Inglês

This sample attributes table contains sample IDs, body site where sample was collected, analyte type, tumor status, histological type, tumor stage, and known driver mutations in NRAS or BRAF gene.

5 Formulários  
pht005482
Descrição

pht005482

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified Sample ID
Descrição

SAMPLE_ID

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C1299222
Body site where sample was collected
Descrição

BODY_SITE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0449705
Analyte type
Descrição

ANALYTE_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4744818
Tumor status
Descrição

IS_TUMOR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475752
Cell or tissue type or subtype of sample
Descrição

HISTOLOGICAL_TYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C0007634
UMLS CUI [1,3]
C0332307
UMLS CUI [2,1]
C2347026
UMLS CUI [2,2]
C0007634
UMLS CUI [2,3]
C0449560
UMLS CUI [3,1]
C1292533
UMLS CUI [3,2]
C0332307
UMLS CUI [4,1]
C1292533
UMLS CUI [4,2]
C0449560
Tumor stage of sample
Descrição

TUMOR_STAGE

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1300072
UMLS CUI [1,2]
C2347026
Known driver mutations in NRAS or BRAF
Descrição

GENOTYPE

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205309
UMLS CUI [1,2]
C0026882
UMLS CUI [1,3]
C0809246
UMLS CUI [1,4]
C0812241
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This sample attributes table contains sample IDs, body site where sample was collected, analyte type, tumor status, histological type, tumor stage, and known driver mutations in NRAS or BRAF gene.

5 Formulários
Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht005482
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
De-identified Sample ID
string
C4684638 (UMLS CUI [1,1])
C1299222 (UMLS CUI [1,2])
BODY_SITE
Item
Body site where sample was collected
string
C0449705 (UMLS CUI [1,1])
ANALYTE_TYPE
Item
Analyte type
string
C4744818 (UMLS CUI [1,1])
Item
Tumor status
text
C0475752 (UMLS CUI [1,1])
IS_TUMOR
Code List
Tumor status
CL Item
Is not a tumor (N)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
C1518422 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Is Tumor (Y)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
HISTOLOGICAL_TYPE
Item
Cell or tissue type or subtype of sample
string
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C0007634 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
C2347026 (UMLS CUI [2,1])
C0007634 (UMLS CUI [2,2])
C0449560 (UMLS CUI [2,3])
C1292533 (UMLS CUI [3,1])
C0332307 (UMLS CUI [3,2])
C1292533 (UMLS CUI [4,1])
C0449560 (UMLS CUI [4,2])
Item
Tumor stage of sample
text
C1300072 (UMLS CUI [1,1])
C2347026 (UMLS CUI [1,2])
TUMOR_STAGE
Code List
Tumor stage of sample
CL Item
non-metastatic, Breslow depth >1.0mm (II)
CL Item
local lymph node metastasis (III)
CL Item
distant lymph node metastasis (IV)
GENOTYPE
Item
Known driver mutations in NRAS or BRAF
string
C0205309 (UMLS CUI [1,1])
C0026882 (UMLS CUI [1,2])
C0809246 (UMLS CUI [1,3])
C0812241 (UMLS CUI [1,4])
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