ID

30404

Description

Study part: Microbiology Findings. (1,3)-β-D-glucan-based diagnosis of invasive Candida infection versus culture-based diagnosis in patients with severe sepsis or septic shock and at high risk of invasive Candida infection (CandiSep). Provided by PD Dr. med. Frank Bloos, Ph.D. Clinic for Anesthesiology and Intensive care, University Clinic Jena.

Keywords

  1. 6/3/18 6/3/18 -
Copyright Holder

Clinic for Anesthesiology and Intensive care, University Clinic Jena

Uploaded on

June 3, 2018

DOI

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License

Creative Commons BY-NC 3.0

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Microbiology Findings CandiSep Anesthesiology and Intensive Care NCT02734550

Microbiology Findings

  1. StudyEvent: ODM
    1. Microbiology Findings
Mikrobiologische Ergebnisse
Description

Mikrobiologische Ergebnisse

Alias
UMLS CUI-1
C0587085
Patienten-ID:
Description

Patient ID

Data type

text

Alias
UMLS CUI [1]
C2348585
Datum
Description

Date

Data type

date

Alias
UMLS CUI [1]
C0011008
Abnahmezeitpunkt
Description

specimen collection time

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C4064021
Material/Entnahmeort
Description

Specimen collection; Anatomic site

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0200345
UMLS CUI [1,2]
C1515974
Erregernachweis
Description

Pathogen Detection

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C1740302
Je nach Erregergruppe folgende Tabellen ausfüllen!
Description

Je nach Erregergruppe folgende Tabellen ausfüllen!

Alias
UMLS CUI-1
C0450254
UMLS CUI-2
C0243095
Datum
Description

Date

Data type

date

Alias
UMLS CUI [1]
C0011008
Material/Entnahmeort
Description

Specimen collection; Anatomic site

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0200345
UMLS CUI [1,2]
C1515974
Pilze (Einfachauswahl)
Description

Fungi

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0016832
Hefen, non-Candida
Description

Yeasts

Data type

text

Alias
UMLS CUI [1]
C0043393
Aspergillus spp.
Description

Aspergillus

Data type

text

Alias
UMLS CUI [1]
C0004034
Resistenz- testung erfolgt
Description

Drug Resistance, Fungal

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0949686
Amphotericin B
Description

Amphotericin B

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0002679
Anidulafungin
Description

Anidulafungin

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C1142738
Caspofungin
Description

Caspofungin

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0537894
Micafungin
Description

Micafungin

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C1120386
Fluconazol
Description

Fluconazole

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0016277
Itraconazol
Description

Itraconazole

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0064113
Posaconazol
Description

posaconazole

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0936148
Voriconazol
Description

voriconazole

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0393080
Fluorocytosin
Description

Flucytosine

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0016278
Für jede Mibi Kultur eine neue Zeile anlegen (Mehrfachauswahl bei Erregern).
Description

Für jede Mibi Kultur eine neue Zeile anlegen (Mehrfachauswahl bei Erregern).

Alias
UMLS CUI-1
C1254760
Datum
Description

Date

Data type

date

Alias
UMLS CUI [1]
C0011008
Material/Entnahmeort
Description

Specimen collection; Anatomic site

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0200345
UMLS CUI [1,2]
C1515974
Grampositive Aerobier, Gramnegative Aerobier, Anaerobier, Mycobakterien und atypische Erreger, Parasiten (Mehrfachauswahl)
Description

Pathogen | Bacteria, Aerobic | Bacteria, Anaerobic

Data type

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0004613
Parasiten (Plasmodium falciparum, Pneumocystis carinii, Toxoplasma gondii, etc.)
Description

Parasites Plasmodium falciparum Pneumocystis carinii Toxoplasma gondii

Data type

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0030498
UMLS CUI [1,2]
C0024535
UMLS CUI [1,3]
C0032276
UMLS CUI [1,4]
C0040557

