ID

44998

Descrizione

Principal Investigator: Ulrike Peters, PhD, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA, USA MeSH: Colorectal Neoplasms,Sequence Analysis, DNA https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000410 This project was designed to use next generation sequencing technology to screen the protein coding regions of the genome for low frequency variants in a panel of high-risk colorectal adenocarcinoma cases. Blood and cell-line DNA for colorectal cancer patients and a subset of quality control samples that had existing whole exome sequence data were analyzed using Illumina HiSeq sequencers. Samples from this project were from participants in the Women's Health Initiative (WHI) and the Diet, Activity, and Lifestyle Study (DALS).

collegamento

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000410

Keywords

  1. 01/07/22 01/07/22 - Dr. Christian Niklas
  2. 12/10/22 12/10/22 - Adrian Schulz
Titolare del copyright

Ulrike Peters, PhD, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA, USA

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1 luglio 2022

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dbGaP phs000410 Whole Exome Sequencing for Colorectal Cancer

Subject ID, case or control status, age, race, sex, and family history of colorectal cancer among participants involved in the "Whole Exome Sequencing for Colorectal Cancer" project.

pht002450
Descrizione

pht002450

Unique subject ID
Descrizione

gecco_id

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2348585
Age at reference
Descrizione

age

Tipo di dati

text

Unità di misura
  • Years old
Alias
UMLS CUI [1,1]
C0001779
Years old
Case or control status
Descrizione

caco

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1706256
UMLS CUI [1,2]
C0449438
UMLS CUI [2,1]
C0009932
UMLS CUI [2,2]
C0449438
Gender of participant
Descrizione

sex

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0079399
Race of participant [white]
Descrizione

race

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0034510
Whether participant has a positive family history of colorectal cancer
Descrizione

famhx

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0241889
UMLS CUI [1,2]
C0009402

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Subject ID, case or control status, age, race, sex, and family history of colorectal cancer among participants involved in the "Whole Exome Sequencing for Colorectal Cancer" project.

Name
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Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
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Item
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Item
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