Liver biopsy

  1. StudyEvent: ODM
    1. Liver biopsy
Administrative data
Descrizione

Administrative data

Alias
UMLS CUI-1
C1320722
Subject number
Descrizione

Subject number

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1]
C2348585
Liver biopsy
Descrizione

Liver biopsy

Alias
UMLS CUI-1
C0193388
Date of liver biopsy
Descrizione

day month year

Tipo di dati

date

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0193388
UMLS CUI [1,2]
C0011008
Approximate size of liver biopsy
Descrizione

Size of liver biopsy

Tipo di dati

integer

Unità di misura
  • mm
Alias
UMLS CUI [1,1]
C1299482
UMLS CUI [1,2]
C0193388
mm
Biopsy size unit
Descrizione

In the original form this item is hidden.

Tipo di dati

integer

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1299482
UMLS CUI [1,2]
C0193388
UMLS CUI [1,3]
C1519795
Final diagnosis
Descrizione

Final diagnosis

Alias
UMLS CUI-1
C1546485
Normal
Descrizione

Normal

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0205307
Acute hepatitis
Descrizione

Acute hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0267797
Chronic hepatitis
Descrizione

Chronic hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0019189
Cholestatic hepatitis
Descrizione

Cholestatic hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0149904
Drug-induced cholestasis
Descrizione

Drug-induced cholestasis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C2062350
Acute viral hepatitis
Descrizione

Acute viral hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0276622
Chronic viral hepatitis
Descrizione

Chronic viral hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0276623
Drug-induced hepatitis
Descrizione

Drug-induced hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1262760
Autoimmune hepatitis
Descrizione

Autoimmune hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0241910
Bridging necrosis
Descrizione

Bridging necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0333511
Submassive hepatic necrosis
Descrizione

Submassive hepatic necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0151798
Massive hepatic necrosis
Descrizione

Massive hepatic necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0001364
Steatosis - microvesicular
Descrizione

Steatosis - microvesicular

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1850415
Steatosis - macrovesicular
Descrizione

Steatosis - macrovesicular

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1837256
Steatosis - mixed
Descrizione

Steatosis - mixed

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0015695
UMLS CUI [1,2]
C0205430
Non-alcoholic steatohepatitis
Descrizione

Non-alcoholic steatohepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C3241937
Alcoholic hepatitis
Descrizione

Alcoholic hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0019187
Hepatic granulomas
Descrizione

Hepatic granulomas

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0745754
Sarcoidosis
Descrizione

Sarcoidosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0036202
Fibrosis
Descrizione

Fibrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0239946
Cirrhosis
Descrizione

Cirrhosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0023890
Primary biliary cirrhosis
Descrizione

Primary biliary cirrhosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0008312
Primary sclerosing cholangitis
Descrizione

Primary sclerosing cholangitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0566602
Autoimmune overlap syndrome
Descrizione

Autoimmune overlap syndrome

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C2702837
Hemochromatosis
Descrizione

Hemochromatosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0018995
Alpha-1-antitrypsin deficiency
Descrizione

Alpha-1-antitrypsin deficiency

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0221757
Wilson's disease
Descrizione

Wilson's disease

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0019202
Veno-occlusive disease
Descrizione

Veno-occlusive disease

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0948441
Budd-Chiari syndrome
Descrizione

Budd-Chiari syndrome

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0856761
Neoplasia
Descrizione

Neoplasia

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1882062
UMLS CUI [1,2]
C0023884
Other final diagnosis
Descrizione

Other final diagnosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0011900
If other final diagnosis, please specify
Descrizione

Other final diagnosis specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0011900
Liver Architecture
Descrizione

Liver Architecture

Alias
UMLS CUI-1
C0023884
UMLS CUI-2
C0935919
UMLS CUI-3
C0193388
Normal
Descrizione

Normal

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0205307
Bridging fibrosis
Descrizione

Bridging fibrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0334160
Diffuse fibrosis
Descrizione

Diffuse fibrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0016059
UMLS CUI [1,2]
C0205219
Nodular regenerative hyperplasia
Descrizione

Nodular regenerative hyperplasia

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0020510
Congenital hepatic fibrosis
Descrizione

Congenital hepatic fibrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0009714
Cirrhosis
Descrizione

Cirrhosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0023890
Centrilobular congestion
Descrizione

Centrilobular congestion

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0267821
UMLS CUI [1,2]
C0442080
Endophlebitis
Descrizione

Endophlebitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0014234
Veno-occlusive disease
Descrizione

Veno-occlusive disease

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0948441
Canalicular cholestasis
Descrizione

Canalicular cholestasis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C3150342
Apoptosis
Descrizione

Apoptosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0162638
Focal (or spotty or mild ) hepatocellular necrosis
Descrizione

Focal hepatocellular necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0267800
lnterface hepatitis (periportal hepatitis or piecemeal necrosis)
Descrizione

lnterface hepatitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0019158
UMLS CUI [1,2]
C0333515
lschaemic necrosis
Descrizione

lschaemic necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C3887513
Centrolobular (Zone 3) necrosis
Descrizione

Centrolobular (Zone 3) necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C3672032
Focal coagulative necrosis
Descrizione

Focal coagulative necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205234
UMLS CUI [1,2]
C1522058
Centrolobular (Zone 3) coagulative necrosis
Descrizione

Centrolobular (Zone 3) coagulative necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0682619
UMLS CUI [1,2]
C1522058
Bridging hepatocellular necrosis
Descrizione

