ID

45530

Beschreibung

Principal Investigator: Priscilla Brastianos, Broad Institute, Cambridge, MA, USA MeSH: Neoplasms https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000730 Brain metastases are the most frequently occurring intracranial tumors in adults. Median survival after the diagnosis of a brain metastasis is in the order of a few months. Despite its large burden of disease and devastating clinical sequelae, we continue to have a limited understanding of the molecular mechanisms driving brain metastasis. We subjected 86 trios consisting of primary tumor, brain metastasis, and matched normal tissue to whole exome sequencing (WES). To analyze the data, we developed novel computational tools to perform an integrative analysis of somatic single nucleotide variants (SSNVs) and somatic copy-number alterations (SCNAs). This analysis allowed us to estimate the clonal architecture of the primary and metastatic samples of each patient, and to reconstruct a phylogenetic tree relating all of the subclones.

Link

dbGaP study = phs000730

Stichworte

  1. 28.12.22 28.12.22 - Simon Heim
Rechteinhaber

Priscilla Brastianos, Broad Institute, Cambridge, MA, USA

Hochgeladen am

28. Dezember 2022

DOI

Für eine Beantragung loggen Sie sich ein.

Lizenz

Creative Commons BY 4.0

Modell Kommentare :

Hier können Sie das Modell kommentieren. Über die Sprechblasen an den Itemgruppen und Items können Sie diese spezifisch kommentieren.

Itemgroup Kommentare für :

Item Kommentare für :


Keine Kommentare

Um Formulare herunterzuladen müssen Sie angemeldet sein. Bitte loggen Sie sich ein oder registrieren Sie sich kostenlos.

dbGaP phs000730 Genomics of Brain Metastases

Subject - Consent Information

pht005058
Beschreibung

pht005058

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158 (Other Coding)
LOINC
LA4728-7
Subject ID
Beschreibung

SUBJID

Datentyp

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2348585 (Clinical Trial Subject Unique Identifier)
Consent group as determined by DAC
Beschreibung

CONSENT

Datentyp

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0021430 (Informed Consent)
UMLS CUI [1,2]
C0441833 (Groups)
SNOMED
246261001

Ähnliche Modelle

Subject - Consent Information

Name
Typ
Description | Question | Decode (Coded Value)
Datentyp
Alias
Item Group
pht005058
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SUBJID
Item
Subject ID
string
C2348585 (UMLS CUI [1,1])
Item
Consent group as determined by DAC
text
C0021430 (UMLS CUI [1,1])
C0441833 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Consent group as determined by DAC
CL Item
General Research Use (GRU) (1)
C0021430 (UMLS CUI [1,1])
C0242481 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Disease-Specific (Cancer Research and Methods) (DS-CRM) (2)
CL Item
General Research Use (NPU) (GRU-NPU) (3)
C0021430 (UMLS CUI [1,1])
C0242481 (UMLS CUI [1,2])

Benutzen Sie dieses Formular für Rückmeldungen, Fragen und Verbesserungsvorschläge.

Mit * gekennzeichnete Felder sind notwendig.

Benötigen Sie Hilfe bei der Suche? Um mehr Details zu erfahren und die Suche effektiver nutzen zu können schauen Sie sich doch das entsprechende Video auf unserer Tutorial Seite an.

Zum Video