Swab Microbiology

1 forms
  1. StudyEvent: ODM
    1. Swab Microbiology
Name
Type
Description | Question | Decode (Coded Value)
Data type
Alias
Item Group
Administrative data
C1320722 (UMLS CUI-1)
Clinical Trial Subject Unique Identifier
Item
Subject Identifier
integer
C2348585 (UMLS CUI [1])
Item
Visit Type
integer
C0332307 (UMLS CUI [1,1])
C0545082 (UMLS CUI [1,2])
Visit Type
Code List
Visit Type
CL Item
Visit 1 (1)
CL Item
Visit 4 (2)
CL Item
Visit 5 (3)
CL Item
Visit 6 (4)
CL Item
Visit 7 (5)
CL Item
Visit 8 (6)
CL Item
Visit 9 (7)
CL Item
Visit 10 (8)
Date of Assessment
Item
Date of Assessment
date
C2985720 (UMLS CUI [1])
Swab sample collected and received?
Item
Has a swab sample been collected and received?
boolean
C0563454 (UMLS CUI [1,1])
C0884358 (UMLS CUI [1,2])
C0183753 (UMLS CUI [2,1])
C2585542 (UMLS CUI [2,2])
Date of sample
Item
Date of sample
boolean
C1302413 (UMLS CUI [1])
Item Group
Streptococcus pneumoniae
C0038410 (UMLS CUI-1)
Item
Microbiological result of Streptococcus pneumoniae
integer
C0025953 (UMLS CUI [1,1])
C0587081 (UMLS CUI [1,2])
C0038410 (UMLS CUI [1,3])
Microbiological result of Streptococcus pneumoniae
Code List
Microbiological result of Streptococcus pneumoniae
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
Not tested (3)
Item
Please specify serotyping for each Streptococcus pneumoniae culture (Culture 1)
text
C0038410 (UMLS CUI [1,1])
C0036759 (UMLS CUI [1,2])
C0430402 (UMLS CUI [1,3])
Serotyping of bacterial culture 1
Code List
Please specify serotyping for each Streptococcus pneumoniae culture (Culture 1)
CL Item
1 (1)
CL Item
2 (2)
CL Item
3 (3)
CL Item
4 (4)
CL Item
5 (5)
CL Item
6A (6A)
CL Item
6B (6B)
CL Item
6C (6C)
CL Item
6D (6D)
CL Item
7A (7A)
CL Item
7B (7B)
CL Item
7C (7C)
CL Item
7F (7F)
CL Item
8 (8)
CL Item
9A (9A)
CL Item
9L (9L)
CL Item
9N (9N)
CL Item
9V (9V)
CL Item
10A (10A)
CL Item
10B (10B)
CL Item
10C (10C)
CL Item
10F (10F)
CL Item
11A (11A)
CL Item
11B (11B)
CL Item
11C (11C)
CL Item
11D (11D)
CL Item
11F (11F)
CL Item
12A (12A)
CL Item
12B (12B)
CL Item
12F (12F)
CL Item
13 (13)
CL Item
14 (14)
CL Item
15A (15A)
CL Item
15B (15B)
CL Item
15C (15C)
CL Item
15F (15F)
CL Item
16A (16A)
CL Item
16F (16F)
CL Item
17A (17A)
CL Item
17F (17F)
CL Item
18A (18A)
CL Item
18B (18B)
CL Item
18C (18C)
CL Item
18F (18F)
CL Item
19A (19A)
CL Item
19B (19B)
CL Item
19C (19C)
CL Item
19F (19F)
CL Item
20 (20)
CL Item
21 (21)
CL Item
22A (22A)
CL Item
22F (22F)
CL Item
23A (23A)
CL Item
23B (23B)
CL Item
23F (23F)
CL Item
24A (24A)
CL Item
24B (24B)
CL Item
24F (24F)
CL Item
25A (25A)
CL Item
25F (25F)
CL Item
27 (27)
CL Item
28A (28A)
CL Item
28F (28F)
CL Item
29 (29)
CL Item
31 (31)
CL Item
32A (32A)
CL Item
32F (32F)
CL Item
33A (33A)
CL Item
33B (33B)
CL Item
33C (33C)
CL Item
33D (33D)
CL Item
33F (33F)
CL Item
34 (34)
CL Item
35A (35A)
CL Item
35B (35B)
CL Item
35C (35C)
CL Item
35F (35F)
CL Item
36 (36)
CL Item
37 (37)
CL Item
38 (38)
CL Item
39 (39)
CL Item
40 (40)
CL Item
41A (41A)
CL Item
41F (41F)
CL Item
42 (42)
CL Item
43 (43)
CL Item
44 (44)
CL Item
45 (45)
CL Item
46 (46)
CL Item
47A (47A)
CL Item
47F (47F)
CL Item
48 (48)
CL Item
unknown (UNK)
CL Item
not applicable (NA)
CL Item
non-encapsulated (NE)