Bridging hepatocellular necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1855038
UMLS CUI [1,2]
C0333511
Massive or panlobular hepatocellular necrosis
Descrizione

Massive or panlobular hepatocellular necrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0522501
UMLS CUI [1,2]
C1855038
UMLS CUI [2,1]
C0442131
UMLS CUI [2,2]
C1855038
Dysplasia liver
Descrizione

Dysplasia liver

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0334044
UMLS CUI [1,2]
C0023884
Neoplasia liver
Descrizione

Neoplasia liver

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1882062
UMLS CUI [1,2]
C0023884
Other liver architecture
Descrizione

Other liver architecture

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0023884
UMLS CUI [1,3]
C0935919
If other liver architecture, please specify
Descrizione

Other liver architecture specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0023884
UMLS CUI [1,3]
C0935919
Description of Liver Cells or Hepatocytes
Descrizione

Description of Liver Cells or Hepatocytes

Alias
UMLS CUI-1
C0227525
UMLS CUI-2
C0678257
UMLS CUI-3
C0193388
Normal
Descrizione

Normal

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0205307
Ballooning
Descrizione

Ballooning

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0333445
UMLS CUI [1,2]
C0227525
Acidophilic
Descrizione

Acidophilic

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0333931
UMLS CUI [1,2]
C0227525
Pseudoxanthomatous
Descrizione

Pseudoxanthomatous

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0227525
UMLS CUI [1,2]
C3277905
Multinucleated giant hepatocytes
Descrizione

Multinucleated giant hepatocytes

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3550474
UMLS CUI [1,2]
C4054455
Other Description of Liver Cells or Hepatocytes
Descrizione

Other Description of Liver Cells or Hepatocytes

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C0678257
If other Description of Liver Cells or Hepatocytes, please specify
Descrizione

Other Description of Liver Cells or Hepatocytes specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C0678257
Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles
Descrizione

Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles

Alias
UMLS CUI-1
C0227525
UMLS CUI-2
C0042219
UMLS CUI-3
C1512693
UMLS CUI-4
C0193388
No inclusions
Descrizione

No inclusions

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1512693
UMLS CUI [1,2]
C1298908
Macrovesicular steatosis
Descrizione

Macrovesicular steatosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1837256
Microvesicular steatosis
Descrizione

Microvesicular steatosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1850415
Bile accumulation
Descrizione

Bile accumulation

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C3686784
Diastase-resistant, PAS-positive cytoplasmic inclusions
Descrizione

Diastase-resistant, PAS-positive cytoplasmic inclusions

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1856311
UMLS CUI [1,2]
C0205708
Alpha-1-antitrypsin inclusions
Descrizione

Alpha-1-antitrypsin inclusions

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0002191
UMLS CUI [1,2]
C1512693
UMLS CUI [1,3]
C0227525
Megamitochondria
Descrizione

Megamitochondria

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0544931
Mallory bodies
Descrizione

Mallory bodies

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0333744
Ground Glass inclusions
Descrizione

Ground Glass inclusions

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0598786
Lipofuscin pigment
Descrizione

Lipofuscin pigment

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0023789
Hemosiderin granules
Descrizione

Hemosiderin granules

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0019113
Orcein-positive cytoplasmin granules
Descrizione

Orcein-positive cytoplasmin granules

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0069596
Protoporphyrin crystals (birefringent under polarised light)
Descrizione

Protoporphyrin crystals

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0033733
Uroporphyrin crystals (red fluorescence under ultraviolet light)
Descrizione

Uroporphyrin crystals

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0042093
Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles
Descrizione

Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C0042219
UMLS CUI [2,1]
C0205394
UMLS CUI [2,2]
C1512693
If other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles, please specify
Descrizione

Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C0042219
UMLS CUI [2,1]
C0205394
UMLS CUI [2,2]
C1512693
Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities
Descrizione

Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities

Alias
UMLS CUI-1
C0227525
UMLS CUI-2
C1849376
UMLS CUI-3
C0193388
None abnormality
Descrizione

None abnormality

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0549184
UMLS CUI [1,2]
C1704258
Hepatocellular mitosis
Descrizione

Hepatocellular mitosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0026255
UMLS CUI [1,2]
C2697585
Binucleated or multinucleated hepatocytes
Descrizione

Binucleated or multinucleated hepatocytes

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0333909
UMLS CUI [2]
C4054455
CMV inclusion bodies
Descrizione

CMV inclusion bodies

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0010825
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C1512693
HSV inclusions
Descrizione

HSV inclusions

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0319232
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C1512693
Varicella inclusions
Descrizione

Varicella inclusions

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0740380
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C1512693
Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities
Descrizione

Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C1849376
If other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities, please sepcify
Descrizione

Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0227525
UMLS CUI [1,3]
C1849376
Liver or Lobular Infiltrates
Descrizione

Liver or Lobular Infiltrates

Alias
UMLS CUI-1
C1400896
UMLS CUI-2
C0193388
None Liver or Lobular Infiltrates
Descrizione

None Liver or Lobular Infiltrates

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0549184
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Eosinophils
Descrizione

Eosinophils

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0014467
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Lymphocytes
Descrizione

Lymphocytes

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0024264
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Plasma cells
Descrizione

Plasma cells

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0032112
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Neutrophils
Descrizione

Neutrophils

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0027950
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Macrophages and proliferating Kupffer cells
Descrizione

Macrophages and proliferating Kupffer cells

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0022801
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Granulomas
Descrizione

