0 Avaliações

ID

45474

Descrição

Principal Investigator: E. Ann Coleman, University of Arkansas for Medical Sciences Little Rock, Arkansas, USA MeSH: Multiple Myeloma https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000545 We hypothesized that genetic variability in the enzymes/proteins involved in drug metabolism, inflammation, and immune function is a major underlying contributor to mucositis incidence and progression and that, based on this variability we can identify variants that influence risk, and develop a mucositis progression prediction model that improves on existing models by incorporating genetic variability along with clinical factors. Using genome wide association study (GWAS) combined with a pathway candidate gene approach and a modified case-control study method, we investigated the hypothesis in a sample of 1092 patients who received a myeloablative dose of melphalan (MEL) followed by autologous hematopoietic stem cell (ASCT) transplantation as treatment for multiple myeloma and for whom banked blood stem cell samples and clinical data were available.

Link

dbGap study = phs000545

Palavras-chave

  1. 2022-10-31 2022-10-31 - Simon Heim
  2. 2022-12-13 2022-12-13 - Kristina Keller
Titular dos direitos

E. Ann Coleman, University of Arkansas for Medical Sciences Little Rock, Arkansas, USA

Transferido a

13 december 2022

DOI

Para um pedido faça login.

Licença

Creative Commons BY 4.0

Comentários do modelo :

Aqui pode comentar o modelo. Pode comentá-lo especificamente através dos balões de texto nos grupos de itens e itens.

Comentários do grupo de itens para :

Comentários do item para :


    Sem comentários

    Para descarregar formulários, precisa de ter uma sessão iniciada. Por favor faça login ou registe-se gratuitamente.

    dbGaP phs000545 Predicting Chemotherapy-Induced Mucositis with Genetic and Clinical Factors

    Subject ID, age, type of cancer, BMI, body surface area, weight, gender, race, hematocrit, hemoglobin, GFR, creatinine, albumin, c-reactive protein, Melphelan dose, beta-microglobulin, myeloma isotype, mucositis grade, and CMV of participants involved in the "Predicting Chemotherapy-Induced Mucositis with Genetic and Clinical Factors" project.

    pht003764
    Descrição

    pht003764

    De-identified ID
    Descrição

    PublicID

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C4684638
    UMLS CUI [1,2]
    C2348585
    Age at treatment (years)
    Descrição

    age

    Tipo de dados

    text

    Unidades de medida
    • Years
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C4085942
    Years
    Type of cancer
    Descrição

    cancertype

    Tipo de dados

    string

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C4743729
    Body Mass Index (kg/m**2)
    Descrição

    bmi

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • kg/m**2
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C1305855
    kg/m**2
    Body surface area (m**2)
    Descrição

    bsa

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • m**2
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0005902
    m**2
    Weight (kgs)
    Descrição

    wt_kg

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • kg
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0005910
    kg
    Gender
    Descrição

    gender

    Tipo de dados

    string

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0079399
    Race
    Descrição

    race

    Tipo de dados

    string

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0034510
    Hematocrit (%)
    Descrição

    hct

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • %
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0518014
    %
    Hemoglobin (g/dL)
    Descrição

    hb

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • g/dL
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0019046
    UMLS CUI [1,2]
    C1274040
    UMLS CUI [1,3]
    C0022885
    UMLS CUI [1,4]
    C1522609
    g/dL
    Estimated GFR (ml/min)
    Descrição

    est_gfr

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • ml/min
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3811844
    ml/min
    Serum creatinine (mg/dL)
    Descrição

    cr

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • mg/dL
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0600061
    mg/dL
    Creatinine Clearance (ml/min)
    Descrição

    crcl

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • ml/min
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0373595
    ml/min
    Albumin (g/dL)
    Descrição

    alb

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • g/dL
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0363885
    g/dL
    C-reactive protein (mg/L)
    Descrição

    crp

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • mg/L
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0006560
    mg/L
    Melphelan dose (mg/kg)
    Descrição

    mg_kg

    Tipo de dados

    float

    Unidades de medida
    • mg/kg
    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0025241
    UMLS CUI [1,2]
    C3174092
    mg/kg
    Beta-microglobulin
    Descrição

    b2m

    Tipo de dados

    float

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0201910
    Myeloma Isotype
    Descrição

    isotype

    Tipo de dados

    string

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0026764
    UMLS CUI [1,2]
    C0021017
    Upper GI mucositis grade
    Descrição

    ugr

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0521585
    UMLS CUI [1,2]
    C3203348
    Lower GI mucositis grade
    Descrição

    lgr

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0521585
    UMLS CUI [1,2]
    C0226875
    Presence of C. difficile
    Descrição

    cdiff

    Tipo de dados

    string

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C4687402
    CMV reactive
    Descrição

    cmv_rea

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0010825
    UMLS CUI [1,2]
    C0205332
    CMV serostatus
    Descrição

