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Sample ID, case or control, body site where sample was collected, analyte type, tumor status, cell or tissue type or subtype of sample, and name of genotyping center of Subject ID, case or control, age, sex, race, and duplicated samples of participants with or without head and neck cancer and involved in the "Head and Neck Cancer Genome-wide Association Study" project.

5 moduli  
pht005672
Descrizione

pht005672

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
De-identified sample ID
Descrizione

SAMPLE_ID

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4684638
UMLS CUI [1,2]
C1299222
Head and neck cancer cases or controls
Descrizione

Phenotype

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0278996
UMLS CUI [1,2]
C3274646
Body site where sample was collected
Descrizione

BODY_SITE

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0449705
Analyte type
Descrizione

ANALYTE_TYPE

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C4744818
Tumor status
Descrizione

IS_TUMOR

Tipo di dati

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0475752
Cell or tissue type or subtype of sample
Descrizione

HISTOLOGICAL_TYPE

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2347026
UMLS CUI [1,2]
C0007634
UMLS CUI [1,3]
C0332307
UMLS CUI [2,1]
C2347026
UMLS CUI [2,2]
C0007634
UMLS CUI [2,3]
C0449560
UMLS CUI [3,1]
C1292533
UMLS CUI [3,2]
C0332307
UMLS CUI [4,1]
C1292533
UMLS CUI [4,2]
C0449560
Name of the center which conducted genotyping
Descrizione

GENOTYPING_CENTER

Tipo di dati

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1301943
UMLS CUI [1,2]
C0565990
UMLS CUI [1,3]
C1285573
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Sample ID, case or control, body site where sample was collected, analyte type, tumor status, cell or tissue type or subtype of sample, and name of genotyping center of Subject ID, case or control, age, sex, race, and duplicated samples of participants with or without head and neck cancer and involved in the "Head and Neck Cancer Genome-wide Association Study" project.

5 moduli
Name
genere
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo di dati
Alias
Item Group
pht005672
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
SAMPLE_ID
Item
De-identified sample ID
string
C4684638 (UMLS CUI [1,1])
C1299222 (UMLS CUI [1,2])
Item
Head and neck cancer cases or controls
text
C0278996 (UMLS CUI [1,1])
C3274646 (UMLS CUI [1,2])
Phenotype
Code List
Head and neck cancer cases or controls
CL Item
Controls (1)
CL Item
Cases (2)
BODY_SITE
Item
Body site where sample was collected
string
C0449705 (UMLS CUI [1,1])
ANALYTE_TYPE
Item
Analyte type
string
C4744818 (UMLS CUI [1,1])
Item
Tumor status
text
C0475752 (UMLS CUI [1,1])
IS_TUMOR
Code List
Tumor status
CL Item
Is not a tumor (N)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
C1518422 (UMLS CUI [1,2])
CL Item
Is tumor (Y)
C0027651 (UMLS CUI [1,1])
HISTOLOGICAL_TYPE
Item
Cell or tissue type or subtype of sample
string
C2347026 (UMLS CUI [1,1])
C0007634 (UMLS CUI [1,2])
C0332307 (UMLS CUI [1,3])
C2347026 (UMLS CUI [2,1])
C0007634 (UMLS CUI [2,2])
C0449560 (UMLS CUI [2,3])
C1292533 (UMLS CUI [3,1])
C0332307 (UMLS CUI [3,2])
C1292533 (UMLS CUI [4,1])
C0449560 (UMLS CUI [4,2])
Item
Name of the center which conducted genotyping
string
C1301943 (UMLS CUI [1,1])
C0565990 (UMLS CUI [1,2])
C1285573 (UMLS CUI [1,3])
GENOTYPING_CENTER
Code List
Name of the center which conducted genotyping
CL Item
MD Anderson Cancer Center (MDACC)
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