Granulomas

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0745754
Other Liver or Lobular Infiltrates
Descrizione

Other Liver or Lobular Infiltrates

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C1400896
If Other Liver or Lobular Infiltrates, please specify
Descrizione

Other Liver or Lobular Infiltrates specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C1400896
Portal Tract Inflammation
Descrizione

Portal Tract Inflammation

Alias
UMLS CUI-1
C3854488
UMLS CUI-2
C0193388
None Portal Tract Inflammation
Descrizione

None Portal Tract Inflammation

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1298908
UMLS CUI [1,2]
C3854488
Eosinophils
Descrizione

Eosinophils

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0014467
UMLS CUI [1,2]
C3854488
Lymphoid aggregates and/or follicles
Descrizione

Lymphoid aggregates and/or follicles

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0229653
UMLS CUI [1,2]
C3854488
Plasma cells
Descrizione

Plasma cells

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0032112
UMLS CUI [1,2]
C3854488
Neutrophils
Descrizione

Neutrophils

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0027950
UMLS CUI [1,2]
C3854488
Histocytes and macrophages
Descrizione

Histocytes and macrophages

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0019612
UMLS CUI [2]
C0024432
UMLS CUI [3]
C3854488
Other Portal Tract Inflammation
Descrizione

Other Portal Tract Inflammation

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C3854488
If Other Portal Tract Inflammation, please specify
Descrizione

Other Portal Tract Inflammation specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C3854488
Bile Ducts
Descrizione

Bile Ducts

Alias
UMLS CUI-1
C0005400
UMLS CUI-2
C0193388
Normal bile ducts
Descrizione

Normal bile ducts

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205307
UMLS CUI [1,2]
C0005400
Proliferation of bile ducts (bile ductular reaction)
Descrizione

Proliferation of bile ducts

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0005400
UMLS CUI [1,2]
C0334094
Dilation, degeneration or disruption of portal bile ducts
Descrizione

Dilation, degeneration or disruption of portal bile ducts

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0005400
UMLS CUI [2,1]
C0011164
UMLS CUI [2,2]
C0005400
UMLS CUI [3,1]
C0700124
UMLS CUI [3,2]
C0005400
UMLS CUI [4,1]
C0332453
UMLS CUI [4,2]
C0005400
Paucity of bile ducts
Descrizione

Paucity of bile ducts

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C4273160
Periductal fibrosis
Descrizione

Periductal fibrosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0016059
UMLS CUI [1,2]
C0005400
Other Bile Ducts
Descrizione

Other Bile Ducts

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0005400
If other Bile Ducts, please specify
Descrizione

Other Bile Ducts specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0005400
Portal veins
Descrizione

Portal veins

Alias
UMLS CUI-1
C0032718
UMLS CUI-2
C0193388
Normal
Descrizione

Normal

Tipo di dati

integer

Alias
UMLS CUI [1]
C0205307
Pyelophlebitis
Descrizione

Pyelophlebitis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1405883
Thrombosis, sclerosis or occlusion of portal vein
Descrizione

Thrombosis, sclerosis or occlusion of portal vein

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0155773
UMLS CUI [2]
C0400960
UMLS CUI [3,1]
C0028778
UMLS CUI [3,2]
C0032718
Neoplastic Invasion of portal vein
Descrizione

Neoplastic Invasion of portal vein

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0585133
Granulomatous compression of portal vein
Descrizione

Granulomatous compression of portal vein

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0032718
UMLS CUI [1,2]
C0439667
UMLS CUI [1,3]
C0728907
Other Portal Veins abnormality
Descrizione

Other Portal Veins abnormality

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0032718
UMLS CUI [1,3]
C0205161
If other Portal Veins abnormality, please specify
Descrizione

Other Portal Veins abnormality specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0032718
UMLS CUI [1,3]
C0205161
Liver Infections
Descrizione

Liver Infections

Alias
UMLS CUI-1
C1112211
UMLS CUI-2
C0193388
Normal
Descrizione

Normal

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0205307
Leishmaniasis donovani
Descrizione

Leishmaniasis donovani

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0023273
Plasmodium falciparum
Descrizione

Plasmodium falciparum

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0032150
Toxoplasmosis
Descrizione

Toxoplasmosis

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0040558
Cryptococcus neoformans
Descrizione

Cryptococcus neoformans

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0010416
Histoplasma capsulatum
Descrizione

Histoplasma capsulatum

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0319941
Mycobacterium tuberculois
Descrizione

Mycobacterium tuberculois

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0026926
Other mycobacterial species
Descrizione

Other mycobacterial species

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0026912
Other Liver Infections
Descrizione

Other Liver Infections

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C1112211
If Other Liver Infections, please specify
Descrizione

Other Liver Infections specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C1112211
Parasites or Ova
Descrizione

Parasites or Ova

Alias
UMLS CUI-1
C0030498
UMLS CUI-2
C1267673
UMLS CUI-3
C0023884
UMLS CUI-4
C0193388
None Parasites or ova
Descrizione

None Parasites or ova

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0549184
UMLS CUI [1,2]
C0030498
UMLS CUI [1,3]
C0023884
UMLS CUI [2,1]
C0549184
UMLS CUI [2,2]
C1267673
Schistosome and/or ova
Descrizione

Schistosome and/or ova

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0036315
UMLS CUI [2,1]
C1267673
UMLS CUI [2,2]
C0036315
Ascaris and/or ova
Descrizione

