Inglês

This sample attributes table includes body site where sample was collected, analyte type, tumor status, histological type, genotyping center, sequencing center, funding source, TOPMed phase, project, and study name.

5 Formulários  
pht004840
Descrição

pht004840

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified sample ID
Descrição

SAMPLE_ID

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C1299222
Body site where sample was collected
Descrição

BODY_SITE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0449705
Analyte type
Descrição

ANALYTE_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4744818
Tumor status
Descrição

IS_TUMOR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475752
Cell or tissue type or subtype of sample
Descrição

HISTOLOGICAL_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C0007634
UMLS CUI [1,3]
C0332307
UMLS CUI [2,1]
C2347026
UMLS CUI [2,2]
C0007634
UMLS CUI [2,3]
C0449560
UMLS CUI [3,1]
C1292533
UMLS CUI [3,2]
C0332307
UMLS CUI [4,1]
C1292533
UMLS CUI [4,2]
C0449560
Name of the center which conducted genotyping
Descrição

GENOTYPING_CENTER

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1301943
UMLS CUI [1,2]
C5575037
UMLS CUI [1,3]
C1285573
Name of the center which conducted sequencing
Descrição

SEQUENCING_CENTER

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1301943
UMLS CUI [1,2]
C5575037
UMLS CUI [1,3]
C1294197
Name of the funding source
Descrição

FUNDING_SOURCE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1301943
UMLS CUI [1,2]
C0681806
TopMed Phase
Descrição

TopMed_Phase

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205390
UMLS CUI [1,2]
C2603343
TopMed Project
Descrição

TopMed_Project

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0700032
Study name
Descrição

Study_Name

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2348560
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This sample attributes table includes body site where sample was collected, analyte type, tumor status, histological type, genotyping center, sequencing center, funding source, TOPMed phase, project, and study name.

5 Formulários
Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht004840
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
De-identified sample ID
string
C4684638 (UMLS CUI [1,1])
C1299222 (UMLS CUI [1,2])
BODY_SITE
Item
Body site where sample was collected
string
C0449705 (UMLS CUI [1,1])
ANALYTE_TYPE
Item
Analyte type
string
C4744818 (UMLS CUI [1,1])
Item
Tumor status
text
C0475752 (UMLS CUI [1,1])
IS_TUMOR
Code List
Tumor status
CL Item
Is not a tumor (N)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
C1518422 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Is Tumor (Y)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
HISTOLOGICAL_TYPE
Item
Cell or tissue type or subtype of sample
string
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C0007634 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
C2347026 (UMLS CUI [2,1])
C0007634 (UMLS CUI [2,2])
C0449560 (UMLS CUI [2,3])
C1292533 (UMLS CUI [3,1])
C0332307 (UMLS CUI [3,2])
C1292533 (UMLS CUI [4,1])
C0449560 (UMLS CUI [4,2])
GENOTYPING_CENTER
Item
Name of the center which conducted genotyping
string
C1301943 (UMLS CUI [1,1])
C5575037 (UMLS CUI [1,2])
C1285573 (UMLS CUI [1,3])
SEQUENCING_CENTER
Item
Name of the center which conducted sequencing
string
C1301943 (UMLS CUI [1,1])
C5575037 (UMLS CUI [1,2])
C1294197 (UMLS CUI [1,3])
FUNDING_SOURCE
Item
Name of the funding source
string
C1301943 (UMLS CUI [1,1])
C0681806 (UMLS CUI [1,2])
TopMed_Phase
Item
TopMed Phase
text
C0205390 (UMLS CUI [1,1])
C2603343 (UMLS CUI [1,2])
TopMed_Project
Item
TopMed Project
string
C0700032 (UMLS CUI [1,1])
Study_Name
Item
Study name
string
C2348560 (UMLS CUI [1,1])
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