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Microbiology Findings

  1. StudyEvent: ODM
    1. Microbiology Findings
Name
Type
Description | Question | Decode (Coded Value)
Data type
Alias
Item Group
Mikrobiologische Ergebnisse
C0587085 (UMLS CUI-1)
Patient ID
Item
Patienten-ID:
text
C2348585 (UMLS CUI [1])
Date
Item
Datum
date
C0011008 (UMLS CUI [1])
Item
Abnahmezeitpunkt
integer
C4064021 (UMLS CUI [1])
Code List
Abnahmezeitpunkt
CL Item
vor/nach Randomisierung (0)
CL Item
Tag 1  (1)
CL Item
Tag 7 (7)
CL Item
Tag 14 (14)
CL Item
Andere  (99)
Item
Material/Entnahmeort
integer
C0200345 (UMLS CUI [1,1])
C1515974 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Material/Entnahmeort
CL Item
Nase/Rachen (1)
C3536612 (UMLS CUI-1)
C0580344 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Haut (Axillar-Region) (2)
C0222146 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Rektalabstrich/Stuhl (3)
C0444214 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Urin (4)
C0042036 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Trachealsekret (5)
C1532372 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
BAL (6)
C1535502 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Blutkultur (7)
C0200949 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Blut/Serum (AG-Nachweis) (8)
C0003320 (UMLS CUI-1)
C0178913 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Punktat Pleura (9)
C0370199 (UMLS CUI-1)
C0032225 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Punktat Abdomen (10)
C1546644 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Liquor (11)
C0007806 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Wundabstrich (12)
C0444086 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Gewebe (13)
C0040300 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Implantate (ZVK, etc.) (14)
C0021102 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
intraoperativer Abstrich (15)
C1261188 (UMLS CUI-1)
C0456904 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
Item
Erregernachweis
integer
C1740302 (UMLS CUI [1])
Code List
Erregernachweis
CL Item
nein (0)
CL Item
ja (1)
Item Group
Je nach Erregergruppe folgende Tabellen ausfüllen!
C0450254 (UMLS CUI-1)
C0243095 (UMLS CUI-2)
Date
Item
Datum
date
C0011008 (UMLS CUI [1])
Item
Material/Entnahmeort
integer
C0200345 (UMLS CUI [1,1])
C1515974 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Material/Entnahmeort
CL Item
Nase/Rachen (1)
C3536612 (UMLS CUI-1)
C0580344 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Haut (Axillar-Region) (2)
C0222146 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Rektalabstrich/Stuhl (3)
C0444214 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Urin (4)
C0042036 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Trachealsekret (5)
C1532372 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
BAL (6)
C1535502 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Blutkultur (7)
C0200949 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Blut/Serum (AG-Nachweis) (8)
C0003320 (UMLS CUI-1)
C0178913 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Punktat Pleura (9)
C0370199 (UMLS CUI-1)
C0032225 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Punktat Abdomen (10)
C1546644 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Liquor (11)
C0007806 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Wundabstrich (12)
C0444086 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Gewebe (13)
C0040300 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Implantate (ZVK, etc.) (14)
C0021102 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
intraoperativer Abstrich (15)
C1261188 (UMLS CUI-1)
C0456904 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
Item
Pilze (Einfachauswahl)
integer
C0016832 (UMLS CUI [1])
Code List
Pilze (Einfachauswahl)
CL Item
Candida albicans (501)
C0006837 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Candida glabrata (502)
C0319899 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Candida parapsilosis (503)
C0319878 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Candida tropicalis (504)
C0319882 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Candida krusei (505)
C4274365 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Candida, andere Spezies (506)
C1319242 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Hefen, non-Candida (507)
C0043393 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Aspergillus spp. (508)
C0004034 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
andere Pilze (Cryptoccus neoformans, Histoplasma spp., etc.) (509)
C0319941 (UMLS CUI-1)
C0010416 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
Yeasts
Item
Hefen, non-Candida
text
C0043393 (UMLS CUI [1])
Aspergillus
Item
Aspergillus spp.
text
C0004034 (UMLS CUI [1])
Item
Resistenz- testung erfolgt
integer
C0949686 (UMLS CUI [1])
Code List
Resistenz- testung erfolgt
CL Item
nein (0)
CL Item
ja (1)
Item
Amphotericin B
integer
C0002679 (UMLS CUI [1])
Code List
Amphotericin B
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Anidulafungin
integer
C1142738 (UMLS CUI [1])
Code List
Anidulafungin
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Caspofungin
integer
C0537894 (UMLS CUI [1])
Code List
Caspofungin
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Micafungin
integer
C1120386 (UMLS CUI [1])
Code List
Micafungin
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Fluconazol
integer
C0016277 (UMLS CUI [1])
Code List
Fluconazol
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Itraconazol
integer
C0064113 (UMLS CUI [1])
Code List
Itraconazol
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Posaconazol
integer
C0936148 (UMLS CUI [1])
Code List
Posaconazol
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Voriconazol
integer
C0393080 (UMLS CUI [1])
Code List
Voriconazol
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item
Fluorocytosin
integer
C0016278 (UMLS CUI [1])
Code List
Fluorocytosin
CL Item
sensibel (1)
(Comment:de)
CL Item
intermediär (2)
(Comment:de)
CL Item
resistent (3)
(Comment:de)
CL Item
nicht getestet (9)
(Comment:de)