Ascaris and/or ova

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0003954
UMLS CUI [2]
C3698183
Toxocara and/or ova
Descrizione

Toxocara and/or ova

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0040550
UMLS CUI [2,1]
C1267673
UMLS CUI [2,2]
C0040550
Echinococcus cysts
Descrizione

Echinococcus cysts

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0013502
Hepatic capillariasis worms and/or ova
Descrizione

Hepatic capillariasis worms and/or ova

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0277202
UMLS CUI [2,1]
C1267673
UMLS CUI [2,2]
C0277202
Other Parasites or ova
Descrizione

Other Parasites or ova

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0030498
UMLS CUI [1,3]
C0023884
UMLS CUI [2,1]
C0205394
UMLS CUI [2,2]
C1267673
If Other Parasites or ova, please specify
Descrizione

Other Parasites or ova specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0030498
UMLS CUI [1,3]
C0023884
UMLS CUI [2,1]
C0205394
UMLS CUI [2,2]
C1267673
Histologic Staining or Additional Studies Obtained
Descrizione

Histologic Staining or Additional Studies Obtained

Alias
UMLS CUI-1
C0487602
UMLS CUI-2
C0430022
UMLS CUI-3
C0023884
UMLS CUI-4
C0193388
Haematoxylin and eosin (or H&E)
Descrizione

Haematoxylin and eosin (or H&E)

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0523207
Masson
Descrizione

Masson

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1294297
Toluidine blue or Giemsa
Descrizione

Toluidine blue or Giemsa

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0523203
UMLS CUI [2]
C0017542
Prussian blue
Descrizione

Prussian blue

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1294004
Periodic Acidic Schiff (PAS) with or without diastase
Descrizione

Periodic Acidic Schiff (PAS) with or without diastase

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0440048
UMLS CUI [2]
C0002712
Oil red O
Descrizione

Oil red O

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1294000
Congo red
Descrizione

Congo red

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0009742
Hall's stain
Descrizione

Hall's stain

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1720394
Gridley's stain
Descrizione

Gridley's stain

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1293978
Rhodanine (copper)
Descrizione

Rhodanine (copper)

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0035486
UMLS CUI [1,2]
C0487602
UMLS CUI [1,3]
C0009968
Rubeanic acid (copper)
Descrizione

Rubeanic acid (copper)

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0073680
UMLS CUI [1,2]
C0487602
UMLS CUI [1,3]
C0009968
Orcein, aldehyde fuchsin or Victoria blue
Descrizione

Orcein, aldehyde fuchsin or Victoria blue

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C1294001
UMLS CUI [2]
C0491984
UMLS CUI [3,1]
C0078232
UMLS CUI [3,2]
C0487602
Electron microscopy
Descrizione

Electron microscopy

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1]
C0026019
Hepatitis A lmmunostains positive
Descrizione

Hepatitis A lmmunostains positive

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0560226
UMLS CUI [1,2]
C3687908
Hepatitis B core antigen or hepatitis B surface antibody immunostains positive
Descrizione

Hepatitis B core antigen or hepatitis B surface antibody immunostains positive

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0149709
UMLS CUI [1,2]
C3687908
Hepatitis D immunostains
Descrizione

Hepatitis D immunostains

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0850990
UMLS CUI [1,2]
C0021044
UMLS CUI [1,3]
C3687908
Other immunostains
Descrizione

Other immunostains

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0021044
UMLS CUI [1,2]
C3687908
Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained
Descrizione

Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained

Tipo di dati

boolean

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0487602
UMLS CUI [1,3]
C0023884
If Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained, please specify
Descrizione

Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained specification

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0487602
UMLS CUI [1,3]
C0023884

