ID

39946

Descrizione

https://www.hl7.org/fhir/resourcelist.html (accessed at 14.02.2020) This form contains an incomplete implementation of the FHIR Resource SubstanceNucleicAcid (0). After preliminary review, it contains the data elements that request clinical information.

collegamento

https://www.hl7.org/fhir/resourcelist.html

Keywords

versioni (3)
  1. 24/02/20 24/02/20 -
  2. 05/03/20 05/03/20 -
  3. 18/03/20 18/03/20 -
Titolare del copyright

HL7 FHIR

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5 marzo 2020

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FHIR v4.0.1

Inglese

Resource SubstanceNucleicAcid (0)

1 moduli  
SubstanceNucleicAcid (0)
Descrizione

SubstanceNucleicAcid (0)

Alias
UMLS CUI-1
C0439861
UMLS CUI-2
C0028606
SubstanceNucleicAcid.sequenceType
Descrizione

SubstanceNucleicAcid.sequenceType

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1519249
UMLS CUI [1,3]
C0332307
UMLS CUI [2,1]
C0004793
UMLS CUI [2,2]
C0332307
SubstanceNucleicAcid.numberOfSubunits
Descrizione

SubstanceNucleicAcid.numberOfSubunits

Tipo di dati

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0449788
SubstanceNucleicAcid.areaOfHybridisation
Descrizione

The area of hybridisation shall be described if applicable for double stranded RNA or DNA. The number associated with the subunit followed by the number associated to the residue shall be specified in increasing order. The underscore “” shall be used as separator as follows: “Subunitnumber Residue”.

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028602
UMLS CUI [1,2]
C0205146
SubstanceNucleicAcid.oligoNucleotideType
Descrizione

SubstanceNucleicAcid.oligoNucleotideType

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C0028953
UMLS CUI [1,3]
C0332307
SubstanceNucleicAcid.subunit.subunit
Descrizione

Index of linear sequences of nucleic acids in order of decreasing length. Sequences of the same length will be ordered by molecular weight. Subunits that have identical sequences will be repeated and have sequential subscripts.

Tipo di dati

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0918012
UMLS CUI [1,2]
C1519249
UMLS CUI [1,3]
C0205132
UMLS CUI [1,4]
C0028606
UMLS CUI [1,5]
C1711351
UMLS CUI [1,6]
C0442797
UMLS CUI [1,7]
C1444754
SubstanceNucleicAcid.subunit.sequence
Descrizione

Actual nucleotide sequence notation from 5' to 3' end using standard single letter codes. In addition to the base sequence, sugar and type of phosphate or non-phosphate linkage should also be captured.

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0004793
SubstanceNucleicAcid.subunit.length
Descrizione

SubstanceNucleicAcid.subunit.length

Tipo di dati

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C1444754
SubstanceNucleicAcid.subunit.sequenceAttachment
Descrizione

SubstanceNucleicAcid.subunit.sequenceAttachment

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0004793
UMLS CUI [1,4]
C1999228
SubstanceNucleicAcid.subunit.fivePrime
Descrizione

The nucleotide present at the 5’ terminal shall be specified based on a controlled vocabulary. Since the sequence is represented from the 5' to the 3' end, the 5’ prime nucleotide is the letter at the first position in the sequence. A separate representation would be redundant.

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0028630
UMLS CUI [1,4]
C1883644
SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.connectivity
Descrizione

The entity that links the sugar residues together should also be captured for nearly all naturally occurring nucleic acid the linkage is a phosphate group. For many synthetic oligonucleotides phosphorothioate linkages are often seen. Linkage connectivity is assumed to be 3’-5’. If the linkage is either 3’-3’ or 5’-5’ this should be specified.

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0006999
UMLS CUI [1,4]
C1551338
SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.residueSite
Descrizione

SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.residueSite

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0006999
UMLS CUI [1,4]
C1709915
UMLS CUI [1,5]
C0205145
SubstanceNucleicAcid.subunit.sugar.residueSite
Descrizione

The residues that contain a given sugar will be captured. The order of given residues will be captured in the 5‘-3‘direction consistent with the base sequences listed above.

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028606
UMLS CUI [1,2]
C1711351
UMLS CUI [1,3]
C0242209
UMLS CUI [1,4]
C1709915
UMLS CUI [1,5]
C0205145
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Similar models

Resource SubstanceNucleicAcid (0)

1 moduli
Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
SubstanceNucleicAcid (0)
C0439861 (UMLS CUI-1)
C0028606 (UMLS CUI-2)
SubstanceNucleicAcid.sequenceType
Item
SubstanceNucleicAcid.sequenceType
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1519249 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
C0004793 (UMLS CUI [2,1])
C0332307 (UMLS CUI [2,2])
SubstanceNucleicAcid.numberOfSubunits
Item
SubstanceNucleicAcid.numberOfSubunits
integer
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0449788 (UMLS CUI [1,3])
SubstanceNucleicAcid.areaOfHybridisation
Item
SubstanceNucleicAcid.areaOfHybridisation
text
C0028602 (UMLS CUI [1,1])
C0205146 (UMLS CUI [1,2])
SubstanceNucleicAcid.oligoNucleotideType
Item
SubstanceNucleicAcid.oligoNucleotideType
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C0028953 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
SubstanceNucleicAcid.subunit.subunit
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.subunit
integer
C0918012 (UMLS CUI [1,1])
C1519249 (UMLS CUI [1,2])
C0205132 (UMLS CUI [1,3])
C0028606 (UMLS CUI [1,4])
C1711351 (UMLS CUI [1,5])
C0442797 (UMLS CUI [1,6])
C1444754 (UMLS CUI [1,7])
SubstanceNucleicAcid.subunit.sequence
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.sequence
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0004793 (UMLS CUI [1,3])
SubstanceNucleicAcid.subunit.length
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.length
integer
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C1444754 (UMLS CUI [1,3])
SubstanceNucleicAcid.subunit.sequenceAttachment
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.sequenceAttachment
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0004793 (UMLS CUI [1,3])
C1999228 (UMLS CUI [1,4])
SubstanceNucleicAcid.subunit.fivePrime
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.fivePrime
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0028630 (UMLS CUI [1,3])
C1883644 (UMLS CUI [1,4])
SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.connectivity
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.connectivity
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0006999 (UMLS CUI [1,3])
C1551338 (UMLS CUI [1,4])
SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.residueSite
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.linkage.residueSite
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0006999 (UMLS CUI [1,3])
C1709915 (UMLS CUI [1,4])
C0205145 (UMLS CUI [1,5])
SubstanceNucleicAcid.subunit.sugar.residueSite
Item
SubstanceNucleicAcid.subunit.sugar.residueSite
text
C0028606 (UMLS CUI [1,1])
C1711351 (UMLS CUI [1,2])
C0242209 (UMLS CUI [1,3])
C1709915 (UMLS CUI [1,4])
C0205145 (UMLS CUI [1,5])
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