    cmv_sero

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0582172
    Upper GI mucositis case control
    Descrição

    case_control_upperGI

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C3203348
    UMLS CUI [1,2]
    C0521585
    UMLS CUI [1,3]
    C0872128
    Lower GI mucositis case control
    Descrição

    case_control_lowerGI

    Tipo de dados

    text

    Alias
    UMLS CUI [1,1]
    C0226875
    UMLS CUI [1,2]
    C0521585
    UMLS CUI [1,3]
    C0872128

    Similar models

    Subject ID, age, type of cancer, BMI, body surface area, weight, gender, race, hematocrit, hemoglobin, GFR, creatinine, albumin, c-reactive protein, Melphelan dose, beta-microglobulin, myeloma isotype, mucositis grade, and CMV of participants involved in the "Predicting Chemotherapy-Induced Mucositis with Genetic and Clinical Factors" project.

    Name
    Tipo
    Description | Question | Decode (Coded Value)
    Tipo de dados
    Alias
    Item Group
    pht003764
    PublicID
    Item
    De-identified ID
    text
    C4684638 (UMLS CUI [1,1])
    C2348585 (UMLS CUI [1,2])
    age
    Item
    Age at treatment (years)
    text
    C4085942 (UMLS CUI [1,1])
    cancertype
    Item
    Type of cancer
    string
    C4743729 (UMLS CUI [1,1])
    bmi
    Item
    Body Mass Index (kg/m**2)
    float
    C1305855 (UMLS CUI [1,1])
    bsa
    Item
    Body surface area (m**2)
    float
    C0005902 (UMLS CUI [1,1])
    wt_kg
    Item
    Weight (kgs)
    float
    C0005910 (UMLS CUI [1,1])
    gender
    Item
    Gender
    string
    C0079399 (UMLS CUI [1,1])
    race
    Item
    Race
    string
    C0034510 (UMLS CUI [1,1])
    hct
    Item
    Hematocrit (%)
    float
    C0518014 (UMLS CUI [1,1])
    hb
    Item
    Hemoglobin (g/dL)
    float
    C0019046 (UMLS CUI [1,1])
    C1274040 (UMLS CUI [1,2])
    C0022885 (UMLS CUI [1,3])
    C1522609 (UMLS CUI [1,4])
    est_gfr
    Item
    Estimated GFR (ml/min)
    float
    C3811844 (UMLS CUI [1,1])
    cr
    Item
    Serum creatinine (mg/dL)
    float
    C0600061 (UMLS CUI [1,1])
    crcl
    Item
    Creatinine Clearance (ml/min)
    float
    C0373595 (UMLS CUI [1,1])
    alb
    Item
    Albumin (g/dL)
    float
    C0363885 (UMLS CUI [1,1])
    crp
    Item
    C-reactive protein (mg/L)
    float
    C0006560 (UMLS CUI [1,1])
    mg_kg
    Item
    Melphelan dose (mg/kg)
    float
    C0025241 (UMLS CUI [1,1])
    C3174092 (UMLS CUI [1,2])
    b2m
    Item
    Beta-microglobulin
    float
    C0201910 (UMLS CUI [1,1])
    isotype
    Item
    Myeloma Isotype
    string
    C0026764 (UMLS CUI [1,1])
    C0021017 (UMLS CUI [1,2])
    ugr
    Item
    Upper GI mucositis grade
    text
    C0521585 (UMLS CUI [1,1])
    C3203348 (UMLS CUI [1,2])
    lgr
    Item
    Lower GI mucositis grade
    text
    C0521585 (UMLS CUI [1,1])
    C0226875 (UMLS CUI [1,2])
    cdiff
    Item
    Presence of C. difficile
    string
    C4687402 (UMLS CUI [1,1])
    Item
    CMV reactive
    text
    C0010825 (UMLS CUI [1,1])
    C0205332 (UMLS CUI [1,2])
    Code List
    CMV reactive
    CL Item
    Not done (ND)
    CL Item
    Negative (NEG)
    CL Item
    Positive (POS)
    Item
    CMV serostatus
    text
    C0582172 (UMLS CUI [1,1])
    Code List
    CMV serostatus
    CL Item
    Negative (NEG)
    CL Item
    Positive (POS)
    case_control_upperGI
    Item
    Upper GI mucositis case control
    text
    C3203348 (UMLS CUI [1,1])
    C0521585 (UMLS CUI [1,2])
    C0872128 (UMLS CUI [1,3])
    case_control_lowerGI
    Item
    Lower GI mucositis case control
    text
    C0226875 (UMLS CUI [1,1])
    C0521585 (UMLS CUI [1,2])
    C0872128 (UMLS CUI [1,3])

    Do you need help on how to use the search function? Please watch the corresponding tutorial video for more details and learn how to use the search function most efficiently.

    Watch Tutorial