Similar models

Liver biopsy

  1. StudyEvent: ODM
    1. Liver biopsy
Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
Administrative data
C1320722 (UMLS CUI-1)
Subject number
Item
Subject number
text
C2348585 (UMLS CUI [1])
Item Group
Liver biopsy
C0193388 (UMLS CUI-1)
Date of liver biopsy
Item
Date of liver biopsy
date
C0193388 (UMLS CUI [1,1])
C0011008 (UMLS CUI [1,2])
Size of liver biopsy
Item
Approximate size of liver biopsy
integer
C1299482 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Item
Biopsy size unit
integer
C1299482 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C1519795 (UMLS CUI [1,3])
Code List
Biopsy size unit
CL Item
MM (1)
Item Group
Final diagnosis
C1546485 (UMLS CUI-1)
Normal
Item
Normal
boolean
C0205307 (UMLS CUI [1])
Acute hepatitis
Item
Acute hepatitis
boolean
C0267797 (UMLS CUI [1])
Chronic hepatitis
Item
Chronic hepatitis
boolean
C0019189 (UMLS CUI [1])
Cholestatic hepatitis
Item
Cholestatic hepatitis
boolean
C0149904 (UMLS CUI [1])
Drug-induced cholestasis
Item
Drug-induced cholestasis
boolean
C2062350 (UMLS CUI [1])
Acute viral hepatitis
Item
Acute viral hepatitis
boolean
C0276622 (UMLS CUI [1])
Chronic viral hepatitis
Item
Chronic viral hepatitis
boolean
C0276623 (UMLS CUI [1])
Drug-induced hepatitis
Item
Drug-induced hepatitis
boolean
C1262760 (UMLS CUI [1])
Autoimmune hepatitis
Item
Autoimmune hepatitis
boolean
C0241910 (UMLS CUI [1])
Bridging necrosis
Item
Bridging necrosis
boolean
C0333511 (UMLS CUI [1])
Submassive hepatic necrosis
Item
Submassive hepatic necrosis
boolean
C0151798 (UMLS CUI [1])
Massive hepatic necrosis
Item
Massive hepatic necrosis
boolean
C0001364 (UMLS CUI [1])
Steatosis - microvesicular
Item
Steatosis - microvesicular
boolean
C1850415 (UMLS CUI [1])
Steatosis - macrovesicular
Item
Steatosis - macrovesicular
boolean
C1837256 (UMLS CUI [1])
Steatosis - mixed
Item
Steatosis - mixed
boolean
C0015695 (UMLS CUI [1,1])
C0205430 (UMLS CUI [1,2])
Non-alcoholic steatohepatitis
Item
Non-alcoholic steatohepatitis
boolean
C3241937 (UMLS CUI [1])
Alcoholic hepatitis
Item
Alcoholic hepatitis
boolean
C0019187 (UMLS CUI [1])
Hepatic granulomas
Item
Hepatic granulomas
boolean
C0745754 (UMLS CUI [1])
Sarcoidosis
Item
Sarcoidosis
boolean
C0036202 (UMLS CUI [1])
Fibrosis
Item
Fibrosis
boolean
C0239946 (UMLS CUI [1])
Cirrhosis
Item
Cirrhosis
boolean
C0023890 (UMLS CUI [1])
Primary biliary cirrhosis
Item
Primary biliary cirrhosis
boolean
C0008312 (UMLS CUI [1])
Primary sclerosing cholangitis
Item
Primary sclerosing cholangitis
boolean
C0566602 (UMLS CUI [1])
Autoimmune overlap syndrome
Item
Autoimmune overlap syndrome
boolean
C2702837 (UMLS CUI [1])
Hemochromatosis
Item
Hemochromatosis
boolean
C0018995 (UMLS CUI [1])
Alpha-1-antitrypsin deficiency
Item
Alpha-1-antitrypsin deficiency
boolean
C0221757 (UMLS CUI [1])
Wilson's disease
Item
Wilson's disease
boolean
C0019202 (UMLS CUI [1])
Veno-occlusive disease
Item
Veno-occlusive disease
boolean
C0948441 (UMLS CUI [1])
Budd-Chiari syndrome
Item
Budd-Chiari syndrome
boolean
C0856761 (UMLS CUI [1])
Neoplasia
Item
Neoplasia
boolean
C1882062 (UMLS CUI [1,1])
C0023884 (UMLS CUI [1,2])
Other final diagnosis
Item
Other final diagnosis
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0011900 (UMLS CUI [1,2])
Other final diagnosis specification
Item
If other final diagnosis, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0011900 (UMLS CUI [1,2])
Item Group
Liver Architecture
C0023884 (UMLS CUI-1)
C0935919 (UMLS CUI-2)
C0193388 (UMLS CUI-3)
Normal
Item
Normal
boolean
C0205307 (UMLS CUI [1])
Bridging fibrosis
Item
Bridging fibrosis
boolean
C0334160 (UMLS CUI [1])
Diffuse fibrosis
Item
Diffuse fibrosis
boolean
C0016059 (UMLS CUI [1,1])
C0205219 (UMLS CUI [1,2])
Nodular regenerative hyperplasia
Item
Nodular regenerative hyperplasia
boolean
C0020510 (UMLS CUI [1])
Congenital hepatic fibrosis
Item
Congenital hepatic fibrosis
boolean
C0009714 (UMLS CUI [1])
Cirrhosis
Item
Cirrhosis
boolean
C0023890 (UMLS CUI [1])
Centrilobular congestion
Item
Centrilobular congestion
boolean
C0267821 (UMLS CUI [1,1])
C0442080 (UMLS CUI [1,2])
Endophlebitis
Item
Endophlebitis
boolean
C0014234 (UMLS CUI [1])
Veno-occlusive disease
Item
Veno-occlusive disease
boolean
C0948441 (UMLS CUI [1])
Canalicular cholestasis
Item
Canalicular cholestasis
boolean
C3150342 (UMLS CUI [1])
Apoptosis
Item
Apoptosis
boolean
C0162638 (UMLS CUI [1])
Focal hepatocellular necrosis
Item
Focal (or spotty or mild ) hepatocellular necrosis
boolean
C0267800 (UMLS CUI [1])
lnterface hepatitis
Item
lnterface hepatitis (periportal hepatitis or piecemeal necrosis)
boolean
C0019158 (UMLS CUI [1,1])
C0333515 (UMLS CUI [1,2])
lschaemic necrosis
Item
lschaemic necrosis
boolean
C3887513 (UMLS CUI [1])
Centrolobular (Zone 3) necrosis
Item
Centrolobular (Zone 3) necrosis
boolean
C3672032 (UMLS CUI [1])
