ID

45967

Descrizione

Principal Investigator: Jennifer R. Brown, Dana-Farber Cancer Institute, Broad Institute, Boston, MA, USA MeSH: Leukemia, Lymphocytic, Chronic, B-Cell https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000879 Chronic Lymphocytic Leukemia (CLL) is a hematological malignancy characterized by accumulation of CD5+CD19+ B cells in peripheral lymphoid organs, bone marrow and blood. In this study we analyze matched whole genome sequencing and RNA-seq data from CLL patients to characterize the mutational processes operative throughout tumor evolution. Source of tumor and normal DNA used is patient PBMC or B cells and saliva respectively.

collegamento

dbGaP study=phs000879

Keywords

  1. 26/03/24 26/03/24 - Madita Rudolph
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Jennifer R. Brown, Dana-Farber Cancer Institute, Broad Institute, Boston, MA, USA

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26 marzo 2024

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dbGaP phs000879 DFCI Brown Lab CLL Sequencing Study

Subject ID, sample ID, and sample use variable obtained from participants with or without chronic lymphocytic leukemia and involved in the "Dana-Farber Cancer Institute (DFCI) Brown Lab CLL Sequencing Study" project.

pht005033
Descrizione

pht005033

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
Subject ID
Descrizione

SUBJID

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2348585
Sample ID
Descrizione

SAMPID

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1299222
Type of data submitted. Seq_DNA_WholeGenome: Whole genome sequencing; Seq_RNA: Whole transcriptome sequencing
Descrizione

SAMPLE_USE

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1511726
UMLS CUI [1,2]
C0332307
UMLS CUI [1,3]
C1515023

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Subject ID, sample ID, and sample use variable obtained from participants with or without chronic lymphocytic leukemia and involved in the "Dana-Farber Cancer Institute (DFCI) Brown Lab CLL Sequencing Study" project.

Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
pht005033
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SUBJID
Item
Subject ID
string
C2348585 (UMLS CUI [1,1])
SAMPID
Item
Sample ID
string
C1299222 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_USE
Item
Type of data submitted. Seq_DNA_WholeGenome: Whole genome sequencing; Seq_RNA: Whole transcriptome sequencing
string
C1511726 (UMLS CUI [1,1])
C0332307 (UMLS CUI [1,2])
C1515023 (UMLS CUI [1,3])

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