CL Item
other (OTH)
Specify other Streptococcus pneumoniae serotype of culture 1
Item
Specify other Streptococcus pneumoniae serotype of culture 1
text
C1521902 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0038410 (UMLS CUI [1,3])
C0036759 (UMLS CUI [1,4])
C0430402 (UMLS CUI [1,5])
Item
Please specify serotyping for each Streptococcus pneumoniae culture (Culture 2)
text
C0038410 (UMLS CUI [1,1])
C0036759 (UMLS CUI [1,2])
C0430402 (UMLS CUI [1,3])
Serotyping of bacterial culture 1
Code List
Please specify serotyping for each Streptococcus pneumoniae culture (Culture 2)
CL Item
1 (1)
CL Item
2 (2)
CL Item
3 (3)
CL Item
4 (4)
CL Item
5 (5)
CL Item
6A (6A)
CL Item
6B (6B)
CL Item
6C (6C)
CL Item
6D (6D)
CL Item
7A (7A)
CL Item
7B (7B)
CL Item
7C (7C)
CL Item
7F (7F)
CL Item
8 (8)
CL Item
9A (9A)
CL Item
9L (9L)
CL Item
9N (9N)
CL Item
9V (9V)
CL Item
10A (10A)
CL Item
10B (10B)
CL Item
10C (10C)
CL Item
10F (10F)
CL Item
11A (11A)
CL Item
11B (11B)
CL Item
11C (11C)
CL Item
11D (11D)
CL Item
11F (11F)
CL Item
12A (12A)
CL Item
12B (12B)
CL Item
12F (12F)
CL Item
13 (13)
CL Item
14 (14)
CL Item
15A (15A)
CL Item
15B (15B)
CL Item
15C (15C)
CL Item
15F (15F)
CL Item
16A (16A)
CL Item
16F (16F)
CL Item
17A (17A)
CL Item
17F (17F)
CL Item
18A (18A)
CL Item
18B (18B)
CL Item
18C (18C)
CL Item
18F (18F)
CL Item
19A (19A)
CL Item
19B (19B)
CL Item
19C (19C)
CL Item
19F (19F)
CL Item
20 (20)
CL Item
21 (21)
CL Item
22A (22A)
CL Item
22F (22F)
CL Item
23A (23A)
CL Item
23B (23B)
CL Item
23F (23F)
CL Item
24A (24A)
CL Item
24B (24B)
CL Item
24F (24F)
CL Item
25A (25A)
CL Item
25F (25F)
CL Item
27 (27)
CL Item
28A (28A)
CL Item
28F (28F)
CL Item
29 (29)
CL Item
31 (31)
CL Item
32A (32A)
CL Item
32F (32F)
CL Item
33A (33A)
CL Item
33B (33B)
CL Item
33C (33C)
CL Item
33D (33D)
CL Item
33F (33F)
CL Item
34 (34)
CL Item
35A (35A)
CL Item
35B (35B)
CL Item
35C (35C)
CL Item
35F (35F)
CL Item
36 (36)
CL Item
37 (37)
CL Item
38 (38)
CL Item
39 (39)
CL Item
40 (40)
CL Item
41A (41A)
CL Item
41F (41F)
CL Item
42 (42)
CL Item
43 (43)
CL Item
44 (44)
CL Item
45 (45)
CL Item
46 (46)
CL Item
47A (47A)
CL Item
47F (47F)
CL Item
48 (48)
CL Item
unknown (UNK)
CL Item
not applicable (NA)
CL Item
non-encapsulated (NE)
CL Item
other (OTH)
Specify other Streptococcus pneumoniae serotype of culture 2
Item
Specify other Streptococcus pneumoniae serotype of culture 2
text
C1521902 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0038410 (UMLS CUI [1,3])
C0036759 (UMLS CUI [1,4])
C0430402 (UMLS CUI [1,5])
Item
Please specify serotyping for each Streptococcus pneumoniae culture (Culture 3)
text
C0038410 (UMLS CUI [1,1])
C0036759 (UMLS CUI [1,2])
C0430402 (UMLS CUI [1,3])
Serotyping of bacterial culture 1
Code List
Please specify serotyping for each Streptococcus pneumoniae culture (Culture 3)
CL Item
1 (1)
CL Item
2 (2)
CL Item
3 (3)
CL Item
4 (4)
CL Item
5 (5)
CL Item
6A (6A)
CL Item
6B (6B)
CL Item
6C (6C)
CL Item
6D (6D)
CL Item
7A (7A)
CL Item
7B (7B)
CL Item
7C (7C)
CL Item
7F (7F)
CL Item
8 (8)
CL Item
9A (9A)
CL Item
9L (9L)
CL Item
9N (9N)
CL Item
9V (9V)
CL Item
10A (10A)
CL Item
10B (10B)
CL Item
10C (10C)
CL Item
10F (10F)
CL Item
11A (11A)
CL Item
11B (11B)
CL Item
