ID

45534

Descrição

Principal Investigator: Ranjan Deka, PhD, University of Cincinnati, Cincinnati, OH, USA MeSH: Metabolic Syndrome X,Diabetes mellitus type 2,Hypertension, Essential,Dyslipidemia,Coronary Heart Disease,Gout https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000737 The major objective of this study was to conduct a systematic genetic study of metabolic traits involved in metabolic syndrome through collection and analysis of epidemiological, demographic, environmental, and relevant biological and clinical data from a relatively isolated island population of the eastern Adriatic coast of Croatia. The population was chosen for the following reasons: 1) in spite of practicing a largely traditional life style and dietary habits, high rates of obesity, arterial hypertension, dyslipidemia and related metabolic abnormalities were found in previous studies; 2) the population was established by a relatively small number of founders, predominantly of Slavic descent from the mainland during 15th to 18th century AD, a genetically homogeneous population living in a homogeneous environment; 3) sharing a common European ancestry, a relevant population for study in the context of the general US population; 4) Croatian collaborators have been conducting anthropological and genetic studies in these communities for over three decades. There were two major aims of the study: 1) to recruit ~1200 adult participants and collect blood samples together with demographic, anthropometric, environmental and clinical data from the island of Hvar; to perform biochemical tests to measure glucose, insulin, uric acid and lipid levels; 2) conduct a genome-wide association analysis of metabolic traits and phenotypes using genome-wide SNP arrays (Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 5.0).

Link

dbGaP-study=phs000737

Palavras-chave

Versões (1)
  1. 28/12/2022 28/12/2022 - Chiara Middel
Titular dos direitos

Ranjan Deka, PhD, University of Cincinnati, Cincinnati, OH, USA

Transferido a

28 de dezembro de 2022

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dbGaP phs000737 NIDDK Genetics of Metabolic Syndrome in an Island Population

Inglês

The dataset provides medical history information (e.g. diagnoses of coronary heart disease, diabetes, gout, metabolic syndrom x, age of diagnosis, etc.), blood test values (n=11 variables, e.g. creatinin, glucose, HbA1c, insulin, lipids, uric acid), bloaad pressure, body structure measurements (n=13 variables, e.g. BMI, height, waist, weight, waist-to-hip ratio, biceps and abdominal skinfold thickness), and basic socio-demographic data.

6 Formulários  
pht004446
Descrição

pht004446

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
Subject ID
Descrição

SUBJECT_ID

Tipo de dados

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Alias
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Descrição

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Descrição

age

Tipo de dados

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Unidades de medida
  • Years
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Descrição

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Unidades de medida
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Descrição

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Tipo de dados

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Unidades de medida
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Descrição

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Unidades de medida
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Descrição

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Alias
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Descrição

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Unidades de medida
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Average diastolic blood pressure 2nd and 3rd measurements (mmHg)
Descrição

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Tipo de dados

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Unidades de medida
  • mmHg
Alias
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C1510992
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Upper arm circumference
Descrição

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Tipo de dados

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Unidades de medida
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Descrição

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Tipo de dados

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Unidades de medida
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Descrição

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Tipo de dados

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Triceps skin fold thickness
Descrição

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Descrição

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Descrição

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Descrição

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  • mm
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mm
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Descrição

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Tipo de dados

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Unidades de medida
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Acidum uricum
Descrição

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Tipo de dados

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umol/L
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Descrição

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Descrição

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Tipo de dados

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Descrição

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Tipo de dados

text

Unidades de medida
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text

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Descrição

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Descrição

HbA1c

Tipo de dados

text

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Descrição

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Tipo de dados

text

Unidades de medida
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Descrição

Fibrinogen

Tipo de dados

text

Unidades de medida
  • g/L
Alias
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g/L
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HBP

Tipo de dados

text

Alias
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Descrição

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Tipo de dados

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Tipo de dados

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Descrição

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Tipo de dados

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Alias
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Descrição

CHD

Tipo de dados

text

Alias
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Tipo de dados

text

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  • Years
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Tipo de dados

text

Alias
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Tipo de dados

text

Alias
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Diabetes (Do you have diabetes?) in original data: 1 = yes, 2 = no
Descrição

Diab

Tipo de dados

text

Alias
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C0011849
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Descrição

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Tipo de dados

text

Unidades de medida
  • Years
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C0011849
Years
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Descrição

Diab_yr

Tipo de dados

text

Alias
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C0439234
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C0011849
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Tipo de dados

text

Alias
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Gout

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Alias
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Gout_age

Tipo de dados

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  • Years
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Tipo de dados

text

Alias
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Gout (medications) in original data
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Gout_med

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0018099
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C0013227
Medications relevant for high cholesterol/triglycerides, low HDL, cardiovascular diseases, hypertension, and diabetes
Descrição

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Tipo de dados

text

Alias
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C0013227
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Treatment code: T = triglycerides, H = HDL, B = hypertension, C = cardiovascular diseases, D = diabetes
Descrição

MedCode

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
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C0041004
UMLS CUI [1,3]
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Number of abnormal MS components by Adult Treatment Panel (ATP) - III definition
Descrição

