I.alport_fam_code
Item
Family Code
text
C3669174 (UMLS CUI [1,1])
Item
Family member
text
C0086282 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Index (reference) patient (P)
C0522476 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Sibling (Brother/Sister) (SIB)
C0037047 (UMLS CUI [1,1])
C0337514 (UMLS CUI [1,2])
C0337527 (UMLS CUI [1,3])
CL Item
Child (Son/Daughter) (CHI)
C0008059 (UMLS CUI [1,1])
C0011011 (UMLS CUI [1,2])
C0037683 (UMLS CUI [1,3])
CL Item
Parent (Father/Mother) (PAR)
C0026591 (UMLS CUI [1,1])
C0015671 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Aunt/Uncle (paternal) (AUP)
C3714276 (UMLS CUI [1,1])
C3714274 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Aunt/Uncle (maternal) (AUM)
C3714277 (UMLS CUI [1,1])
C3714275 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Grandparent (paternal) (GPP)
C3828639 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Grandparent (maternal) (GPM)
C3829175 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Niece/Nephew (paternal) (NNP)
C1553703 (UMLS CUI [1,1])
C2347452 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Niece/Nephew (maternal) (NNM)
C1553703 (UMLS CUI [1,1])
C2347083 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Cousin (paternal) (COP)
C3272878 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Cousin (maternal) (COM)
C3272873 (UMLS CUI [1,1])
Item
Microhematuria
text
C0239937 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_microhematuria_onset
Item
If yes: Age of onset (years)
integer
C0239937 (UMLS CUI [1,1])
C0206132 (UMLS CUI [1,2])
Item
Macrohematuria
text
C0473237 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_macrohematuria_onset
Item
If yes: Age of onset (years)
integer
C0473237 (UMLS CUI [1,1])
C0206132 (UMLS CUI [1,2])
Item
Proteinuria
text
C0033687 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_proteinuria_onset
Item
If yes: Age of onset (years)
integer
C0206132 (UMLS CUI [1,1])
C0033687 (UMLS CUI [1,2])
Item
CKD
text
C2074731 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
CKD1 (1)
C2316401 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
CKD2 (2)
C2316786 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
CKD3 (3)
C2316787 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
CKD4 (4)
C4287536 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
CKD5 (5)
C2316810 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Unknown (6)
C0439673 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_ckd_onset
Item
If CKD>1: Age of onset (years)
integer
C0206132 (UMLS CUI [1,1])
C1561643 (UMLS CUI [1,2])
Item
Hearing loss
text
C3887873 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_hearloss_onset
Item
If yes: Age of onset (years)
integer
C0206132 (UMLS CUI [1,1])
C3887873 (UMLS CUI [1,2])
Item
Ocular lesion
text
C1299003 (UMLS CUI [1,1])
C0221198 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_ocular_onset
Item
If yes: Age of onset (years)
integer
C0206132 (UMLS CUI [1,1])
C1299003 (UMLS CUI [1,2])
C0221198 (UMLS CUI [1,3])
Item
Electron Microscopy on kidney biopsy
text
C0026019 (UMLS CUI [1,1])
C0194073 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Electron Microscopy on kidney biopsy
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_his_em_thin
Item
If yes, result: thinning
boolean
C1274040 (UMLS CUI [1,1])
C0026019 (UMLS CUI [1,2])
C0194073 (UMLS CUI [1,3])
C0005953 (UMLS CUI [1,4])
I.alport_his_em_thick
Item
If yes, result: thickening
boolean
C1274040 (UMLS CUI [1,1])
C0026019 (UMLS CUI [1,2])
C0194073 (UMLS CUI [1,3])
C0005953 (UMLS CUI [1,4])
I.alport_his_em_baswave
Item
If yes, result: basket-waves
boolean
C1274040 (UMLS CUI [1,1])
C0026019 (UMLS CUI [1,2])
C0194073 (UMLS CUI [1,3])
C0005953 (UMLS CUI [1,4])
I.alport_his_em_split
Item
If yes, result: splitting
boolean
C1274040 (UMLS CUI [1,1])
C0026019 (UMLS CUI [1,2])
C0194073 (UMLS CUI [1,3])
C0005953 (UMLS CUI [1,4])
I.alport_his_em_other
Item
If yes, result: others
boolean
C1274040 (UMLS CUI [1,1])
C0026019 (UMLS CUI [1,2])
C0194073 (UMLS CUI [1,3])
C0205394 (UMLS CUI [1,4])
I.alport_his_em_other_specify
Item
specify others:
text
C3845569 (UMLS CUI [1,1])
C1274040 (UMLS CUI [1,2])
C0026019 (UMLS CUI [1,3])
C0194073 (UMLS CUI [1,4])
Item
Standard IF analysis on kidney
text
C0079604 (UMLS CUI [1,1])
C0022646 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Standard IF analysis on kidney
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
Item
If yes, results:
text
C1274040 (UMLS CUI [1,1])
C0079604 (UMLS CUI [1,2])
C0022646 (UMLS CUI [1,3])
Code List
If yes, results:
CL Item
negative (0)
C0205160 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
positive (1)
C1446409 (UMLS CUI [1,1])
I.alport_his_if_results_specify
Item
if positive, specify:
text
C1521902 (UMLS CUI [1,1])
C1446409 (UMLS CUI [1,2])
C1274040 (UMLS CUI [1,3])
C0079604 (UMLS CUI [1,4])
C0022646 (UMLS CUI [1,5])
Item
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 1
text
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C0201856 (UMLS CUI [1,3])
Code List
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 1
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
Item
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 1 - result
text
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C0201856 (UMLS CUI [1,3])
C1274040 (UMLS CUI [1,4])
Code List
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 1 - result
CL Item
normal (0)
C0205307 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
segmental (1)
C0205122 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
absent (2)
C0332197 (UMLS CUI [1,1])
Item
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 5
text
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C1312514 (UMLS CUI [1,3])
Code List
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 5
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
Item
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 5 - result
text
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C1312514 (UMLS CUI [1,3])
C1274040 (UMLS CUI [1,4])
Code List
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 5 - result
CL Item
normal (0)
C0205307 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
segmental (1)
C0205122 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
absent (2)
C0332197 (UMLS CUI [1,1])
Item
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 6
text
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C0289325 (UMLS CUI [1,3])
Code List
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 6
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
Item
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 6 - result
text
C0021044 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C0289325 (UMLS CUI [1,3])
C1274040 (UMLS CUI [1,4])
Code List
Immunohistochemical analysis on skin biopsy: alpha 6 - result
CL Item
normal (0)
C0205307 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
segmental (1)
C0205122 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
absent (2)
C0332197 (UMLS CUI [1,1])
Item
Confocal analysis on skin biopsy
text
C0242842 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
Code List
Confocal analysis on skin biopsy
CL Item
No (0)
C1298908 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Yes (1)
C5399964 (UMLS CUI [1,1])
Item
if yes: Results (ALPORT)
text
C0242842 (UMLS CUI [1,1])
C0150866 (UMLS CUI [1,2])
C1274040 (UMLS CUI [1,3])
Code List
if yes: Results (ALPORT)
CL Item
normal (0)
C0205307 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
segmental (1)
C0205122 (UMLS CUI [1,1])