11C (11C)
CL Item
11D (11D)
CL Item
11F (11F)
CL Item
12A (12A)
CL Item
12B (12B)
CL Item
12F (12F)
CL Item
13 (13)
CL Item
14 (14)
CL Item
15A (15A)
CL Item
15B (15B)
CL Item
15C (15C)
CL Item
15F (15F)
CL Item
16A (16A)
CL Item
16F (16F)
CL Item
17A (17A)
CL Item
17F (17F)
CL Item
18A (18A)
CL Item
18B (18B)
CL Item
18C (18C)
CL Item
18F (18F)
CL Item
19A (19A)
CL Item
19B (19B)
CL Item
19C (19C)
CL Item
19F (19F)
CL Item
20 (20)
CL Item
21 (21)
CL Item
22A (22A)
CL Item
22F (22F)
CL Item
23A (23A)
CL Item
23B (23B)
CL Item
23F (23F)
CL Item
24A (24A)
CL Item
24B (24B)
CL Item
24F (24F)
CL Item
25A (25A)
CL Item
25F (25F)
CL Item
27 (27)
CL Item
28A (28A)
CL Item
28F (28F)
CL Item
29 (29)
CL Item
31 (31)
CL Item
32A (32A)
CL Item
32F (32F)
CL Item
33A (33A)
CL Item
33B (33B)
CL Item
33C (33C)
CL Item
33D (33D)
CL Item
33F (33F)
CL Item
34 (34)
CL Item
35A (35A)
CL Item
35B (35B)
CL Item
35C (35C)
CL Item
35F (35F)
CL Item
36 (36)
CL Item
37 (37)
CL Item
38 (38)
CL Item
39 (39)
CL Item
40 (40)
CL Item
41A (41A)
CL Item
41F (41F)
CL Item
42 (42)
CL Item
43 (43)
CL Item
44 (44)
CL Item
45 (45)
CL Item
46 (46)
CL Item
47A (47A)
CL Item
47F (47F)
CL Item
48 (48)
CL Item
unknown (UNK)
CL Item
not applicable (NA)
CL Item
non-encapsulated (NE)
CL Item
other (OTH)
Specify other Streptococcus pneumoniae serotype of culture 3
Item
Specify other Streptococcus pneumoniae serotype of culture 3
text
C1521902 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0038410 (UMLS CUI [1,3])
C0036759 (UMLS CUI [1,4])
C0430402 (UMLS CUI [1,5])
Colony count performed?
Item
Has a quantitative count been performed?
boolean
C0368993 (UMLS CUI [1,1])
C0884358 (UMLS CUI [1,2])
Item
Colony count result
text
C0368993 (UMLS CUI [1,1])
C0456984 (UMLS CUI [1,2])
colony count result
Code List
Colony count result
CL Item
scant (SC)
CL Item
1+ growth (1+)
CL Item
2+ growth (2+)
CL Item
3+ growth (3+)
Item Group
Haemophilus influenzae
C0018483 (UMLS CUI-1)
Item
Microbiological result of Haemophilus influenzae
integer
C0025953 (UMLS CUI [1,1])
C0587081 (UMLS CUI [1,2])
C0018483 (UMLS CUI [1,3])
Microbiological result of Streptococcus pneumoniae
Code List
Microbiological result of Haemophilus influenzae
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
Not tested (3)
Item
Please specify serotyping for each Haemophilus influenzae culture (Culture 1)
text
C0036759 (UMLS CUI [1,1])
C0018483 (UMLS CUI [1,2])
C0430402 (UMLS CUI [1,3])
Serotyping of bacterial culture 1
Code List
Please specify serotyping for each Haemophilus influenzae culture (Culture 1)
CL Item
unknown (UNK)
CL Item
not applicable (NA)
CL Item
A (A)
CL Item
B (B)
CL Item
C (C)
CL Item
D (D)
CL Item
E (E)
CL Item
F (F)
CL Item
A- (A-)
CL Item
B- (B-)
CL Item
C- (C-)
CL Item
D- (D-)
CL Item
E- (E-)
CL Item
F- (F-)
CL Item
not typeable (NT)
Item
Please specify serotyping for each Haemophilus influenzae culture (Culture 2)
text
C0036759 (UMLS CUI [1,1])
C0018483 (UMLS CUI [1,2])
C0430402 (UMLS CUI [1,3])
Serotyping of bacterial culture 1
Code List
Please specify serotyping for each Haemophilus influenzae culture (Culture 2)
CL Item
unknown (UNK)
CL Item
not applicable (NA)
CL Item
A (A)
CL Item
B (B)
CL Item
C (C)
CL Item
D (D)
CL Item
