Subject Identifier
Item
Subject Identifier
text
C2348585 (UMLS CUI [1])
Centre Number
Item
Centre Number
text
C0600091 (UMLS CUI [1,1])
C0019994 (UMLS CUI [1,2])
Date of Liver Biopsy
Item
Date of Liver Biopsy
date
C0193388 (UMLS CUI [1,1])
C0011008 (UMLS CUI [1,2])
Size of Liver Biopsy
Item
Size of Liver Biopsy
integer
C1299482 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Normal Liver Tissue
Item
[A0] Normal
boolean
C0332441 (UMLS CUI [1,1])
C0023884 (UMLS CUI [1,2])
Acute hepatitis
Item
[A1] Acute hepatitis
boolean
C0267797 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Chronic hepatitis
Item
[A2] Chronic hepatitis
boolean
C0019189 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Cholestatic hepatitis
Item
[A3] Cholestatic hepatitis
boolean
C0149904 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Drug-induced cholestasis
Item
[A4] Drug-induced cholestasis
boolean
C2062350 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Acute viral hepatitis
Item
[A5] Acute viral hepatitis
boolean
C0276622 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Chronic viral hepatitis
Item
[A6] Chronic viral hepatitis
boolean
C0276623 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Drug-induced hepatitis
Item
[A7] Drug-induced hepatitis
boolean
C1262760 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Autoimmune hepatitis
Item
[A8] Autoimmune hepatitis
boolean
C0241910 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Bridging necrosis
Item
[A9] Bridging necrosis
boolean
C0333511 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Submassive hepatic necrosis
Item
[A10] Submassive hepatic necrosis
boolean
C0151798 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Massive hepatic necrosis
Item
[A11] Massive hepatic necrosis
boolean
C0001364 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Steatosis - microvesicular
Item
[A12] Steatosis - microvesicular
boolean
C1850415 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Steatosis - macrovesicular
Item
[A13] Steatosis - macrovesicular
boolean
C1837256 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Steatosis - mixed
Item
[A14] Steatosis - mixed
boolean
C0015695 (UMLS CUI [1,1])
C0205430 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Non-alcoholic steatohepatitis
Item
[A15] Non-alcoholic steatohepatitis
boolean
C3241937 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Alcoholic hepatitis
Item
[A16] Alcoholic hepatitis
boolean
C0019187 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Hepatic granulomas
Item
[A17] Hepatic granulomas
boolean
C0745754 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Sarcoidosis
Item
[A18] Sarcoidosis
boolean
C0744822 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Fibrosis
Item
[A19] Fibrosis
boolean
C0239946 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Cirrhosis
Item
[A20] Cirrhosis
boolean
C0023890 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Primary biliary cirrhosis
Item
[A21] Primary biliary cirrhosis
boolean
C0008312 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Primary sclerosing cholangitis
Item
[A22] Primary sclerosing cholangitis
boolean
C0566602 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Autoimmune overlap syndrome
Item
[A23] Autoimmune overlap syndrome
boolean
C2702837 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Hemochromatosis
Item
[A24] Hemochromatosis
boolean
C0018995 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Alpha-1-antitrypsin deficiency
Item
[A25] Alpha-1-antitrypsin deficiency
boolean
C0221757 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Wilson's disease
Item
[A26] Wilson's disease
boolean
C0019202 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Veno-occlusive disease
Item
[A27] Veno-occlusive disease
boolean
C0948441 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Budd-Chiari syndrome
Item
[A28] Budd-Chiari syndrome
boolean
C0856761 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Neoplasia
Item
[A29] Neoplasia
boolean
C1882062 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Other Final Diagnosis
Item
[A99] Other
boolean
C1546485 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Other Final Diagnosis specification
Item
Other, specify:
text
C0011900 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C2348235 (UMLS CUI [1,3])
Normal Liver Architecture
Item
[B1] normal Liver architecture
boolean
C0023884 (UMLS CUI [1,1])
C0935919 (UMLS CUI [1,2])
C0205307 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Bridging fibrosis
Item
[B2] Bridging fibrosis
boolean
C0334160 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Diffuse fibrosis
Item
[B3] Diffuse fibrosis
boolean
C1265984 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Nodular regenerative hyperplasia
