ID
45242
Beskrivning
Principal Investigator: James Versalovic, MD, PhD, Baylor College of Medicine, Texas Children's Hospital, Houston, TX, USA MeSH: Irritable Bowel Syndrome,Digestive System Diseases,Abdominal Pain https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000265 This project explores the nature of the human intestinal microbiome in healthy children and children with recurrent abdominal pain. The overall goal is to obtain a robust knowledge-base of the intestinal microbiome in children without evidence of pain or gastrointestinal disease, children with functional abdominal pain, and children with abdominal pain and changes in bowel habits (irritable bowel syndrome). Multiple strategies have been deployed to navigate and understand the nature of the intestinal microbiome in childhood. These strategies include 454 pyrosequencing-based strategies to sequence 16S rRNA genes and understand the detailed composition of microbes in healthy and disease groups. Microarray-based hybridization with the PhyloChip and quantitative real-time PCR (qPCR) probes are being applied as complementary strategies to gain an understanding of the intestinal microbiome from various perspectives. Data collected and analyzed during the HMP UH2 and UH3 Demo project, from a set of healthy and IBS children may enable the identification of core microbiomes in children in addition to variable components that may distinguish healthy from diseased pediatric states. We are currently analyzing the dataset for the presence of disease-specific signatures in the human microbiome, and correlating these microbial signatures with pediatric health or IBS disease status. This study explores the nature of core and variable human microbiomes in pre-adolescent healthy children and children with recurrent abdominal pain.
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Versioner (2)
- 2022-07-13 2022-07-13 - Dr. Christian Niklas
- 2022-10-12 2022-10-12 - Adrian Schulz
Rättsinnehavare
James Versalovic, MD, PhD, Baylor College of Medicine, Texas Children's Hospital, Houston, TX, USA
Uppladdad den
12 oktober 2022
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dbGaP phs000265 The Human Gut Microbiome and Recurrent Abdominal Pain in Children
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- StudyEvent: SEV1
- Eligibility Criteria
- HMP_Pediatric_Abdominal_Pain_IBD - Consent Group Information
- HMP_Pediatric_Abdominal_Pain_IBD Sample - Subject Mapping
- The data set provides information about the presence and degree of abdominal pain, presence and type of bowel movements, in addition to affection status and basic demographic information. Data of n=9 variables have been added (variables names are: PERC_IBSM_A; PERC_IBSU_A; %recsucro; %reclactul; %recmann; %recsucral; #_Days_No_bm; Mean_#_bm/da; Perc_Watery_A), and variable=Perc_Diarrhea_A, is no longer included in the data set.
- The data set provides information about samples, e.g. 454 library name, 454 sff file name.
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- StudyEvent: SEV1
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- HMP_Pediatric_Abdominal_Pain_IBD - Consent Group Information
- HMP_Pediatric_Abdominal_Pain_IBD Sample - Subject Mapping
- The data set provides information about the presence and degree of abdominal pain, presence and type of bowel movements, in addition to affection status and basic demographic information. Data of n=9 variables have been added (variables names are: PERC_IBSM_A; PERC_IBSU_A; %recsucro; %reclactul; %recmann; %recsucral; #_Days_No_bm; Mean_#_bm/da; Perc_Watery_A), and variable=Perc_Diarrhea_A, is no longer included in the data set.
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