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This subject phenotype table contains study number, subject IDs, year of birth, gender, family race, diagnostic system, twin status, death status, drug dependence (n=8 variables; opioid, cocaine, alcohol, nicotine, cannabis, stimulant, sedative, and other drug), drug abuse (n=7 variables; opioid, cocaine, alcohol, cannabis, stimulant, sedative, and other), and family ID, mother ID, father ID and sex in RUCDR pre-QC plink file.

6 Formulários  
pht005839
Descrição

pht005839

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3846158
NIDA study number
Descrição

study

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0008976
UMLS CUI [1,2]
C0237753
Subject ID
Descrição

SUBJECT_ID

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C2348585
Year of Birth
Descrição

yob

Tipo de dados

text

Unidades de medida
  • years
Alias
UMLS CUI [1,1]
C2826771
years
Gender
Descrição

sex

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0079399
Family race
Descrição

family_race

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0034510
Diagnostic system
Descrição

dxsys

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0430022
Twin status
Descrição

twin

Tipo de dados

string

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0041427
UMLS CUI [1,2]
C0449438
Death status
Descrição

deceased

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C1306577
UMLS CUI [1,2]
C0449438
Opioid dependence
Descrição

opioid_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0242402
UMLS CUI [1,2]
C0038580
Cocaine dependence
Descrição

cocaine_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0009170
UMLS CUI [1,2]
C0038580
Alcohol dependence
Descrição

alcohol_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0085762
UMLS CUI [1,2]
C0038580
Nicotine dependence
Descrição

nicotine_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0028043
Cannabis dependence
Descrição

cannabis_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0006870
Stimulant dependence
Descrição

stimulant_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0304402
UMLS CUI [1,2]
C0038580
Sedative dependence
Descrição

sedative_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0038580
UMLS CUI [1,2]
C0036557
Other drug dependence
Descrição

other_dep

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C1510472
Opioid abuse
Descrição

opioid_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0029095
Cocaine abuse
Descrição

cocaine_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0009170
UMLS CUI [1,2]
C0013146
Alcohol abuse
Descrição

alcohol_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0085762
Cannabis abuse
Descrição

cannabis_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0006868
Stimulant abuse
Descrição

stimulant_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0013146
UMLS CUI [1,2]
C0304402
Sedative abuse
Descrição

sedative_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0013146
UMLS CUI [1,2]
C0036557
Other abuse
Descrição

other_abuse

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0205394
UMLS CUI [1,2]
C0013146
Family ID in RUCDR pre-QC plink file
Descrição

FAMILY_ID_RUCDR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3669174
Mother Subject ID in RUCDR pre-QC plink file
Descrição

MOTHER_RUCDR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3669352
UMLS CUI [1,2]
C0030761
Father Subject ID in RUCDR pre-QC plink file
Descrição

FATHER_RUCDR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C3669177
UMLS CUI [1,2]
C0030761
Sex in RUCDR pre-QC plink file
Descrição

SEX_RUCDR

Tipo de dados

text

Alias
UMLS CUI [1,1]
C0079399
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This subject phenotype table contains study number, subject IDs, year of birth, gender, family race, diagnostic system, twin status, death status, drug dependence (n=8 variables; opioid, cocaine, alcohol, nicotine, cannabis, stimulant, sedative, and other drug), drug abuse (n=7 variables; opioid, cocaine, alcohol, cannabis, stimulant, sedative, and other), and family ID, mother ID, father ID and sex in RUCDR pre-QC plink file.