Item
[B4] Nodular regenerative hyperplasia
boolean
C0020510 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Congenital hepatic fibrosis
Item
[B5] Congenital hepatic fibrosis
boolean
C0009714 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Cirrhosis
Item
[B6] Cirrhosis
boolean
C0023890 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Centrilobular congestion
Item
[B7] Centrilobular congestion
boolean
C0267821 (UMLS CUI [1,1])
C0442080 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Endophlebitis
Item
[B8] Endophlebitis
boolean
C0014234 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Veno-occlusive disease
Item
[B9] Veno-occlusive disease
boolean
C0948441 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Canalicular cholestasis
Item
[B10] Canalicular cholestasis
boolean
C3150342 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Apoptosis
Item
[B11] Apoptosis
boolean
C0162638 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Focal (or spotty or mild) hepatocellular necrosis
Item
[B12] Focal (or spotty or mild) hepatocellular necrosis
boolean
C0267800 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Interface hepatitis
Item
[B13] Interface hepatitis (periportal hepatitis or piecemeal necrosis)
boolean
C0333515 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Ischaemic necrosis
Item
[B14] Ischaemic necrosis
boolean
C3887513 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Centrolobular necrosis
Item
[B15] Centrolobular (Zone 3) necrosis
boolean
C3672032 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Focal coagulative necrosis
Item
[B16] Focal coagulative necrosis
boolean
C1522058 (UMLS CUI [1,1])
C0205234 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Centrolobular coagulative necrosis
Item
[B17] Centrolobular (Zone 3) coagulative necrosis
boolean
C1522058 (UMLS CUI [1,1])
C0682619 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Bridging hepatocellular necrosis
Item
[B18] Bridging hepatocellular necrosis
boolean
C1855038 (UMLS CUI [1,1])
C0333511 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Massive or panlobular hepatocellular necrosis
Item
[B19] Massive or panlobular hepatocellular necrosis
boolean
C1855038 (UMLS CUI [1,1])
C0442131 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C0001364 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
Dysplasia
Item
[B20] Dysplasia
boolean
C0334044 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Neoplasia
Item
[B21] Neoplasia
boolean
C1882062 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Other Liver Architecture
Item
[B99] Other
boolean
C0935919 (UMLS CUI [1,1])
C0426686 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Liver Architecture specification
Item
Other, specify:
text
C0935919 (UMLS CUI [1,1])
C0426686 (UMLS CUI [1,2])
C2348235 (UMLS CUI [1,3])
C0205394 (UMLS CUI [1,4])
C0193388 (UMLS CUI [1,5])
Normal Hepatocytes
Item
[C0] Normal Liver Cells or Hepatocytes
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0205307 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Ballooning Liver Cells or Hepatocytes
Item
[C1] Ballooning
boolean
C0333445 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Acidophilic Liver Cells or Hepatocytes
Item
[C2] Acidophilic
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0333931 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Pseudoxanthomatous Liver Cells or Hepatocytes
Item
[C3] Pseudoxanthomatous
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C3277905 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Multinucleated giant hepatocytes
Item
[C4] Multinucleated giant hepatocytes
boolean
C1850414 (UMLS CUI [1,1])
C0227525 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Liver Cells or Hepatocytes
Item
[C99] Other
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Liver Cells or Hepatocytes specification
Item
Other, specify:
text
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C1521902 (UMLS CUI [1,4])
Liver Cell or Hepatocyte No Inclusions
Item
[D0] No Inclusions
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C1512693 (UMLS CUI [1,2])
C1298908 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Macrovesicular steatosis
Item
[D1] Macrovesicular steatosis
boolean
C1837256 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Microvesicular steatosis
Item
[D2] Microvesicular steatosis
boolean
C1850415 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Bile accumulation
Item
[D3] Bile accumulation
boolean
C3686784 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Diastase-resistant, PAS-positive cytoplasmic inclusions
Item
[D4] Diastase-resistant, PAS-positive cytoplasmic inclusions
boolean
C1856311 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Alpha-1-antitrypsin inclusions
