ID

45658

Descrição

Principal Investigator: Neil E Caporaso, MD, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA MeSH: Waldenstrom Macroglobulinemia,Lymphoplasmacytoid Lymphoma https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001284 A discovery GWAS is performed, consisting of genotyping 221 Waldenstrom macroglobulinemia (WM) cases on the Illumina Omni Express 12v1.1 platform and analyzing the genotypes together with those of 3798 previously genotyped controls in a model taking into account gender, age, and principal components of ancestry (i.e., significant eigenvectors). Directly genotyped data are supplemented by imputation using the Haplotype Reference Consortium.

Link

dbGaP study = phs001284

Palavras-chave

  1. 23/03/2023 23/03/2023 - Simon Heim
Titular dos direitos

Neil E Caporaso, MD, National Institutes of Health, Bethesda, MD, USA

Transferido a

23 de março de 2023

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Creative Commons BY 4.0

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dbGaP phs001284 NCI Waldenstrom Macroglobulinemia Genome-wide Association Study

This sample attributes table contains sample ID, histological type, body site, analyte type, and tumor status.

pht009034
Descrição

pht009034

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified Sample ID
Descrição

SAMPLE_ID

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C1299222
Histological Type
Descrição

HISTOLOGICAL_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0449574
Body site where sample was collected
Descrição

BODY_SITE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0449705
Analyte Type
Descrição

ANALYTE_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4744818
Tumor status
Descrição

IS_TUMOR

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475752

Similar models

This sample attributes table contains sample ID, histological type, body site, analyte type, and tumor status.

Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht009034
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
De-identified Sample ID
string
C4684638 (UMLS CUI [1,1])
C1299222 (UMLS CUI [1,2])
HISTOLOGICAL_TYPE
Item
Histological Type
string
C0449574 (UMLS CUI [1,1])
BODY_SITE
Item
Body site where sample was collected
string
C0449705 (UMLS CUI [1,1])
ANALYTE_TYPE
Item
Analyte Type
string
C4744818 (UMLS CUI [1,1])
IS_TUMOR
Item
Tumor status
string
C0475752 (UMLS CUI [1,1])

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