ID

38702

Beschrijving

The usefulness of biomaterial depends to a large extent on the associated data. Therefore the UMG (Universitätsmedizin Göttingen) Biobank recommends to collect a minimum data set for each biomaterial. It should be noted that the available data set contains only minimal information. In addition, the collection of further data may be necessary, depending on the research purpose. The UMG Biobank is not responsible for the collection of a patient's clinical information. Advice on the collection of data is expressly recommended. This document contains the minimum data set for the use of biomaterial. Note: The is not an official translation. The original form language is German.

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  1. 30-10-19 30-10-19 -
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  3. 30-10-19 30-10-19 - Sarah Riepenhausen
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UMG Biobank

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30 oktober 2019

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Minimal data set for biomaterial, UMG Biobank

Minimal data set for biomaterial

Minimaldatensatz für Biomaterial
Beschrijving

Minimaldatensatz für Biomaterial

Alias
UMLS CUI-1
C1524031
UMLS CUI-2
C0150098
UMLS CUI-3
C0005479
Geschlecht
Beschrijving

Sex

Datatype

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0079399
Geburtsjahr
Beschrijving

Year of birth

Datatype

partialDate

Alias
UMLS CUI [1]
C2826771
Informationen zum Status der Einwilligung
Beschrijving

Information on the status of consent

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1]
C0021430
Hauptdiagnose ICD-10
Beschrijving

Sollte es sich dabei um eine Tumorentität handeln, bitte die Itemgruppe "Tumorentitäten" zusätzlich ausfüllen.

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1]
C2598420
Datum der Probenentnahme
Beschrijving

Tag Monat Jahr. Wird in Starlims, dem Biomaterialverwaltungssystem der UMG Biobank erfasst.

Datatype

date

Alias
UMLS CUI [1]
C1302413
Biomaterialtyp
Beschrijving

Wird in Starlims, dem Biomaterialverwaltungssystem der UMG Biobank erfasst.

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0005479
UMLS CUI [1,2]
C0332307
Lagerort der Probe
Beschrijving

Wird in Starlims, dem Biomaterialverwaltungssystem der UMG Biobank erfasst.

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0337174
UMLS CUI [1,2]
C0370003
Qualität der Probe
Beschrijving

Anzugeben in der SPREC-Kodierung (Standard Preanalytischer Code). Wird in Starlims, dem Biomaterialverwaltungssystem der UMG Biobank erfasst.

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0332306
UMLS CUI [1,2]
C0370003
Volumen de Probe
Beschrijving

Wird in Starlims, dem Biomaterialverwaltungssystem der UMG Biobank erfasst. Bitte im nachfolgendem Item zusätzlich die Einheit des Volumens angeben.

Datatype

float

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2700258
UMLS CUI [1,2]
C0370003
Einheit des Volumens
Beschrijving

Unit of volume

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1519795
UMLS CUI [1,2]
C2700258
Tumorentitäten
Beschrijving

Tumorentitäten

Alias
UMLS CUI-1
C0006826
Tumorentität
Beschrijving

Tumor entity

Datatype

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0006826
Histologie
Beschrijving

Histology

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1]
C0449574
Staging
Beschrijving

Staging

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1]
C3258246
Lokalisation des Primärtumors/ der Metastase
Beschrijving

Localisation of primary tumor

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475264
UMLS CUI [1,2]
C0677930
Lokalisation des Primärtumors/ der Metastase
Beschrijving

Localisation of metastasis

Datatype

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475264
UMLS CUI [1,2]
C0027627

Similar models

Minimal data set for biomaterial

Name
Type
Description | Question | Decode (Coded Value)
Datatype
Alias
Item Group
Minimaldatensatz für Biomaterial
C1524031 (UMLS CUI-1)
C0150098 (UMLS CUI-2)
C0005479 (UMLS CUI-3)
Item
Geschlecht
integer
C0079399 (UMLS CUI [1])
Code List
Geschlecht
CL Item
Weiblich (1)
CL Item
Männlich (2)
CL Item
Unentschlossen (3)
Year of birth
Item
Geburtsjahr
partialDate
C2826771 (UMLS CUI [1])
Information on the status of consent
Item
Informationen zum Status der Einwilligung
text
C0021430 (UMLS CUI [1])
Principle diagnosis ICD-10
Item
Hauptdiagnose ICD-10
text
C2598420 (UMLS CUI [1])
Date of specimen collection
Item
Datum der Probenentnahme
date
C1302413 (UMLS CUI [1])
Type of biomaterial
Item
Biomaterialtyp
text
C0005479 (UMLS CUI [1,1])
C0332307 (UMLS CUI [1,2])
Specimen, Storage location
Item
Lagerort der Probe
text
C0337174 (UMLS CUI [1,1])
C0370003 (UMLS CUI [1,2])
Specimen quality
Item
Qualität der Probe
text
C0332306 (UMLS CUI [1,1])
C0370003 (UMLS CUI [1,2])
Specimen volume
Item
Volumen de Probe
float
C2700258 (UMLS CUI [1,1])
C0370003 (UMLS CUI [1,2])
Unit of volume
Item
Einheit des Volumens
text
C1519795 (UMLS CUI [1,1])
C2700258 (UMLS CUI [1,2])
Item Group
Tumorentitäten
C0006826 (UMLS CUI-1)
Item
Tumorentität
integer
C0006826 (UMLS CUI [1])
Code List
Tumorentität
CL Item
Primärtumor (1)
CL Item
Metastasen (2)
Histology
Item
Histologie
text
C0449574 (UMLS CUI [1])
Staging
Item
Staging
text
C3258246 (UMLS CUI [1])
Localisation of primary tumor
Item
Lokalisation des Primärtumors/ der Metastase
text
C0475264 (UMLS CUI [1,1])
C0677930 (UMLS CUI [1,2])
Localisation of metastasis
Item
Lokalisation des Primärtumors/ der Metastase
text
C0475264 (UMLS CUI [1,1])
C0027627 (UMLS CUI [1,2])

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