Focal coagulative necrosis
Item
Focal coagulative necrosis
boolean
C0205234 (UMLS CUI [1,1])
C1522058 (UMLS CUI [1,2])
Centrolobular (Zone 3) coagulative necrosis
Item
Centrolobular (Zone 3) coagulative necrosis
boolean
C0682619 (UMLS CUI [1,1])
C1522058 (UMLS CUI [1,2])
Bridging hepatocellular necrosis
Item
Bridging hepatocellular necrosis
boolean
C1855038 (UMLS CUI [1,1])
C0333511 (UMLS CUI [1,2])
Massive or panlobular hepatocellular necrosis
Item
Massive or panlobular hepatocellular necrosis
boolean
C0522501 (UMLS CUI [1,1])
C1855038 (UMLS CUI [1,2])
C0442131 (UMLS CUI [2,1])
C1855038 (UMLS CUI [2,2])
Dysplasia liver
Item
Dysplasia liver
boolean
C0334044 (UMLS CUI [1,1])
C0023884 (UMLS CUI [1,2])
Neoplasia liver
Item
Neoplasia liver
boolean
C1882062 (UMLS CUI [1,1])
C0023884 (UMLS CUI [1,2])
Other liver architecture
Item
Other liver architecture
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0023884 (UMLS CUI [1,2])
C0935919 (UMLS CUI [1,3])
Other liver architecture specification
Item
If other liver architecture, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0023884 (UMLS CUI [1,2])
C0935919 (UMLS CUI [1,3])
Item Group
Description of Liver Cells or Hepatocytes
C0227525 (UMLS CUI-1)
C0678257 (UMLS CUI-2)
C0193388 (UMLS CUI-3)
Normal
Item
Normal
boolean
C0205307 (UMLS CUI [1])
Ballooning
Item
Ballooning
boolean
C0333445 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
Acidophilic
Item
Acidophilic
boolean
C0333931 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
Pseudoxanthomatous
Item
Pseudoxanthomatous
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C3277905 (UMLS CUI [1,2])
Multinucleated giant hepatocytes
Item
Multinucleated giant hepatocytes
boolean
C3550474 (UMLS CUI [1,1])
C4054455 (UMLS CUI [1,2])
Other Description of Liver Cells or Hepatocytes
Item
Other Description of Liver Cells or Hepatocytes
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C0678257 (UMLS CUI [1,3])
Other Description of Liver Cells or Hepatocytes specification
Item
If other Description of Liver Cells or Hepatocytes, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C0678257 (UMLS CUI [1,3])
Item Group
Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles
C0227525 (UMLS CUI-1)
C0042219 (UMLS CUI-2)
C1512693 (UMLS CUI-3)
C0193388 (UMLS CUI-4)
No inclusions
Item
No inclusions
boolean
C1512693 (UMLS CUI [1,1])
C1298908 (UMLS CUI [1,2])
Macrovesicular steatosis
Item
Macrovesicular steatosis
boolean
C1837256 (UMLS CUI [1])
Microvesicular steatosis
Item
Microvesicular steatosis
boolean
C1850415 (UMLS CUI [1])
Bile accumulation
Item
Bile accumulation
boolean
C3686784 (UMLS CUI [1])
Diastase-resistant, PAS-positive cytoplasmic inclusions
Item
Diastase-resistant, PAS-positive cytoplasmic inclusions
boolean
C1856311 (UMLS CUI [1,1])
C0205708 (UMLS CUI [1,2])
Alpha-1-antitrypsin inclusions
Item
Alpha-1-antitrypsin inclusions
boolean
C0002191 (UMLS CUI [1,1])
C1512693 (UMLS CUI [1,2])
C0227525 (UMLS CUI [1,3])
Megamitochondria
Item
Megamitochondria
boolean
C0544931 (UMLS CUI [1])
Mallory bodies
Item
Mallory bodies
boolean
C0333744 (UMLS CUI [1])
Ground Glass inclusions
Item
Ground Glass inclusions
boolean
C0598786 (UMLS CUI [1])
Lipofuscin pigment
Item
Lipofuscin pigment
boolean
C0023789 (UMLS CUI [1])
Hemosiderin granules
Item
Hemosiderin granules
boolean
C0019113 (UMLS CUI [1])
Orcein-positive cytoplasmin granules
Item
Orcein-positive cytoplasmin granules
boolean
C0069596 (UMLS CUI [1])
Protoporphyrin crystals
Item
Protoporphyrin crystals (birefringent under polarised light)
boolean
C0033733 (UMLS CUI [1])
Uroporphyrin crystals
Item
Uroporphyrin crystals (red fluorescence under ultraviolet light)
boolean
C0042093 (UMLS CUI [1])
Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles
Item
Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C0042219 (UMLS CUI [1,3])
C0205394 (UMLS CUI [2,1])
C1512693 (UMLS CUI [2,2])
Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles specification
Item
If other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C0042219 (UMLS CUI [1,3])
C0205394 (UMLS CUI [2,1])
C1512693 (UMLS CUI [2,2])
Item Group
Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities
C0227525 (UMLS CUI-1)
C1849376 (UMLS CUI-2)
C0193388 (UMLS CUI-3)
None abnormality
Item
None abnormality
boolean
C0549184 (UMLS CUI [1,1])
C1704258 (UMLS CUI [1,2])
Hepatocellular mitosis
Item
Hepatocellular mitosis
boolean
C0026255 (UMLS CUI [1,1])
C2697585 (UMLS CUI [1,2])
Binucleated or multinucleated hepatocytes
Item
Binucleated or multinucleated hepatocytes
boolean
C0333909 (UMLS CUI [1])
C4054455 (UMLS CUI [2])
CMV inclusion bodies
Item
CMV inclusion bodies
boolean
C0010825 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C1512693 (UMLS CUI [1,3])
HSV inclusions
Item
HSV inclusions
boolean
C0319232 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C1512693 (UMLS CUI [1,3])