Item
[D5] Alpha-1-antitrypsin inclusions
boolean
C0002191 (UMLS CUI [1,1])
C1512693 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Megamitochondria
Item
[D6] Megamitochondria
boolean
C0544931 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Mallory bodies
Item
[D7] Mallory bodies
boolean
C0333744 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Ground Glass inclusions
Item
[D8] "Ground Glass" inclusions
boolean
C0598786 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Lipofuscin pigment
Item
[D9] Lipofuscin pigment
boolean
C0023789 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Hemosiderin granules
Item
[D10] Hemosiderin granules
boolean
C0019113 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Orcein-positive cytoplasmin granules
Item
[D11] Orcein-positive cytoplasmin granules
boolean
C0069596 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Protoporphyrin crystals
Item
[D12] Protoporphyrin crystals (birefringent under polarised light)
boolean
C0033733 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Uroporphyrin crystals
Item
[D13] Uroporphyrin crystals (red fluorescence under ultraviolet light)
boolean
C0042093 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles
Item
[D99] Other
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C1512693 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
C0227525 (UMLS CUI [2,1])
C0205394 (UMLS CUI [2,2])
C0042219 (UMLS CUI [2,3])
C0193388 (UMLS CUI [2,4])
Other Liver Cell or Hepatocyte Inclusions or Vacuoles specification
Item
Other, specify:
text
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C1512693 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
C1521902 (UMLS CUI [1,5])
C0227525 (UMLS CUI [2,1])
C0205394 (UMLS CUI [2,2])
C0042219 (UMLS CUI [2,3])
C0193388 (UMLS CUI [2,4])
C1521902 (UMLS CUI [2,5])
Item
[E0] None
text
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C1749565 (UMLS CUI [1,2])
C0205307 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Hepatocellular mitosis
Item
[E1] Hepatocellular mitosis
boolean
C2697585 (UMLS CUI [1,1])
C0026255 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Binucleated or multinucleated hepatocytes
Item
[E2] Binucleated or multinucleated hepatocytes
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C0333909 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C4054455 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
CMV inclusion bodies
Item
[E3] CMV inclusion bodies
boolean
C0582172 (UMLS CUI [1,1])
C1366904 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
HSV inclusions
Item
[E4] HSV inclusions
boolean
C0319232 (UMLS CUI [1])
Varicella inclusions
Item
[E5] Varicella inclusions
boolean
C0740380 (UMLS CUI [1,1])
C1366904 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities
Item
[E99] Other
boolean
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C1849376 (UMLS CUI [1,2])
C0205394 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Other Hepatocyte or Liver Cell Nuclear Abnormalities specification
Item
Other, specify:
text
C0227525 (UMLS CUI [1,1])
C1849376 (UMLS CUI [1,2])
C0205394 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
C1521902 (UMLS CUI [1,5])
No Liver Infiltrates
Item
[F0] None
boolean
C1400896 (UMLS CUI [1,1])
C1298908 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Liver or Lobular Infiltrates Eosinophils
Item
[F1] Eosinophils
boolean
C0014467 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Liver or Lobular Infiltrates Lymphocytes
Item
[F2] Lymphocytes
boolean
C0024264 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Liver or Lobular Infiltrates Plasma cells
Item
[F3] Plasma cells
boolean
C0032112 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Liver or Lobular Infiltrates Neutrophils
Item
[F4] Neutrophils
boolean
C0027950 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Liver or Lobular Infiltrates Macrophages and proliferating Kupffer cells
Item
[F5] Macrophages and proliferating Kupffer cells
boolean
C0022801 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Liver or Lobular Infiltrates Granulomas
Item
[F6] Granulomas
boolean
C0745754 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Other Liver or Lobular Infiltrates
Item
[F99] Other
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Other Liver or Lobular Infiltrates specification
Item
Other, specify:
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C1400896 (UMLS CUI [1,2])
C0205417 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
C1521902 (UMLS CUI [1,5])
No Portal Tract Inflammation
Item
[G0] None
boolean
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C1298908 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Portal Tract Inflammation Eosinophils
Item
[G1] Eosinophils