E (E)
CL Item
F (F)
CL Item
A- (A-)
CL Item
B- (B-)
CL Item
C- (C-)
CL Item
D- (D-)
CL Item
E- (E-)
CL Item
F- (F-)
CL Item
not typeable (NT)
Item
Please specify serotyping for each Haemophilus influenzae culture (Culture 3)
text
C0036759 (UMLS CUI [1,1])
C0018483 (UMLS CUI [1,2])
C0430402 (UMLS CUI [1,3])
Serotyping of bacterial culture 1
Code List
Please specify serotyping for each Haemophilus influenzae culture (Culture 3)
CL Item
unknown (UNK)
CL Item
not applicable (NA)
CL Item
A (A)
CL Item
B (B)
CL Item
C (C)
CL Item
D (D)
CL Item
E (E)
CL Item
F (F)
CL Item
A- (A-)
CL Item
B- (B-)
CL Item
C- (C-)
CL Item
D- (D-)
CL Item
E- (E-)
CL Item
F- (F-)
CL Item
not typeable (NT)
Colony count performed?
Item
Has a quantitative count been performed?
boolean
C0368993 (UMLS CUI [1,1])
C0884358 (UMLS CUI [1,2])
Item
Colony count result
text
C0368993 (UMLS CUI [1,1])
C0456984 (UMLS CUI [1,2])
colony count result
Code List
Colony count result
CL Item
scant (SC)
CL Item
1+ growth (1+)
CL Item
2+ growth (2+)
CL Item
3+ growth (3+)
Item Group
Staphylococcus aureus
C0038172 (UMLS CUI-1)
Item
Microbiological result of Staphylococcus aureus
integer
C0025953 (UMLS CUI [1,1])
C0587081 (UMLS CUI [1,2])
C0038172 (UMLS CUI [1,3])
Microbiological result of Streptococcus pneumoniae
Code List
Microbiological result of Staphylococcus aureus
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
Not tested (3)
Item Group
Other bacteria
C0205394 (UMLS CUI-1)
C0004611 (UMLS CUI-2)
Item
Microbiological result of other bacteria
integer
C0025953 (UMLS CUI [1,1])
C0587081 (UMLS CUI [1,2])
C0205394 (UMLS CUI [1,3])
C0004611 (UMLS CUI [1,4])
Microbiological result of Streptococcus pneumoniae
Code List
Microbiological result of other bacteria
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
Not tested (3)
Moraxella catarrhalis detected?
Item
Moraxella catarrhalis detected?
boolean
C0006132 (UMLS CUI [1,1])
C0442726 (UMLS CUI [1,2])
Group A Streptococcus detected?
Item
Group A Streptococcus detected?
boolean
C0442726 (UMLS CUI [1,1])
C1541907 (UMLS CUI [1,2])
Normal flora detected?
Item
Normal flora detected?
boolean
C0314761 (UMLS CUI [1,1])
C0442726 (UMLS CUI [1,2])
Other bacteria detected?
Item
Other bacteria detected?
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0004611 (UMLS CUI [1,2])
C0442726 (UMLS CUI [1,3])
Specify other detected bacteria
Item
Specify other detected bacteria
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0442726 (UMLS CUI [1,2])
C0004611 (UMLS CUI [1,3])
C1521902 (UMLS CUI [1,4])
Item Group
Investigator's Signature
C2346576 (UMLS CUI-1)
Investigator Signature
Item
Investigator's signature
text
C2346576 (UMLS CUI [1])
Investigator Signature Date
Item
Investigator Signature Date
date
C2346576 (UMLS CUI [1,1])
C0011008 (UMLS CUI [1,2])
Investigator Name
Item
Printed Investigator's name
text
C2826892 (UMLS CUI [1])
Back to the top of the page 

Contact

Please use this form for feedback, questions and suggestions for improvements.

Fields marked with * are required.

Help

Do you need help on how to use the search function? Please watch the corresponding tutorial video for more details and learn how to use the search function most efficiently.

Watch Tutorial