Varicella inclusions
Item
Varicella inclusions
boolean
C0740380 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C1512693 (UMLS CUI [1,3])
Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities
Item
Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C1849376 (UMLS CUI [1,3])
Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities specification
Item
If other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities, please sepcify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C1849376 (UMLS CUI [1,3])
Item Group
Liver or Lobular Infiltrates
C1400896 (UMLS CUI-1)
C0193388 (UMLS CUI-2)
None Liver or Lobular Infiltrates
Item
None Liver or Lobular Infiltrates
boolean
C0549184 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Eosinophils
Item
Eosinophils
boolean
C0014467 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Lymphocytes
Item
Lymphocytes
boolean
C0024264 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Plasma cells
Item
Plasma cells
boolean
C0032112 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Neutrophils
Item
Neutrophils
boolean
C0027950 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Macrophages and proliferating Kupffer cells
Item
Macrophages and proliferating Kupffer cells
boolean
C0022801 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Granulomas
Item
Granulomas
boolean
C0745754 (UMLS CUI [1])
Other Liver or Lobular Infiltrates
Item
Other Liver or Lobular Infiltrates
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Other Liver or Lobular Infiltrates specification
Item
If Other Liver or Lobular Infiltrates, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
Item Group
Portal Tract Inflammation
C3854488 (UMLS CUI-1)
C0193388 (UMLS CUI-2)
None Portal Tract Inflammation
Item
None Portal Tract Inflammation
boolean
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Eosinophils
Item
Eosinophils
boolean
C0014467 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Lymphoid aggregates and/or follicles
Item
Lymphoid aggregates and/or follicles
boolean
C0229653 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Plasma cells
Item
Plasma cells
boolean
C0032112 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Neutrophils
Item
Neutrophils
boolean
C0027950 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Histocytes and macrophages
Item
Histocytes and macrophages
boolean
C0019612 (UMLS CUI [1])
C0024432 (UMLS CUI [2])
C3854488 (UMLS CUI [3])
Other Portal Tract Inflammation
Item
Other Portal Tract Inflammation
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Other Portal Tract Inflammation specification
Item
If Other Portal Tract Inflammation, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
Item Group
Bile Ducts
C0005400 (UMLS CUI-1)
C0193388 (UMLS CUI-2)
Normal bile ducts
Item
Normal bile ducts
boolean
C0205307 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
Proliferation of bile ducts
Item
Proliferation of bile ducts (bile ductular reaction)
boolean
C0005400 (UMLS CUI [1,1])
C0334094 (UMLS CUI [1,2])
Dilation, degeneration or disruption of portal bile ducts
Item
Dilation, degeneration or disruption of portal bile ducts
boolean
C0005400 (UMLS CUI [1])
C0011164 (UMLS CUI [2,1])
C0005400 (UMLS CUI [2,2])
C0700124 (UMLS CUI [3,1])
C0005400 (UMLS CUI [3,2])
C0332453 (UMLS CUI [4,1])
C0005400 (UMLS CUI [4,2])
Paucity of bile ducts
Item
Paucity of bile ducts
boolean
C4273160 (UMLS CUI [1])
Periductal fibrosis
Item
Periductal fibrosis
boolean
C0016059 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
Other Bile Ducts
Item
Other Bile Ducts
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
Other Bile Ducts specification
Item
If other Bile Ducts, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
Item Group
Portal veins
C0032718 (UMLS CUI-1)
C0193388 (UMLS CUI-2)
Normal
Item
Normal
integer
C0205307 (UMLS CUI [1])
Pyelophlebitis
Item
Pyelophlebitis
boolean
C1405883 (UMLS CUI [1])
Thrombosis, sclerosis or occlusion of portal vein
Item
Thrombosis, sclerosis or occlusion of portal vein
boolean
C0155773 (UMLS CUI [1])
C0400960 (UMLS CUI [2])
C0028778 (UMLS CUI [3,1])
C0032718 (UMLS CUI [3,2])
Neoplastic Invasion of portal vein
Item
Neoplastic Invasion of portal vein
boolean
C0585133 (UMLS CUI [1])
Granulomatous compression of portal vein
Item
Granulomatous compression of portal vein
boolean
C0032718 (UMLS CUI [1,1])
C0439667 (UMLS CUI [1,2])
C0728907 (UMLS CUI [1,3])
Other Portal Veins abnormality
Item
Other Portal Veins abnormality
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0032718 (UMLS CUI [1,2])
C0205161 (UMLS CUI [1,3])
Other Portal Veins abnormality specification
Item
If other Portal Veins abnormality, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0032718 (UMLS CUI [1,2])
C0205161 (UMLS CUI [1,3])
Item Group
