ID

45626

Descrizione

Principal Investigator: S. Louis Bridges, Jr., MD, PhD, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA MeSH: Arthritis, Rheumatoid https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs001360 The Consortium for the Longitudinal Evaluation of African-Americans with Early Rheumatoid Arthritis (*CLEAR*) Registry and Repository, supported by the National Institute of Arthritis and Musculoskeletal and Skin Diseases (*NIAMS*), was established in 2000 to provide a resource for the scientific community to explore genetic and non-genetic factors affecting rheumatoid arthritis (*RA*) occurrence and outcomes in African Americans. The long term objective is a database and a repository of 1,100 RA and 550 matched healthy African-American subjects. This CLEAR Registry and Repository has two arms: a longitudinal arm for subjects with early RA (enrollment from 2000 to 2005) and a cross-sectional arm for subjects with any disease duration (enrollment from 2006 to 2012). CLEAR has two components: a database and a repository. The database contains extensive demographic, socioeconomic, clinical and radiographic (radiographs of hands and feet) information and bone mineral density data from DEXA scans. The repository contains genomic DNA, plasma and serum on most of the participants. Participants in CLEAR II had RNA isolated from peripheral blood cells.

collegamento

dbGaP study = phs001360

Keywords

  1. 28/02/23 28/02/23 - Simon Heim
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S. Louis Bridges, Jr., MD, PhD, University of Alabama at Birmingham, Birmingham, AL, USA

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28 febbraio 2023

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dbGaP phs001360 Genome-Wide Association Study in African-Americans with RA

This subject phenotype table contains subject IDs, sex, Rheumatoid Arthritis (RA) onset age, age at baseline, disease duration, height, weight, cyclic citrullinated peptide (CCP) and rheumatoid factor (RF) IgM status, smoking tobacco and drinking alcohol status, medication and steroid use history, and RA status.

pht006295
Descrizione

pht006295

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified Subject ID
Descrizione

SUBJECT_ID

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C2348585
Participant Gender
Descrizione

Sex

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0079399
Rheumatoid Arthritis (RA) onset age
Descrizione

AgeRA

Tipo di dati

float

Unità di misura
  • years
Alias
UMLS CUI [1,1]
C0003873
UMLS CUI [1,2]
C0206132
years
Age at baseline
Descrizione

AgeScreen

Tipo di dati

float

Unità di misura
  • years
Alias
UMLS CUI [1,1]
C0001779
UMLS CUI [1,2]
C1442488
years
Disease duration at baseline visit
Descrizione

DisDurMonths

Tipo di dati

float

Unità di misura
  • months
Alias
UMLS CUI [1,1]
C1442488
UMLS CUI [1,2]
C0545082
UMLS CUI [1,3]
C0872146
months
Height measured at enrollment
Descrizione

Height

Tipo di dati

float

Unità di misura
  • inches
Alias
UMLS CUI [1,1]
C0005890
UMLS CUI [1,2]
C1442488
inches
Subject's weight
Descrizione

Weight

Tipo di dati

float

Unità di misura
  • pounds
Alias
UMLS CUI [1,1]
C0005910
pounds
CCP positivity
Descrizione

CCP_status

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C5676688
RF positivity
Descrizione

RFIgM_status

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0035448
Smoke tobacco or other substance
Descrizione

SmokingStatus

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0543414
UMLS CUI [1,2]
C0848734
Drink alcohol
Descrizione

Alcohol

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0001948
Medication use history
Descrizione

MedUse

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0262926
UMLS CUI [1,2]
C0013227
Steroid use history
Descrizione

SteroidBL

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0281991
UMLS CUI [1,2]
C0262926
RA or not RA
Descrizione

Status

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0003873

Similar models

This subject phenotype table contains subject IDs, sex, Rheumatoid Arthritis (RA) onset age, age at baseline, disease duration, height, weight, cyclic citrullinated peptide (CCP) and rheumatoid factor (RF) IgM status, smoking tobacco and drinking alcohol status, medication and steroid use history, and RA status.

Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
pht006295
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SUBJECT_ID
Item
De-identified Subject ID
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Item
Participant Gender
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C0079399 (UMLS CUI [1,1])
Code List
Participant Gender
CL Item
Male (1)
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CL Item
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Rheumatoid Arthritis (RA) onset age
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Height
Item
Height measured at enrollment
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Item
CCP positivity
text
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Code List
CCP positivity
CL Item
negative (NEG)
CL Item
positive (POS)
CL Item
unknown (UNK)
Item
RF positivity
text
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Code List
RF positivity
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negative (NEG)
CL Item
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CL Item
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SmokingStatus
Item
Smoke tobacco or other substance
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Alcohol
Item
Drink alcohol
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Item
RA or not RA
text
C0003873 (UMLS CUI [1,1])
Code List
RA or not RA
CL Item
Control (1)
C3274648 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Case (2)
C3274647 (UMLS CUI [1,1])

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