boolean
C0014467 (UMLS CUI [1,1])
C3854488 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Portal Tract Inflammation Lymphoid aggregates and/or follicles
Item
[G2] Lymphoid aggregates and/or follicles
boolean
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C0229653 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Portal Tract Inflammation Plasma cells
Item
[G3] Plasma cells
boolean
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C0032112 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Portal Tract Inflammation Neutrophils
Item
[G4] Neutrophils
boolean
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C0027950 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Portal Tract Inflammation Histocytes and macrophages
Item
[G5] Histocytes and macrophages
boolean
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C0024432 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C3854488 (UMLS CUI [2,1])
C0019612 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
Other Portal Tract Inflammation
Item
[G99] Other
boolean
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Portal Tract Inflammation specification
Item
Other, specify:
text
C3854488 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C3845569 (UMLS CUI [1,4])
Normal Bile Ducts
Item
[H0] Normal
boolean
C0005400 (UMLS CUI [1,1])
C0205307 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Proliferation of bile ducts
Item
[H1] Proliferation of bile ducts (bile ductular reaction)
boolean
C0005400 (UMLS CUI [1,1])
C0334094 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Dilation, degeneration or disruption of portal bile ducts
Item
[H2] Dilation, degeneration or disruption of portal bile ducts
boolean
C0005400 (UMLS CUI [1,1])
C0011164 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C1849767 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
C0005400 (UMLS CUI [3,1])
C0332453 (UMLS CUI [3,2])
C0193388 (UMLS CUI [3,3])
Paucity of bile ducts
Item
[H3] Paucity of bile ducts
boolean
C4273160 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Periductal fibrosis
Item
[H4] Periductal fibrosis
boolean
C0016059 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Bile ducts Other
Item
[H99] Other
boolean
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Bile ducts Other specification
Item
Other, specify
text
C0205394 (UMLS CUI [1,1])
C0005400 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C1521902 (UMLS CUI [1,4])
Normal Portal Veins
Item
[I0] Normal
boolean
C0032718 (UMLS CUI [1,1])
C0205307 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Pyelophlebitis
Item
[I1] Pyelophlebitis
boolean
C1405883 (UMLS CUI [1,1])
C0032718 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Thrombosis, sclerosis or occlusion of portal vein
Item
[I2] Thrombosis, sclerosis or occlusion of portal vein
boolean
C0155773 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C0400960 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
C0265029 (UMLS CUI [3,1])
C0193388 (UMLS CUI [3,2])
Neoplastic invasion of portal vein
Item
[I3] Neoplastic invasion of portal vein
boolean
C1709160 (UMLS CUI [1,1])
C1510886 (UMLS CUI [1,2])
C0032718 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Granulomatous compression of portal vein
Item
[I4] Granulomatous compression of portal vein
boolean
C0032718 (UMLS CUI [1,1])
C0439667 (UMLS CUI [1,2])
C0728907 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Portal veins Other
Item
[I99] Other
boolean
C0032718 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
Portal veins Other specification
Item
Other, specify:
text
C0032718 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C1521902 (UMLS CUI [1,3])
No Liver Infections
Item
[J0] Normal
boolean
C1112211 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Leishmaniasis donovani
Item
[J1] Leishmaniasis donovani
boolean
C0023273 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Plasmodium falciparum
Item
[J2] Plasmodium falciparum
boolean
C0032150 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Toxoplasmosis
Item
[J3] Toxoplasmosis
boolean
C0040558 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Cryptococcus neoformans
Item
[J4] Cryptococcus neoformans
boolean
C0010416 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Histoplasma capsulatum
Item
[J5] Histoplasma capsulatum
boolean
C0319941 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Mycobacterium tuberculois
Item
[J6] Mycobacterium tuberculois
boolean
C0026926 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Other mycobacterial species
Item
[J7] Other mycobacterial species
boolean
C0026918 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Liver Infections
Item
[J99] Other
boolean
