absolut
Item
Leukozyten absolut
float
804-5 (LOINC[1])
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Lymphozyten absolut
Item
Lymphozyten absolut
float
732-8 (LOINC[1])
731-0 (LOINC[2])
30364-4 (LOINC[3])
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Neutrophile absolut
Item
Neutrophile absolut
float
753-4 (LOINC[1])
751-8 (LOINC[2])
26499-4 (LOINC[3])
PTT
Item
PTT
float
16631-4 (LOINC[1])
43734-3 (LOINC[2])
14979-9 (LOINC[3])
3173-2 (LOINC[4])
Thrombozyten absolut
Item
Thrombozyten absolut
float
74775-8 (LOINC[1])
13056-7 (LOINC[2])
26516-5 (LOINC[3])
74464-9 (LOINC[4])
778-1 (LOINC[5])
49497-1 (LOINC[6])
777-3 (LOINC[7])
26515-7 (LOINC[8])
INR
Item
INR
float
6301-6 (LOINC[1])
46418-0 (LOINC[2])
34714-6 (LOINC[3])
Serum-Albumin
Item
Serum-Albumin
float
76631-1 (LOINC[1])
62235-7 (LOINC[2])
62234-0 (LOINC[3])
61152-5 (LOINC[4])
61151-7 (LOINC[5])
2862-1 (LOINC[6])
1751-7 (LOINC[7])
54347-0 (LOINC[8])
Antithrombin III
Item
Antithrombin III
float
3176-5 (LOINC[1])
91120-6 (LOINC[2])
3174-0 (LOINC[3])
PCT (Procalcitonin)
Item
Procalcitonin
float
75241-0 (LOINC[1])
33959-8 (LOINC[2])
IL-6 (Interleukin 6)
Item
Interleukin 6
float
44322-6 (LOINC[1])
26881-3 (LOINC[2])
49919-4 (LOINC[3])
49732-1 (LOINC[4])
NT-pro-BNP
Item
N-terminales B-Typ natriuretisches Peptid
float
33762-6 (LOINC[1])
Fibrinogen
Item
Fibrinogen
float
30902-1 (LOINC[1])
48664-7 (LOINC[2])
3255-7 (LOINC[3])
Item
SARS-CoV-2-RT-PCR
text
94500-6 (LOINC[1])
SARS-CoV-2-RT-PCR
Code List
SARS-CoV-2-RT-PCR
CL Item
Nachgewiesen (Detected)
260373001 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht nachgewiesen (Not-Detected)
260415000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
CL Item
Nicht eindeutig (Inconclusive)
419984006 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
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