Liver Infections
C1112211 (UMLS CUI-1)
C0193388 (UMLS CUI-2)
Normal
Item
Normal
boolean
C0205307 (UMLS CUI [1])
Leishmaniasis donovani
Item
Leishmaniasis donovani
boolean
C0023273 (UMLS CUI [1])
Plasmodium falciparum
Item
Plasmodium falciparum
boolean
C0032150 (UMLS CUI [1])
Toxoplasmosis
Item
Toxoplasmosis
boolean
C0040558 (UMLS CUI [1])
Cryptococcus neoformans
Item
Cryptococcus neoformans
boolean
C0010416 (UMLS CUI [1])
Histoplasma capsulatum
Item
Histoplasma capsulatum
boolean
C0319941 (UMLS CUI [1])
Mycobacterium tuberculois
Item
Mycobacterium tuberculois
boolean
C0026926 (UMLS CUI [1])
Other mycobacterial species
Item
Other mycobacterial species
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0026912 (UMLS CUI [1,2])
Other Liver Infections
Item
Other Liver Infections
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1112211 (UMLS CUI [1,2])
Other Liver Infections specification
Item
If Other Liver Infections, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1112211 (UMLS CUI [1,2])
Item Group
Parasites or Ova
C0030498 (UMLS CUI-1)
C1267673 (UMLS CUI-2)
C0023884 (UMLS CUI-3)
C0193388 (UMLS CUI-4)
None Parasites or ova
Item
None Parasites or ova
boolean
C0549184 (UMLS CUI [1,1])
C0030498 (UMLS CUI [1,2])
C0023884 (UMLS CUI [1,3])
C0549184 (UMLS CUI [2,1])
C1267673 (UMLS CUI [2,2])
Schistosome and/or ova
Item
Schistosome and/or ova
boolean
C0036315 (UMLS CUI [1])
C1267673 (UMLS CUI [2,1])
C0036315 (UMLS CUI [2,2])
Ascaris and/or ova
Item
Ascaris and/or ova
boolean
C0003954 (UMLS CUI [1])
C3698183 (UMLS CUI [2])
Toxocara and/or ova
Item
Toxocara and/or ova
boolean
C0040550 (UMLS CUI [1])
C1267673 (UMLS CUI [2,1])
C0040550 (UMLS CUI [2,2])
Echinococcus cysts
Item
Echinococcus cysts
boolean
C0013502 (UMLS CUI [1])
Hepatic capillariasis worms and/or ova
Item
Hepatic capillariasis worms and/or ova
boolean
C0277202 (UMLS CUI [1])
C1267673 (UMLS CUI [2,1])
C0277202 (UMLS CUI [2,2])
Other Parasites or ova
Item
Other Parasites or ova
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0030498 (UMLS CUI [1,2])
C0023884 (UMLS CUI [1,3])
C0205394 (UMLS CUI [2,1])
C1267673 (UMLS CUI [2,2])
Other Parasites or ova specification
Item
If Other Parasites or ova, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0030498 (UMLS CUI [1,2])
C0023884 (UMLS CUI [1,3])
C0205394 (UMLS CUI [2,1])
C1267673 (UMLS CUI [2,2])
Item Group
Histologic Staining or Additional Studies Obtained
C0487602 (UMLS CUI-1)
C0430022 (UMLS CUI-2)
C0023884 (UMLS CUI-3)
C0193388 (UMLS CUI-4)
Haematoxylin and eosin (or H&E)
Item
Haematoxylin and eosin (or H&E)
boolean
C0523207 (UMLS CUI [1])
Masson
Item
Masson
boolean
C1294297 (UMLS CUI [1])
Toluidine blue or Giemsa
Item
Toluidine blue or Giemsa
boolean
C0523203 (UMLS CUI [1])
C0017542 (UMLS CUI [2])
Prussian blue
Item
Prussian blue
boolean
C1294004 (UMLS CUI [1])
Periodic Acidic Schiff (PAS) with or without diastase
Item
Periodic Acidic Schiff (PAS) with or without diastase
boolean
C0440048 (UMLS CUI [1])
C0002712 (UMLS CUI [2])
Oil red O
Item
Oil red O
boolean
C1294000 (UMLS CUI [1])
Congo red
Item
Congo red
boolean
C0009742 (UMLS CUI [1])
Hall's stain
Item
Hall's stain
boolean
C1720394 (UMLS CUI [1])
Gridley's stain
Item
Gridley's stain
boolean
C1293978 (UMLS CUI [1])
Rhodanine (copper)
Item
Rhodanine (copper)
boolean
C0035486 (UMLS CUI [1,1])
C0487602 (UMLS CUI [1,2])
C0009968 (UMLS CUI [1,3])
Rubeanic acid (copper)
Item
Rubeanic acid (copper)
boolean
C0073680 (UMLS CUI [1,1])
C0487602 (UMLS CUI [1,2])
C0009968 (UMLS CUI [1,3])
Orcein, aldehyde fuchsin or Victoria blue
Item
Orcein, aldehyde fuchsin or Victoria blue
boolean
C1294001 (UMLS CUI [1])
C0491984 (UMLS CUI [2])
C0078232 (UMLS CUI [3,1])
C0487602 (UMLS CUI [3,2])
Electron microscopy
Item
Electron microscopy
boolean
C0026019 (UMLS CUI [1])
Hepatitis A lmmunostains positive
Item
Hepatitis A lmmunostains positive
boolean
C0560226 (UMLS CUI [1,1])
C3687908 (UMLS CUI [1,2])
Hepatitis B core antigen or hepatitis B surface antibody immunostains positive
Item
Hepatitis B core antigen or hepatitis B surface antibody immunostains positive
boolean
C0149709 (UMLS CUI [1,1])
C3687908 (UMLS CUI [1,2])
Hepatitis D immunostains
Item
Hepatitis D immunostains
boolean
C0850990 (UMLS CUI [1,1])
C0021044 (UMLS CUI [1,2])
C3687908 (UMLS CUI [1,3])
Other immunostains
Item
Other immunostains
boolean
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C3687908 (UMLS CUI [1,2])
Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained
Item
Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0487602 (UMLS CUI [1,2])
C0023884 (UMLS CUI [1,3])
Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained specification
Item
If Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained, please specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0487602 (UMLS CUI [1,2])
C0023884 (UMLS CUI [1,3])