6 Formulários
Name
Tipo
Description | Question | Decode (Coded Value)
Tipo de dados
Alias
Item Group
pht005839
C3846158 (UMLS CUI [1,1])
Item
NIDA study number
text
C0008976 (UMLS CUI [1,1])
C0237753 (UMLS CUI [1,2])
study
Code List
NIDA study number
CL Item
NIDA Study 17: Opioid Dependence (17)
CL Item
NIDA Study 24: START Pharmacogenetics: Exploratory Genetic Studies in Starting Treatment with Agonist Replacement Therapies (24)
SUBJECT_ID
Item
Subject ID
string
C2348585 (UMLS CUI [1,1])
yob
Item
Year of Birth
text
C2826771 (UMLS CUI [1,1])
Item
Gender
text
C0079399 (UMLS CUI [1,1])
sex
Code List
Gender
CL Item
Male (1)
C0086582 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Female (2)
C0086287 (UMLS CUI [1,1])
Item
Family race
string
C0034510 (UMLS CUI [1,1])
family_race
Code List
Family race
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African_American (African_American)
CL Item
Am_Indian (Am_Indian)
CL Item
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CL Item
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CL Item
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CL Item
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Item
Diagnostic system
string
C0430022 (UMLS CUI [1,1])
dxsys
Code List
Diagnostic system
CL Item
DSM3R (DSM3R)
CL Item
DSM4 (DSM4)
Item
Twin status
string
C0041427 (UMLS CUI [1,1])
C0449438 (UMLS CUI [1,2])
twin
Code List
Twin status
CL Item
dizygotic twin (DZ)
CL Item
monozygotic twin (MZ)
CL Item
twin of unknown zygosity (U)
Item
Death status
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C1306577 (UMLS CUI [1,1])
C0449438 (UMLS CUI [1,2])
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Code List
Death status
CL Item
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Item
Opioid dependence
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Code List
Opioid dependence
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CL Item
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Cocaine dependence
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C0009170 (UMLS CUI [1,1])
C0038580 (UMLS CUI [1,2])
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Code List
Cocaine dependence
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CL Item
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Item
Alcohol dependence
text
C0085762 (UMLS CUI [1,1])
C0038580 (UMLS CUI [1,2])
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Code List
Alcohol dependence
CL Item
no alcohol dependence (0)
CL Item
alcohol dependence (1)
Item
Nicotine dependence
text
C0028043 (UMLS CUI [1,1])
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Code List
Nicotine dependence
CL Item
no nicotine dependence (0)
CL Item
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Item
Cannabis dependence
text
C0006870 (UMLS CUI [1,1])
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Code List
Cannabis dependence
CL Item
no cannabis dependence (0)
CL Item
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Item
Stimulant dependence
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C0304402 (UMLS CUI [1,1])
C0038580 (UMLS CUI [1,2])
stimulant_dep
Code List
Stimulant dependence
CL Item
no stimulant dependence (0)
CL Item
stimulant dependence (1)
Item
Sedative dependence
text
C0038580 (UMLS CUI [1,1])
C0036557 (UMLS CUI [1,2])
sedative_dep
Code List
Sedative dependence
CL Item
no sedative dependence (0)
CL Item
sedative dependence (1)
Item
Other drug dependence
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1510472 (UMLS CUI [1,2])
other_dep
Code List
Other drug dependence
CL Item
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CL Item
other drug dependence (1)
Item
Opioid abuse
text
C0029095 (UMLS CUI [1,1])
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Code List
Opioid abuse
CL Item
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CL Item
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Item
Cocaine abuse
text
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cocaine_abuse
Code List
Cocaine abuse
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CL Item
cocaine abuse (1)
Item
Alcohol abuse
text
C0085762 (UMLS CUI [1,1])
alcohol_abuse
Code List
Alcohol abuse
CL Item
no alcohol abuse (0)
CL Item
alcohol abuse (1)
Item
Cannabis abuse
text
C0006868 (UMLS CUI [1,1])
cannabis_abuse
Code List
Cannabis abuse
CL Item
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CL Item
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Item
Stimulant abuse
text
C0013146 (UMLS CUI [1,1])
C0304402 (UMLS CUI [1,2])
stimulant_abuse
Code List
Stimulant abuse
CL Item
no stimulant abuse (0)
CL Item
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Item
Sedative abuse
text
C0013146 (UMLS CUI [1,1])
C0036557 (UMLS CUI [1,2])
sedative_abuse
Code List
Sedative abuse
CL Item
no sedative abuse (0)
CL Item
sedative abuse (1)
Item
Other abuse
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0013146 (UMLS CUI [1,2])
other_abuse
Code List
Other abuse
CL Item
no other abuse (0)
CL Item
other abuse (1)
FAMILY_ID_RUCDR
Item
Family ID in RUCDR pre-QC plink file
text
C3669174 (UMLS CUI [1,1])
MOTHER_RUCDR
Item
Mother Subject ID in RUCDR pre-QC plink file
text
C3669352 (UMLS CUI [1,1])
C0030761 (UMLS CUI [1,2])
FATHER_RUCDR
Item
Father Subject ID in RUCDR pre-QC plink file
text
C3669177 (UMLS CUI [1,1])
C0030761 (UMLS CUI [1,2])
Item
Sex in RUCDR pre-QC plink file
text
C0079399 (UMLS CUI [1,1])
SEX_RUCDR
Code List
Sex in RUCDR pre-QC plink file
CL Item
Male (1)
C0086582 (UMLS CUI [1,1])
CL Item
Female (2)
C0086287 (UMLS CUI [1,1])
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