Inglês

This sample attributes table contains sample IDs, body site, analyte type, bacterial species (n=7 variables; salmonella, campylobacter, enteroaggregative E. coli, diffusely adherent E. coli, atypical enteropathic E. coli, enteroinvasive E. coli, and enterotoxigenic E. coli), norovirus genotypes G1 and G2, astrovirus, adenovirus, and name of the center which conducted sequencing.

5 Formulários  
pht006054
Descrição

pht006054

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
Sample ID
Descrição

SAMPLE_ID

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1299222
Body Site
Descrição

BODY_SITE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1515974
Analyte Type
Descrição

ANALYTE_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4744818
Salmonella
Descrição

SALM

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0036111
Campylobacter
Descrição

CAMP

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0006813
Enteroaggregative E. coli
Descrição

EAEC

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0872165
Diffusely adherent E. coli
Descrição

DAEC

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1562804
Atypical Enteropathic E. coli
Descrição

AEPEC

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0856436
UMLS CUI [1,2]
C0205182
Enteroinvasive E. coli
Descrição

EIEC

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0580795
Enterotoxigenic E. coli
Descrição

ETEC

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0580797
Norovirus Genotype G1
Descrição

NOROVIRUS_G1

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2709163
Norovirus Genotype G2
Descrição

NOROVIRUS_G2

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2709164
Astrovirus
Descrição

ASTROVIRUS

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0004120
Adenovirus
Descrição

ADENOVIRUS

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0001483
Sequencing Center
Descrição

SEQUENCING_CENTER

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C5667250
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This sample attributes table contains sample IDs, body site, analyte type, bacterial species (n=7 variables; salmonella, campylobacter, enteroaggregative E. coli, diffusely adherent E. coli, atypical enteropathic E. coli, enteroinvasive E. coli, and enterotoxigenic E. coli), norovirus genotypes G1 and G2, astrovirus, adenovirus, and name of the center which conducted sequencing.

5 Formulários
Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht006054
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
Sample ID
text
C1299222 (UMLS CUI [1,1])
BODY_SITE
Item
Body Site
string
C1515974 (UMLS CUI [1,1])
ANALYTE_TYPE
Item
Analyte Type
string
C4744818 (UMLS CUI [1,1])
Item
Salmonella
text
C0036111 (UMLS CUI [1,1])
SALM
Code List
Salmonella
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Campylobacter
text
C0006813 (UMLS CUI [1,1])
CAMP
Code List
Campylobacter
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Enteroaggregative E. coli
text
C0872165 (UMLS CUI [1,1])
EAEC
Code List
Enteroaggregative E. coli
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Diffusely adherent E. coli
text
C1562804 (UMLS CUI [1,1])
DAEC
Code List
Diffusely adherent E. coli
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Atypical Enteropathic E. coli
text
C0856436 (UMLS CUI [1,1])
C0205182 (UMLS CUI [1,2])
AEPEC
Code List
Atypical Enteropathic E. coli
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Enteroinvasive E. coli
text
C0580795 (UMLS CUI [1,1])
EIEC
Code List
Enteroinvasive E. coli
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Enterotoxigenic E. coli
text
C0580797 (UMLS CUI [1,1])
ETEC
Code List
Enterotoxigenic E. coli
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Norovirus Genotype G1
text
C2709163 (UMLS CUI [1,1])
NOROVIRUS_G1
Code List
Norovirus Genotype G1
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Norovirus Genotype G2
text
C2709164 (UMLS CUI [1,1])
NOROVIRUS_G2
Code List
Norovirus Genotype G2
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Astrovirus
text
C0004120 (UMLS CUI [1,1])
ASTROVIRUS
Code List
Astrovirus
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
Item
Adenovirus
text
C0001483 (UMLS CUI [1,1])
ADENOVIRUS
Code List
Adenovirus
CL Item
Negative (0)
CL Item
Positive (1)
SEQUENCING_CENTER
Item
Sequencing Center
string
C5667250 (UMLS CUI [1,1])
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