Inglese

This sample attributes table contains sample IDs, body site where sample was collected, analyte type, histological type, tumor status, anatomic region of retina, laterality of eye, approximate time (in hours) from death of donor to stabilization of RNA, sequencing library type, and sequencing library protocol.

5 moduli  
pht005541
Descrizione

pht005541

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified Sample ID
Descrizione

SAMPLE_ID

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C1299222
Body site where sample was collected
Descrizione

BODY_SITE

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0449705
Analyte Type
Descrizione

ANALYTE_TYPE

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4744818
Cell or tissue type or subtype of sample
Descrizione

HISTOLOGICAL_TYPE

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C0007634
UMLS CUI [1,3]
C0332307
UMLS CUI [2,1]
C2347026
UMLS CUI [2,2]
C0007634
UMLS CUI [2,3]
C0449560
UMLS CUI [3,1]
C1292533
UMLS CUI [3,2]
C0332307
UMLS CUI [4,1]
C1292533
UMLS CUI [4,2]
C0449560
Tumor status
Descrizione

IS_TUMOR

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475752
Anatomic region of retina
Descrizione

ANATOMIC_REGION

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1515974
UMLS CUI [1,2]
C0035298
Laterality of eye
Descrizione

LATERALITY

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2233642
Approximate time (in hours) from death of donor to stabilization of RNA
Descrizione

DEATH_TO_RNA_PRESERVATION_TIME

Tipo di dati

text

Unità di misura
  • hours
Alias
UMLS CUI [1,1]
C1948053
UMLS CUI [1,2]
C0011065
UMLS CUI [1,3]
C1624027
hours
Sequencing library type
Descrizione

LIBRARY_TYPE

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4688351
UMLS CUI [1,2]
C0332307
Sequencing library protocol
Descrizione

LIBRARY_PROTOCOL

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4688351
UMLS CUI [1,2]
C2348563
Ritorna all'inizio della pagina

Similar models

This sample attributes table contains sample IDs, body site where sample was collected, analyte type, histological type, tumor status, anatomic region of retina, laterality of eye, approximate time (in hours) from death of donor to stabilization of RNA, sequencing library type, and sequencing library protocol.

5 moduli
Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
pht005541
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
De-identified Sample ID
text
C4684638 (UMLS CUI [1,1])
C1299222 (UMLS CUI [1,2])
BODY_SITE
Item
Body site where sample was collected
text
C0449705 (UMLS CUI [1,1])
ANALYTE_TYPE
Item
Analyte Type
text
C4744818 (UMLS CUI [1,1])
HISTOLOGICAL_TYPE
Item
Cell or tissue type or subtype of sample
text
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C0007634 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
C2347026 (UMLS CUI [2,1])
C0007634 (UMLS CUI [2,2])
C0449560 (UMLS CUI [2,3])
C1292533 (UMLS CUI [3,1])
C0332307 (UMLS CUI [3,2])
C1292533 (UMLS CUI [4,1])
C0449560 (UMLS CUI [4,2])
Item
Tumor status
text
C0475752 (UMLS CUI [1,1])
IS_TUMOR
Code List
Tumor status
CL Item
Is not a tumor (N)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
C1518422 (UMLS CUI [1,2])
ANATOMIC_REGION
Item
Anatomic region of retina
text
C1515974 (UMLS CUI [1,1])
C0035298 (UMLS CUI [1,2])
Item
Laterality of eye
text
C2233642 (UMLS CUI [1,1])
LATERALITY
Code List
Laterality of eye
CL Item
Right eye (OD)
CL Item
Left eye (OS)
DEATH_TO_RNA_PRESERVATION_TIME
Item
Approximate time (in hours) from death of donor to stabilization of RNA
text
C1948053 (UMLS CUI [1,1])
C0011065 (UMLS CUI [1,2])
C1624027 (UMLS CUI [1,3])
LIBRARY_TYPE
Item
Sequencing library type
text
C4688351 (UMLS CUI [1,1])
C0332307 (UMLS CUI [1,2])
LIBRARY_PROTOCOL
Item
Sequencing library protocol
text
C4688351 (UMLS CUI [1,1])
C2348563 (UMLS CUI [1,2])
Ritorna all'inizio della pagina