GECCO - German Corona Consensus - Covid-19 Research-Dataset

This version of the GECCO dataset is mainly based on https://art-decor.org/art-decor/decor-datasets--covid19f- on the "final" version published mid to end September 2020. A few items implicated by comments/descriptions of items on art-decor have been added: "Datum der letzten Impfung" (date of last vaccination for all listed vaccinations), "Schweregrad" (Severity of Kidney Diseases), "Ort" (Location of vacation in the last 14 days), "Befund bildgebender Verfahren im Rahmen von COVID-19" added separately for all types of imaging procedures listed, "Symptom Schweregrad" (Severity of Symptoms) for each symptom listed, and an "NCT-/EudraCT-Nummer" item for Study participation. Official German text from http://cocos.team/datasets.html: Zur Bewältigung der aktuellen Pandemie und der damit einhergehenden Behandlung von Patienten fördert das Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) ein nationales Netzwerk der Universitätsmedizin im Kampf gegen COVID-19. Unter anderem soll das Netzwerk die Daten der behandelten COVID-19 Patienten systematisch erfassen und bündeln. Die Forschenden sollen die Behandlung der COVID-19-Patienten standardisiert erheben, verfolgen und analysieren. Die hohe Bedrohungslage hat zu intensiver wissenschaftlicher Aktivität zu COVID-19 geführt, wozu zahlreiche regionale, nationale und internationale epidemiologische Erhebungen und Registerstudien zählen. Der Konsensusdatensatz gibt der Wissenschaft um COVID-19 eine gemeinsame Sprache und Arbeitsgrundlage. Inofficial translation: In order to cope with the current pandemic and the associated treatment of patients, the Federal Ministry of Education and Research (BMBF) is funding a national network of university medicine in the fight against COVID-19. Among other things, the network will systematically collect and bundle the data of the treated COVID-19 patients. The researchers are to collect, track and analyze the treatment of COVID-19 patients in a standardized way. The high threat level has led to intensive scientific activity on COVID-19, including numerous regional, national and international epidemiological surveys and register studies. The consensus data set provides a common language and working basis for the science around COVID-19. Additional source: https://simplifier.net/ForschungsnetzCovid-19/ResearchDatasetGECCO/~overview Not yet integrated: Items for "Data Absent Reason", "Certainty of Presence", "Uncertainty of Presence", and "Certainty of absence"; "therapeutic intention", "Medication Statement Status", "EventStatus"; longer versions of the ValueSets published separately from the variables in art-decor.

Symptome

Name
Type
Description | Question | Decode (Coded Value)
Data type
Alias
Item Group
Symptome
C1457887 (UMLS CUI-1)
Symptom: Geruchs- bzw. Geschmacksstörungen
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Geruchs- bzw. Geschmacksstörungen
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0495689 (UMLS CUI [2])
36955009 (SNOMED CT[1])
44169009 (SNOMED CT[2])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Geruchs- bzw. Geschmacksstörungen
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0495689 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Geruchs- bzw. Geschmacksstörungen
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Bauchschmerzen
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Bauchschmerzen
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0000737 (UMLS CUI [2])
21522001 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Bauchschmerzen
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0000737 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Bauchschmerzen
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Bewusstseinsstörungen / Verwirrtheit
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Bewusstseinsstörungen / Verwirrtheit
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0009792 (UMLS CUI [2])
C0009676 (UMLS CUI [3])
40917007 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Bewusstseinsstörung / Verwirrtheit
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0009792 (UMLS CUI [1,2])
C1319166 (UMLS CUI [2,1])
C0009676 (UMLS CUI [2,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Bewusstseinsstörung / Verwirrtheit
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Durchfall
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Durchfall
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0011991 (UMLS CUI [2])
62315008 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Durchfall
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0011991 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Durchfall
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Erbrechen
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Erbrechen
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0042963 (UMLS CUI [2])
422400008 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Erbrechen
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0042963 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Erbrechen
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Husten
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Husten
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0010200 (UMLS CUI [2])
49727002 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Husten
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0010200 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Husten
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Kurzatmigkeit (Dyspnoe)
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Kurzatmigkeit (Dyspnoe)
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0013404 (UMLS CUI [2])
267036007 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Kurzatmigkeit (Dyspnoe)
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0013404 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Kurzatmigkeit (Dyspnoe)
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Übelkeit
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Übelkeit
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0027497 (UMLS CUI [2])
422587007 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Übelkeit
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0027497 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Übelkeit
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Fieber
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Fieber
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0015967 (UMLS CUI [2])
426000000 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Fieber
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0015967 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Fieber
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Kopfschmerzen
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Kopfschmerzen
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0018681 (UMLS CUI [2])
25064002 (SNOMED CT[1])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: Kopfschmerzen
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C0018681 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Symptom Schweregrad: Kopfschmerzen
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
Symptom: Andere Symptome
Item
Symptome im Rahmen einer Covid-19 Erkrankung Andere Symptome
boolean
C1457887 (UMLS CUI [1,1])
C5203670 (UMLS CUI [1,2])
C0205394 (UMLS CUI [1,3])
75325-1 (LOINC[1])
Item
Symptom Schweregrad: andere Symptome
text
C1319166 (UMLS CUI [1,1])
C1457887 (UMLS CUI [1,2])
C0205394 (UMLS CUI [1,3])
Code List
Symptom Schweregrad: andere Symptome
CL Item
Mild (Mild)
255604002 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C2945599 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Moderat (Moderate)
6736007 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205081 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Schwer (Severe)
24484000 (SNOMED CT[1])
Text des Codelistitems und CodedValue nicht im Original hinterlegt (Comment)
C0205082 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)
CL Item
Lebensbedrohlich (Life threatening)
442452003 (SNOMED CT[1])
C2826244 (UMLS CUI-1)
(Comment:de)