ID

45626

Descrição

Principal Investigator: S. Louis Bridges, Jr., MD, PhD, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA MeSH: Arthritis, Rheumatoid https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001360 The Consortium for the Longitudinal Evaluation of African-Americans with Early Rheumatoid Arthritis (*CLEAR*) Registry and Repository, supported by the National Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases (*NIAMS*), was established in 2000 to provide a resource for the scientific community to explore genetic and non-genetic factors affecting rheumatoid arthritis (*RA*) occurrence and outcomes in African Americans. The long term objective is a database and a repository of 1,100 RA and 550 matched healthy African-American subjects. This CLEAR Registry and Repository has two arms: a longitudinal arm for subjects with early RA (enrollment from 2000 to 2005) and a cross-sectional arm for subjects with any disease duration (enrollment from 2006 to 2012). CLEAR has two components: a database and a repository. The database contains extensive demographic, socioeconomic, clinical and radiographic (radiographs of hands and feet) information and bone mineral density data from DEXA scans. The repository contains genomic DNA, plasma and serum on most of the participants. Participants in CLEAR II had RNA isolated from peripheral blood cells.

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dbGaP study = phs001360

Palavras-chave

  1. 28/02/2023 28/02/2023 - Simon Heim
Titular dos direitos

S. Louis Bridges, Jr., MD, PhD, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA

Transferido a

28 de fevereiro de 2023

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    dbGaP phs001360 Genome-Wide Association Study in African-Americans with RA

    This subject phenotype table contains subject IDs, sex, Rheumatoid Arthritis (RA) onset age, age at baseline, disease duration, height, weight, cyclic citrullinated peptide (CCP) and rheumatoid factor (RF) IgM status, smoking tobacco and drinking alcohol status, medication and steroid use history, and RA status.

    pht006295
    Descrição

    pht006295

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3846158
    De-identified Subject ID
    Descrição

    SUBJECT_ID

    Tipo de dados

    string

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C4684638
    UMLS CUI [1,2]
    C2348585
    Participant Gender
    Descrição

    Sex

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0079399
    Rheumatoid Arthritis (RA) onset age
    Descrição

    AgeRA

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
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    Alias
    UMLS CUI [1,1]
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    UMLS CUI [1,2]
    C0206132
    years
    Age at baseline
    Descrição

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    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • years
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0001779
    UMLS CUI [1,2]
    C1442488
    years
    Disease duration at baseline visit
    Descrição

    DisDurMonths

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • months
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C1442488
    UMLS CUI [1,2]
    C0545082
    UMLS CUI [1,3]
    C0872146
    months
    Height measured at enrollment
    Descrição

    Height

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • inches
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0005890
    UMLS CUI [1,2]
    C1442488
    inches
    Subject's weight
    Descrição

    Weight

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • pounds
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0005910
    pounds
    CCP positivity
    Descrição

    CCP_status

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C5676688
    RF positivity
    Descrição

    RFIgM_status

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0035448
    Smoke tobacco or other substance
    Descrição

    SmokingStatus

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0543414
    UMLS CUI [1,2]
    C0848734
    Drink alcohol
    Descrição

    Alcohol

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0001948
    Medication use history
    Descrição

    MedUse

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0262926
    UMLS CUI [1,2]
    C0013227
    Steroid use history
    Descrição

    SteroidBL

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
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    UMLS CUI [1,2]
    C0262926
    RA or not RA
    Descrição

    Status

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0003873

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    This subject phenotype table contains subject IDs, sex, Rheumatoid Arthritis (RA) onset age, age at baseline, disease duration, height, weight, cyclic citrullinated peptide (CCP) and rheumatoid factor (RF) IgM status, smoking tobacco and drinking alcohol status, medication and steroid use history, and RA status.

    Name
    Tipo
    Description | Question | Decode (Coded Value)
    Tipo de dados
    Alias
    Item Group
    pht006295
    C3846158 (UMLS CUI [1,1])
    SUBJECT_ID
    Item
    De-identified Subject ID
    string
    C4684638 (UMLS CUI [1,1])
    C2348585 (UMLS CUI [1,2])
    Item
    Participant Gender
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    C0079399 (UMLS CUI [1,1])
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    Participant Gender
    CL Item
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    AgeRA
    Item
    Rheumatoid Arthritis (RA) onset age
    float
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    Code List
    CCP positivity
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    CL Item
    positive (POS)
    CL Item
    unknown (UNK)
    Item
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    Code List
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    CL Item
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    C0003873 (UMLS CUI [1,1])
    Code List
    RA or not RA
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    Control (1)
    C3274648 (UMLS CUI [1,1])
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    Case (2)
    C3274647 (UMLS CUI [1,1])

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