ATP_no

Tipo de dados

text

Alias
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Descrição

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Tipo de dados

text

Alias
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Number of abnormal MS components by International Diabetes Federation (IF) - 2005 definition
Descrição

IDF_no

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1265611
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C0205161
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C0524620
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C1705248
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Descrição

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Tipo de dados

text

Alias
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C0524620
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C0016617
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C1704788
Is MS record complete? (i.e., all 5 MS component variables contain non-blank data) 1= no, 2 = yes
Descrição

Comp

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205197
UMLS CUI [1,2]
C0034869
UMLS CUI [1,3]
C0524620
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The dataset provides medical history information (e.g. diagnoses of coronary heart disease, diabetes, gout, metabolic syndrom x, age of diagnosis, etc.), blood test values (n=11 variables, e.g. creatinin, glucose, HbA1c, insulin, lipids, uric acid), bloaad pressure, body structure measurements (n=13 variables, e.g. BMI, height, waist, weight, waist-to-hip ratio, biceps and abdominal skinfold thickness), and basic socio-demographic data.

6 Formulários
Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht004446
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CHD (Do you have coronary heart disease?) in original data: 1 = yes, 2 = no
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Item
CHD (Age of diagnosis) in original data
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Item
CHD (Year of diagnosis) in original data
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Item
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Code List
Diabetes (Do you have diabetes?) in original data: 1 = yes, 2 = no
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C3274647 (UMLS CUI [1,1])
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Item
Diabetes (Age of diagnosis) in original data
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C0001779 (UMLS CUI [1,1])
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Item
Diabetes (Year of diagnosis) in original data
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Item
Diabetes (medications) in original data
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Gout
Code List
Gout (Do you have gout?) in original data: 1 = yes, 2 = no
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UNAFFECTED (1)
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C3274647 (UMLS CUI [1,1])
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Item
Gout (Age of diagnosis) in original data
text
C0001779 (UMLS CUI [1,1])
C2316983 (UMLS CUI [1,2])
C0018099 (UMLS CUI [1,3])
Gout_yr
Item
Gout (Year of diagnosis) in original data
text
C0439234 (UMLS CUI [1,1])
C0011900 (UMLS CUI [1,2])
C0018099 (UMLS CUI [1,3])
Gout_med
Item
Gout (medications) in original data
text
C0018099 (UMLS CUI [1,1])
C0013227 (UMLS CUI [1,2])
MedDesp
Item
Medications relevant for high cholesterol/triglycerides, low HDL, cardiovascular diseases, hypertension, and diabetes
text
C0013227 (UMLS CUI [1,1])
C2347946 (UMLS CUI [1,2])
C0020557 (UMLS CUI [1,3])
C0020443 (UMLS CUI [1,4])
C0151691 (UMLS CUI [1,5])
C0007222 (UMLS CUI [1,6])
C0020538 (UMLS CUI [1,7])
C0011849 (UMLS CUI [1,8])
MedCode
Item
Treatment code: T = triglycerides, H = HDL, B = hypertension, C = cardiovascular diseases, D = diabetes
text
C5237013 (UMLS CUI [1,1])
C0041004 (UMLS CUI [1,2])
C0062152 (UMLS CUI [1,3])
C0007222 (UMLS CUI [1,4])
C0020538 (UMLS CUI [1,5])
C0011849 (UMLS CUI [1,6])
ATP_no
Item
Number of abnormal MS components by Adult Treatment Panel (ATP) - III definition
text
C1265611 (UMLS CUI [1,1])
C0205161 (UMLS CUI [1,2])
C0524620 (UMLS CUI [1,3])
C1705248 (UMLS CUI [1,4])
C3166873 (UMLS CUI [1,5])
Item
MS by Adult Treatment Panel (ATP) - III
text
C0524620 (UMLS CUI [1,1])
C3166873 (UMLS CUI [1,2])
ATP
Code List
MS by Adult Treatment Panel (ATP) - III
CL Item
UNAFFECTED (1)
C3274648 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
AFFECTED (2)
C3274647 (UMLS CUI [1,1])
IDF_no
Item
Number of abnormal MS components by International Diabetes Federation (IF) - 2005 definition
text
C1265611 (UMLS CUI [1,1])
C0205161 (UMLS CUI [1,2])
C0524620 (UMLS CUI [1,3])
C1705248 (UMLS CUI [1,4])
C0016617 (UMLS CUI [1,5])
C1704788 (UMLS CUI [1,6])
Item
MS by International Diabetes Federation (IDF) - 2005
text
C0524620 (UMLS CUI [1,1])
C0016617 (UMLS CUI [1,2])
C1704788 (UMLS CUI [1,3])
IDF
Code List
MS by International Diabetes Federation (IDF) - 2005
CL Item
UNAFFECTED (1)
C3274648 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
AFFECTED (2)
C3274647 (UMLS CUI [1,1])
Item
Is MS record complete? (i.e., all 5 MS component variables contain non-blank data) 1= no, 2 = yes
text
C0205197 (UMLS CUI [1,1])
C0034869 (UMLS CUI [1,2])
C0524620 (UMLS CUI [1,3])
Comp
Code List
Is MS record complete? (i.e., all 5 MS component variables contain non-blank data) 1= no, 2 = yes
CL Item
NO (1)
CL Item
YES (2)
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