Item Group
Für jede Mibi Kultur eine neue Zeile anlegen (Mehrfachauswahl bei Erregern).
C1254760 (UMLS CUI-1)
Date
Item
Datum
date
C0011008 (UMLS CUI [1])
Item
Material/Entnahmeort
integer
C0200345 (UMLS CUI [1,1])
C1515974 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Material/Entnahmeort
CL Item
Nase/Rachen (1)
C3536612 (UMLS CUI-1)
C0580344 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Haut (Axillar-Region) (2)
C0222146 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Rektalabstrich/Stuhl (3)
C0444214 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Urin (4)
C0042036 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Trachealsekret (5)
C1532372 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
BAL (6)
C1535502 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Blutkultur (7)
C0200949 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Blut/Serum (AG-Nachweis) (8)
C0003320 (UMLS CUI-1)
C0178913 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Punktat Pleura (9)
C0370199 (UMLS CUI-1)
C0032225 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Punktat Abdomen (10)
C1546644 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Liquor (11)
C0007806 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Wundabstrich (12)
C0444086 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Gewebe (13)
C0040300 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Implantate (ZVK, etc.) (14)
C0021102 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
intraoperativer Abstrich (15)
C1261188 (UMLS CUI-1)
C0456904 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
Item
Grampositive Aerobier, Gramnegative Aerobier, Anaerobier, Mycobakterien und atypische Erreger, Parasiten (Mehrfachauswahl)
integer
C0004613 (UMLS CUI [1])
Code List
Grampositive Aerobier, Gramnegative Aerobier, Anaerobier, Mycobakterien und atypische Erreger, Parasiten (Mehrfachauswahl)
CL Item
Staphylococcus aureus, Oxacillin/Methicillin-sensitiv (101)
C1635274 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Staphylococcus aureus, Methicillin/multi-resistent (MRSA) (102)
C0343401 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
koagulasenegative Staphylokokken (S. epidermidis, S.haemolyticus, S. hominis, etc.), Methicillin-sensitiv (103)
C0445625 (UMLS CUI-1)
C0362412 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
koagulasenegative Staphylokokken (S. epidermidis, S.haemolyticus, S. hominis, etc.), Methicillin-resistent (104)
C0445625 (UMLS CUI-1)
C1955827 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Enterococcus faecalis (1051)
C0038404 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Enterococcus faecium (1052)
C0085495 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Enterokokken, Vancomycin-resistent (VRE) (106)
C1265175 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Streptokokken der A-, B-, C- oder G-Gruppe (107)
C0038402 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Streptococcus pneumoniae (108)
C0038410 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
andere Streptokokken (S. mutans, andere Viridans-Streptokokken) (110)
C0205394 (UMLS CUI-1)
C0038402 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
andere aerobe grampositive Bakterien (Bacillus spp, Corynebacterium .spp., Lactobacillus,Listerien, Nocardia spp, andere) (111)
C0004612 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Escherichia coli (201)
C0014834 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Enterobacter (E. aerogenes, E. cloacae, E. agglomerans, etc.) (202)
C0014344 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Klebsiellen (Klebsiella pneumoniae, etc.) (203)
C0022727 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Proteus (Proteus / Morganella morganii, Proteus (indolpositiv), Proteus mirabilis, Providencia stuartii, Providencia spp.) (204)
C0033697 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Serratia (Serratia marcescens, Serratia spp.) (205)
C0036766 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Citrobacter (Citrobacter freundii, Citrobacter spp.) (206)
C0008862 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Pseudomonas spp. (207)
C0033808 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Stenotrophomonas maltophilia (208)
C0318290 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Acinetobacter (A. baumanii, A. calcoaceticus, A. iwoffi, etc.) (209)
C0001138 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Haemophilus (H. influenzae etc.) (210)
C0018483 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Enterobakterien, andere (Yersinia spp, Shigella spp, andere) (211)
C0043405 (UMLS CUI-1)
C0036953 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
andere gramnegative Bakterien (212)
C0018150 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Clostridium spp., Actinomyces, Propionibacterium (301)
C0001250 (UMLS CUI-1)
C0079134 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Anaerobe Kokken (Peptococcus, Peptostreptoccus, Veillonella) (302)
C0030965 (UMLS CUI-1)
C0042446 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
gramnegative Anaerobier (Bacteroides fragilis, Bacteroidesmelaninogenicus, Capnocytophaga, Fusobacterium spp., etc.) (303)
C0018149 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Actinomyces (304)
C0001250 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
andere Anaerobier (Propionibakterien) (305)
C0033476 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Mycobakterien, Chlamydien, Mycoplasmen und andere atypische Erreger (401)
C0008148 (UMLS CUI-1)
C0026912 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Parasiten (Plasmodium falciparum, Pneumocystis carinii, Toxoplasma gondii, etc.) (601)
C0040557 (UMLS CUI-1)
C0032150 (UMLS CUI-2)
C0032276 (UMLS CUI-3)
(Comment:de)
Parasites Plasmodium falciparum Pneumocystis carinii Toxoplasma gondii
Item
Parasiten (Plasmodium falciparum, Pneumocystis carinii, Toxoplasma gondii, etc.)
text
C0030498 (UMLS CUI [1,1])
C0024535 (UMLS CUI [1,2])
C0032276 (UMLS CUI [1,3])
C0040557 (UMLS CUI [1,4])

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