GECCO - German Corona Consensus - Covid-19 Research-Dataset

This version of the GECCO dataset is mainly based on https://art-decor.org/art-decor/decor-datasets--covid19f- on the "final" version published mid to end September 2020. A few items implicated by comments/descriptions of items on art-decor have been added: "Datum der letzten Impfung" (date of last vaccination for all listed vaccinations), "Schweregrad" (Severity of Kidney Diseases), "Ort" (Location of vacation in the last 14 days), "Befund bildgebender Verfahren im Rahmen von COVID-19" added separately for all types of imaging procedures listed, "Symptom Schweregrad" (Severity of Symptoms) for each symptom listed, and an "NCT-/EudraCT-Nummer" item for Study participation. Official German text from http://cocos.team/datasets.html: Zur Bewältigung der aktuellen Pandemie und der damit einhergehenden Behandlung von Patienten fördert das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) ein nationales Netzwerk der Universitätsmedizin im Kampf gegen COVID-19. Unter anderem soll das Netzwerk die Daten der behandelten COVID-19 Patienten systematisch erfassen und bündeln. Die Forschenden sollen die Behandlung der COVID-19-Patienten standardisiert erheben, verfolgen und analysieren. Die hohe Bedrohungslage hat zu intensiver wissenschaftlicher Aktivität zu COVID-19 geführt, wozu zahlreiche regionale, nationale und internationale epidemiologische Erhebungen und Registerstudien zählen. Der Konsensusdatensatz gibt der Wissenschaft um COVID-19 eine gemeinsame Sprache und Arbeitsgrundlage. Inofficial translation: In order to cope with the current pandemic and the associated treatment of patients, the Federal Ministry of Education and Research (BMBF) is funding a national network of university medicine in the fight against COVID-19. Among other things, the network will systematically collect and bundle the data of the treated COVID-19 patients. The researchers are to collect, track and analyze the treatment of COVID-19 patients in a standardized way. The high threat level has led to intensive scientific activity on COVID-19, including numerous regional, national and international epidemiological surveys and register studies. The consensus data set provides a common language and working basis for the science around COVID-19. Additional source: https://simplifier.net/ForschungsnetzCovid-19/ResearchDatasetGECCO/~overview Not yet integrated: Items for "Data Absent Reason", "Certainty of Presence", "Uncertainty of Presence", and "Certainty of absence"; "therapeutic intention", "Medication Statement Status", "EventStatus"; longer versions of the ValueSets published separately from the variables in art-decor.

Demographie

Name
Type
Description | Question | Decode (Coded Value)
Data type
Alias
Item Group
Demographie
C0011298 (UMLS CUI-1)
Item
Liegt eine Schwangerschaft vor?
text
C0032961 (UMLS CUI [1])
82810-3 (LOINC[1])
Code List
Liegt eine Schwangerschaft vor?
CL Item
ja (ja)
77386006 (SNOMED CT[1])
(LOINC[1])
C1705108 (UMLS CUI-1)
CL Item
nein (nein)
60001007 (SNOMED CT[1])
(LOINC[1])
C1298908 (UMLS CUI-1)
CL Item
unbekannt (unbekannt)
261665006 (SNOMED CT[1])
(LOINC[1])
C0439673 (UMLS CUI-1)
Item
ethnische Zugehörigkeit
text
C0015031 (UMLS CUI [1])
372148003 (SNOMED CT[1])
Code List
ethnische Zugehörigkeit
CL Item
Arabisch (Arabisch)
90027003 (SNOMED CT[1])
C0282540 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Latein-Amerikanisch (Latein-Amerikanisch)
2135-2 (PH_RaceAndEthnicity_CDC)
C1553378 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
andere (andere)
C0205394 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Kaukasisch (Kaukasisch)
14045001 (SNOMED CT[1])
C0043157 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Afrikanisch (Afrikanisch)
18167009 (SNOMED CT[1])
C0027567 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Asiatisch (Asiatisch)
315280000 (SNOMED CT[1])
C0078988 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
gemischte ethnische Zugehörigkeit (gemischte ethnische Zugehörigkeit)
186019001 (SNOMED CT[1])
C0682086 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Item
Biologisches Geschlecht
text
C4086849 (UMLS CUI [1])
76689-9 (LOINC[1])
Code List
Biologisches Geschlecht
CL Item
Weiblich (Weiblich)
female (2.16.840.1.113883.4.642.4.2)
C0086287 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
keine Angabe (keine Angabe)
X (1.2.276.0.76.5.483)
C1546437 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Divers (Divers)
D (1.2.276.0.76.5.483)
C3887376 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Männlich (Männlich)
male (2.16.840.1.113883.4.642.4.2)
C0086582 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
unbestimmt (unbestimmt)
unknown (2.16.840.1.113883.4.642.4.2)
C1704620 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Geburtsdatum
Item
Geburtsdatum
date
C0421451 (UMLS CUI [1])
184099003 (SNOMED CT[1])
21112-8 (LOINC[1])
Alter
Item
Alter bei Studieneinschluss in Jahren oder Monaten
text
C0001779 (UMLS CUI [1,1])
C4041024 (UMLS CUI [1,2])
424144002 (SNOMED CT[1])
30525-0 (LOINC[1])
Item
Frailty-Score vor Aufnahme
integer
C4706357 (UMLS CUI [1,1])
C0332152 (UMLS CUI [1,2])
C0030673 (UMLS CUI [1,3])
763264000 (SNOMED CT[1])
Code List
Frailty-Score vor Aufnahme
CL Item
Sehr fit (1)
1 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C2984081 (UMLS CUI-1)
C0424576 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Durchschnittlich aktiv (2)
2 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0205177 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Gut zurechtkommend (3)
3 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0424576 (UMLS CUI-1)
C0205410 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Vulnerabel (4)
4 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0949366 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Geringgradig frail (5)
5 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0424594 (UMLS CUI-1)
C2945599 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Mittelgradig frail (6)
6 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0424594 (UMLS CUI-1)
C0205081 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Ausgeprägt frail (7)
7 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0424594 (UMLS CUI-1)
C0205082 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Extrem frail (8)
8 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0424594 (UMLS CUI-1)
C0205403 (UMLS CUI-2)
(Comment:de)
CL Item
Terminal erkrankt (9)
9 (2.25.289763784830452322853973378638183835703)
C0039552 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Gewicht
Item
Körpergewicht
float
C0005910 (UMLS CUI [1])
27113001 (SNOMED CT[1])
29463-7 (LOINC[1])
Körpergröße
Item
Körpergröße
float
C0005890 (UMLS CUI [1])
50373000 (SNOMED CT[1])
8302-2 (LOINC[1])