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This sample attributes table contains sample ID, analyte type, whether the sample is tumor or from PDX, histological type, brain metastases HER2 status, brain metastases ER status, brain metastases PR status, and patient information before surgery on target therapy, chemotherapy, hormone therapy and radiation.

5 Formulários  
pht005292
Descrição

pht005292

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified Sample ID
Descrição

SAMPID

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C1299222
Sample content analyzed
Descrição

ANALYTE_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C0456205
UMLS CUI [1,3]
C0936012
Whether the sample is tumor
Descrição

IS_TUMOR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475752
UMLS CUI [1,2]
C2347026
Whether the sample is from patient-derived xenograft (PDX)
Descrição

IS_PDX

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C4050317
Cell or tissue type or subtype of sample
Descrição

HISTOLOGICAL_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C0007634
UMLS CUI [1,3]
C0332307
UMLS CUI [2,1]
C2347026
UMLS CUI [2,2]
C0007634
UMLS CUI [2,3]
C0449560
UMLS CUI [3,1]
C1292533
UMLS CUI [3,2]
C0332307
UMLS CUI [4,1]
C1292533
UMLS CUI [4,2]
C0449560
Brain metastases HER2 status
Descrição

Brain_met_HER2

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0686377
UMLS CUI [1,2]
C1512413
Brain metastases ER status
Descrição

Brain_met_ER

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0686377
UMLS CUI [1,2]
C0034804
UMLS CUI [1,3]
C0449438
Brain metastases PR status
Descrição

Brain_met_PR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0686377
UMLS CUI [1,2]
C2919590
Patient target therapy information before surgery
Descrição

target_therapy

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0030705
UMLS CUI [1,2]
C2985566
UMLS CUI [1,3]
C0332152
UMLS CUI [1,4]
C0543467
Patient chemotherapy information before surgery
Descrição

chemotherapy

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0030705
UMLS CUI [1,2]
C0392920
UMLS CUI [1,3]
C0332152
UMLS CUI [1,4]
C0543467
Patient hormone therapy information before surgery
Descrição

Hormone therapy

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0030705
UMLS CUI [1,2]
C0279025
UMLS CUI [1,3]
C0332152
UMLS CUI [1,4]
C0543467
Patient radiation information before surgery
Descrição

Radiation

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0030705
UMLS CUI [1,2]
C1522449
UMLS CUI [1,3]
C0332152
UMLS CUI [1,4]
C0543467
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This sample attributes table contains sample ID, analyte type, whether the sample is tumor or from PDX, histological type, brain metastases HER2 status, brain metastases ER status, brain metastases PR status, and patient information before surgery on target therapy, chemotherapy, hormone therapy and radiation.

5 Formulários
Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht005292
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPID
Item
De-identified Sample ID
string
C4684638 (UMLS CUI [1,1])
C1299222 (UMLS CUI [1,2])
ANALYTE_TYPE
Item
Sample content analyzed
string
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C0456205 (UMLS CUI [1,2])
C0936012 (UMLS CUI [1,3])
Item
Whether the sample is tumor
text
C0475752 (UMLS CUI [1,1])
C2347026 (UMLS CUI [1,2])
IS_TUMOR
Code List
Whether the sample is tumor
CL Item
No (N)
CL Item
Yes (Y)
Item
Whether the sample is from patient-derived xenograft (PDX)
text
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C4050317 (UMLS CUI [1,2])
IS_PDX
Code List
Whether the sample is from patient-derived xenograft (PDX)
CL Item
No (N)
CL Item
Yes (Y)
HISTOLOGICAL_TYPE
Item
Cell or tissue type or subtype of sample
string
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C0007634 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
C2347026 (UMLS CUI [2,1])
C0007634 (UMLS CUI [2,2])
C0449560 (UMLS CUI [2,3])
C1292533 (UMLS CUI [3,1])
C0332307 (UMLS CUI [3,2])
C1292533 (UMLS CUI [4,1])
C0449560 (UMLS CUI [4,2])
Item
Brain metastases HER2 status
text
C0686377 (UMLS CUI [1,1])
C1512413 (UMLS CUI [1,2])
Brain_met_HER2
Code List
Brain metastases HER2 status
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
Item
Brain metastases ER status
text
C0686377 (UMLS CUI [1,1])
C0034804 (UMLS CUI [1,2])
C0449438 (UMLS CUI [1,3])
Brain_met_ER
Code List
Brain metastases ER status
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
Item
Brain metastases PR status
text
C0686377 (UMLS CUI [1,1])
C2919590 (UMLS CUI [1,2])
Brain_met_PR
Code List
Brain metastases PR status
CL Item
Negative (1)
CL Item
Positive (2)
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
Item
Patient target therapy information before surgery
string
C0030705 (UMLS CUI [1,1])
C2985566 (UMLS CUI [1,2])
C0332152 (UMLS CUI [1,3])
C0543467 (UMLS CUI [1,4])
target_therapy
Code List
Patient target therapy information before surgery
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
Item
Patient chemotherapy information before surgery
string
C0030705 (UMLS CUI [1,1])
C0392920 (UMLS CUI [1,2])
C0332152 (UMLS CUI [1,3])
C0543467 (UMLS CUI [1,4])
chemotherapy
Code List
Patient chemotherapy information before surgery
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
Item
Patient hormone therapy information before surgery
string
C0030705 (UMLS CUI [1,1])
C0279025 (UMLS CUI [1,2])
C0332152 (UMLS CUI [1,3])
C0543467 (UMLS CUI [1,4])
Hormone therapy
Code List
Patient hormone therapy information before surgery
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
Item
Patient radiation information before surgery
string
C0030705 (UMLS CUI [1,1])
C1522449 (UMLS CUI [1,2])
C0332152 (UMLS CUI [1,3])
C0543467 (UMLS CUI [1,4])
Radiation
Code List
Patient radiation information before surgery
CL Item
not applicable (NA)
C1272460 (UMLS CUI [1,1])
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