C1112211 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Liver Infections specification
Item
Other, specify:
text
C1112211 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C2348235 (UMLS CUI [1,4])
No Parasites or Ova
Item
[K0] None
boolean
C0030498 (UMLS CUI [1,1])
C1298908 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C1267673 (UMLS CUI [2,1])
C1298908 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
Schistosome and/or ova
Item
[K1] Schistosome and/or ova
boolean
C0036315 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C4303012 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
Ascaris and/or ova
Item
[K2] Ascaris and/or ova
boolean
C3698183 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C0003954 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
Toxocara and/or ova
Item
[K3] Toxocara and/or ova
boolean
C0040550 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C0040550 (UMLS CUI [2,1])
C1267673 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
Echinococcus cysts
Item
[K4] Echinococcus cysts
boolean
C0013502 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Hepatic capillariasis worms and/or ova
Item
[K5] Hepatic capillariasis worms and/or ova
boolean
C0277202 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C0006896 (UMLS CUI [2,1])
C1267673 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
Other Parasites or Ova
Item
[K99] Other
boolean
C1267673 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C0030498 (UMLS CUI [2,1])
C0205394 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
Other Parasites or Ova specification
Item
Other, specify:
text
C1267673 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C2348235 (UMLS CUI [1,4])
C0030498 (UMLS CUI [2,1])
C0205394 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
C2348235 (UMLS CUI [2,4])
Haematoxylin and eosin
Item
[L1] Haematoxylin and eosin (or H & E)
boolean
C0523207 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Masson
Item
[L2] Masson
boolean
C1294297 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Toluidine blue or Giemsa
Item
[L3] Toluidine blue or Giemsa
boolean
C0523203 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C0017542 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
Prussian blue
Item
[L4] Prussian blue
boolean
C1294004 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Periodic Acidic Schiff with or without diastase
Item
[L5] Periodic Acidic Schiff (PAS), with or without diastase
boolean
C0440048 (UMLS CUI [1,1])
C0596624 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Oil red O
Item
[L6] Oil red O
boolean
C1294000 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Congo red
Item
[L7] Congo red
boolean
C0009742 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Hall's stain
Item
[L8] Hall's stain
boolean
C1720394 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Gridley's stain
Item
[L9] Gridley's stain
boolean
C1293978 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Rhodanine
Item
[L10] Rhodanine (copper)
boolean
C0035486 (UMLS CUI [1,1])
C0009968 (UMLS CUI [1,2])
C0487602 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Rubeanic acid
Item
[L11] Rubeanic acid (copper)
boolean
C0073680 (UMLS CUI [1,1])
C0009968 (UMLS CUI [1,2])
C0487602 (UMLS CUI [1,3])
C0193388 (UMLS CUI [1,4])
Orcein, aldehyde fuchsin or Victoria blue
Item
[L12] Orcein, aldehyde fuchsin or Victoria blue
boolean
C1294001 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
C0491984 (UMLS CUI [2,1])
C0193388 (UMLS CUI [2,2])
C0078232 (UMLS CUI [3,1])
C0487602 (UMLS CUI [3,2])
C0193388 (UMLS CUI [3,3])
Electron microscopy
Item
[L13] Electron microscopy
boolean
C0026019 (UMLS CUI [1,1])
C0193388 (UMLS CUI [1,2])
Hepatitis A immunostains positive
Item
[L14] Hepatitis A immunostains positive
boolean
C0560226 (UMLS CUI [1,1])
C3687908 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Hepatitis B core antigen or hepatitis B surface antibody immunostains positive
Item
[L15] Hepatitis B core antigen or hepatitis B surface antibody immunostains positive
boolean
C0019166 (UMLS CUI [1,1])
C3687908 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C0369334 (UMLS CUI [2,1])
C3687908 (UMLS CUI [2,2])
C0193388 (UMLS CUI [2,3])
Hepatitis D immunostains
Item
[L16] Hepatitis D immunostains
boolean
C0011226 (UMLS CUI [1,1])
C3687908 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other immunostains
Item
[L17] Other immunostains
boolean
C3687908 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained
Item
[L99] Other
boolean
C0487602 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
Other Histologic Staining or Additional Studies Obtained specification
Item
Other, specify:
text
C0487602 (UMLS CUI [1,1])
C0205394 (UMLS CUI [1,2])
C0193388 (UMLS CUI [1,3])
C2348235 (UMLS CUI [1,4])